mercredi 29 avril 2009

Les pères prennent le pouvoir

Pour le développement harmonieux des embryons, il n'y a pas que les mères qui comptent !! Le papa aussi participe activement...On en avait des preuves déja chez certains animaux et notamment les grenouilles et crapauds où le point d'entrée du spermatozoïde dans l'ovocyte lors de la fécondation est crucial pour la mise en place des axes de polarité de l'embryon (antérieur-postérieur et dorsal-ventral). En fait, lors de la fusion avec l'ovocyte le brave spermatozoïde apporte son ADN (matériel génétique) mais aussi un élément protéique appelé centriole et qui contrôle l'orientation de l'oeuf fécondé puis de l'embryon. L'équivalent chez les Mammifères n'existe pas, ou en tout cas pas de manière aussi claire. Néanmoins, en général, c'est le contenu de l'ovocyte qui est déterminant pour le développement de l'embryon et ainsi on trouve beaucoup de gènes dits à effet maternel. Habituellement, les caractères génétiques sont déterminés à la fois par le père et par la mère. Or pour le développement précoce, la mère joue de son avantage et certains de ces caractères génétiques s'expriment lors de la formation de l'ovocyte (où par définition le père ne peut pas participer - c'est totalement déloyal !!). Ainsi, qu'importe le génome du père, c'est la mère qui commande !! Et ce n'est pas que sur des détails : sans un gène à effet maternel appellé Bicoid, l'embryon drosophile finit sans tête : plutot gênant. Or une decouverte vient nuancer cette vision, car on a trouvé un gène à effet paternel : c'est le génome du père qui compte et non celui de la mère ! Cette découverte a été faite chez Arabidopsis thaliana, une plante aussi insiginfiante qu'une drosophile mais qui est (aussi) un modèle très répandu dans les laboratoires. Le gène impliqué s'appèle SSP. Si on croise du pollen (mâle) mutant avec un pistil (femelle) non muté l'embryon dans la graine obtenu est difforme. A l'inverse, si SSP est normal dans le pollen, que le pistil ait un SSP muté ou absent, ça n'a pas d'importance, l'embryon sera normal. En fait, c'est le pollen qui exprime le gène SSP, accumule un ARNmessager de SSP qui se déverse dans l'oosphère (équivalent d'ovocyte) lors de la fécondation et est traduit dans l'oeuf fécondé en protéine où il active une voie de signalisation intracellulaire appellé Yoda (oui, comme le sage gnome vert bondissant de Star Wars).

mardi 10 mars 2009

Nature et Histoire

Je viens de finir un ouvrage du brillantissime Jared Diamond dont j'avais lu et commenté le livre "Effondrement" en Septembre dernier. Le nouvel ouvrage s'appelle "De l"inégalité parmi les sociétés". Une fois de plus, un pur chef-d'oeuvre à la fois extraordinairement érudit et synthétique sur l'histoire mondiale. La question de fond est la suivante : pourquoi ce sont les Européens qui ont envahi les Amériques et non pas l'inverse ? En fait tout s'est joué il y a entre 10 000 et 5 000 ans : la révolution néolithique et la domestication des plantes et des animaux a été la plus efficace dans "Le Croissant fertile" moyen-oriental. Sur les autres continents, le nombre d'espèces domesticables était plus limité. Notamment, en Amérique dès son arrivée via le détroit de Béring, l'Homme a exterminé tous les Mammifères dominants les écosystèmes ne laissant que le lama à domestiquer (le bison n'étant pas domesticable...). Notablement, l'Homme a éradiqué de ce continent les chevaux, ce qui bien sur a des conséquences dramatiques des millénaires plus tard quand on sait que les chevaux espagnols ont terrifié les peuples amérindiens. Le continent eurasien par sa configuration est-ouest et ses faibles obstacles géographiques a favorisé les échanges technologiques, commerciaux et culturels entre les peuples, ce qui n'est pas le cas en Amérique (configuration Nord-Sud donc forte zonation climatique et isthme étroits, Cordillières des Andes...): les Aztèques et les Incas s'gnoraient complètement alors qu'ils sont moins éloignés que l'Italie de Marco Polo et les Chinois...Enfin, la domestication massive a abouti à la transmission de nombreuses maladies des animaux aux hommes et c'est par ces germes (variole, etc...) que les Européens ont surtout conquis les empires aztèques et incas car ces peuples étaient très peu immunisés contre de tels fléaux. Cela a permis de conquérir des empires fortement peuplés et organisés avec un nombre ridiculement bas de "conquistadors" (à peine quelques centaines). C'est l'un des traités les plus anti-racistes qui soit : la supériorité eurasienne n'est pas génétique mais tient à leur environnement favorisé, à une succession de circonstances qui leur ont donné de multiples avantages. Une preuve de plus que l'histoire humaine est très dépendante des conditions naturelles géographiques et biologiques...

mardi 3 mars 2009

Attention le retour

Il semblerait aux dernières nouvelles que Michael Jackson prévoit une série de concert à Londres cet été. Espérons que tout se passera bien...Je me suis amusé à collectionner les quelques vidéos sur les "incidents" ou "surprises" qui ont émaillé ses dernières tournées (cliquer sur les liens pour voir les vidéos) : d'abord la scène doit être impeccablement propre, ensuite il ne faut pas se casser la figure en se penchant en avant dans "Smooth criminal" (à 1 min 3 sec), éviter qu'un spectateur complètement inconscient ne monte sur la grue élévatrice pendant "Earth Song" (à partir de 4 min 50) (remarquez comment Michael essaie de l'agripper à la barre de protection pour éviter qu'il ne tombe et aussi le joli "comité d'accueil" qui l'attend à 6 min 30), éviter que la grue ne se crashe toujours pendant "Earth Song" comme à Munich en 1999 (voir vers 5 min 50), éviter de se faire fêter son anniversaire sur scène quand on déteste les anniversaires comme MJ.

vendredi 27 février 2009

Le singe, le mille-patte et le moustique


Encore une histoire comme seule la nature sait l'inventer, cette fois-ci sur les singes capucins d'Amérique du Sud. Ces singes ont la particularité de se frotter le corps avec une espèce de mille-patte bien particulière Orthoporus dorsivittatus. Des chercheurs américains (Weldon et al, 2003) ont montré que ce comportement permet aux singes de s'enduire avec les sécrétions de ces charmantes bêtes qui sont bourées de benzoquinones. Ces molécules ont la propriété de repousser les moustiques et d'inhiber leur réflexe de piqure si magré tout ils se posent. Donc les singes trouvent leur lotion anti-moustique dans leur environnement ! De manière intéressante, les chercheurs ont montré que le comportement de badigeonnage du corps est induit par les mêmes molécules benzoquinoniques que celles qui repoussent les moustiques. Ainsi, si on donne aux singes des tissus imprégnées de ces molécules, ils se frottent le corps avec ce qui montre bien qu'ils ne reconnaissent pas en tant que tel le mille-patte.

mardi 10 février 2009

Manifestation des enseignants et des chercheurs

Je viens de participer à la manifestation en faveur de l'université et de la recherche qui a eu lieu à Paris entre Luxembourg et Invalides (on était sensé aller jusqu'à l'Assemblée Nationale mais ça a été bloqué par une bande de CRS (genre Uruk-Hais du Seigneur des Anneaux), ce qui me fait penser qu'entre les CRS et le CNRS il y a de la N).
Les réformes du gouvernement Sarkozy (sic) dans ce domaine suivent la même logique et la même erreur que les réformes hospitalières, les réformes de la justice, les réformes de la SNCF, de la Poste...etc.... Il s'agit d'appliquer à un service public les principes et le management d'une entreprise privée. Il s'agit d'être rentable, avec un retour sur investissement "à court terme". Le tout sous le contrôle de l'"élite" politico-économico-médiatique qui régne de manière totalitaire sur le monde (le totalitarisme c'est réduire la complexité du monde à une idée; le communisme c'était "surtout pas l'individu tout dans le collectif", le nazisme c'était "notre race, c'est la meilleure" et actuellement c'est "l'argent, il n'y a que ça d'important" ; nous vivons bien dans un régime totalitaire). Pour la recherche et l'université, il s'agit de produire avec le plus bas cout possible des brevets (et non plus des connaissances...) et des étudiants corvéables sur un marché du travail dégradé. Dans le cas de la réforme dite de "masterisation" de la formation des enseignants, il s'agit de produire des légions d'étudiants qui n'auront ni le concours du CAPES et de l'Agrégation et qui pourront être embauchés sur emplois précaires dans l'Education Nationale, remettant en cause le statut de fonctionnaires des professionels de l'enseignement. La "réforme" du statut de décret des enseignants-chercheurs aboutit à créer une concurrence et une compétition entre les enseignants-chercheurs d'une même université. Or rien de plus classique pour rendre les gens dociles et corvéables que de créer une course à l'échalote avec dans le rôle de l'arbitre un valet obligé de l'Etat. C'est une méthode de contrôle, une reprise en main administrative de la liberté de chercher et d'enseigner.
Le tout dans un contexte de régression sans précédent des moyens en postes. Or la recherche est encore un travail de main-d'oeuvre. Quand, faute de personnel technique suffisant, je suis obligé de faire des mini-preps ou des génotypages que pourrait faire un technicien payé 30% moins cher que moi, l'Etat a par ailleurs une gestion desastreuse. Pour l'enseignement, on ne compte plus les heures supplémentaires non payées.
Le tout sous les insultes du petit empereur, dont les discours, si ils étaient évalués comme pour une publication scientifique, seraient rejetés tellement ils accumulent d'erreurs factuelles, d'oublis, de caricature, de mauvaise foi. Bien sur, il y a des enseignants-chercheurs qui se la coulent douce et ne remplissent pas sérieusement toutes leurs missions (comme dans tous les métiers; regardez par exemple Valérie Pécresse, conseillère régionale d'Ile de France, qui n'a siégé dans ce conseil qu'un nombre très restreint de fois....); repérons ces 2-3 %, VIRONS-LES (je n'ai aucun soucis avec le fait qu'on puisse renvoyer un fonctionnaire si manifestement il ne fait pas un minimum correctement son travail), mais ne créons pas un système qui pénalise les 97% restants qui font sincèrement des efforts, qui ont été recrutés lors d'un concours ultra-sélectif, qui sont déja évalués dès qu'ils veulent publier, obtenir une bourse pour leurs étudiants, obtenir de l'argent pour un projet, monter en grade, muter dans une autre université, monter un nouveau labo, acheter des équipements lourds....etc....
Bref, c'était bon d'aller manifester si nombreux aujourd'hui !

samedi 17 janvier 2009

Le meurtrier de Tycho Brahé


J'avais lu pendant les dernières vacances une biographie romancée de l'astronome Tycho Brahé et de Kepler ("La discorde céleste" de Jean-Pierre Luminet), mais je ne me doutais pas que le livre deviendrait si vite obsolète et que la réalité allait dépasser cette biographie. En effet, les circonstances de la mort de Brahé en 1601 à Prague sont éclaircis et il aurait été assassiné au mercure comme le rapporte "Der Spiegel". Tycho Brahé est d'origine danoise et il batit sa réputation de plus grand astronome de son temps (détroné ensuite par Galilée) sur la qualité et la précision de ses instruments d'observation. Mais il avait du mal à imaginer un système pour rendre compte de ses observations et c'est finalement Johannes Kepler qui utilisa les données que Brahé avait accumulé pour définitivement faire triompher l'héliocentrisme que Copernic avait envisagé quelques années plus tot et trouver les figures géométriques qui régissent le mouvement des planètes (ce qui fut une étape décisive vers la théorie de la gravité universelle de Newton).
La version classique de la mort de Brahé raconte que durant un banquet il avait tellement bu sans pouvoir aller aux "toilettes" de l'époque que sa vessie fut irrémédiablement fissurée, ce qui provoqua un épanchement d'urine dans l'abdomen. Dans les années 1990 des doses très importantes de mercure ont été trouvées dans les poils de ses moustaches conservées dans un musée à Prague. Néanmoins, Brahé s'adonnait à l'alchimie (comme beaucoup de savants à la cour de Rodolphe II à Prague) et le mercure aurait pu provenir de ces activités. Actuellement, les restes du corps de Brahé conservé dans la crypte d'une cathédrale de Prague sont analysés. La véritable nouveauté vient de l'analyse d'un journal intime trouvé dans des archives à Stockholm. Ce journal a été tenu par un des cousins éloigné de Brahé (Erich) et présente des indices troublants permettant d'imaginer que c'est lui l'assassin au mercure. Le meurtre aurait été commandité par le roi du Danemark de l'époque, Christian IV, dont Brahé, très bon vivant, était peut-être le père... (une histoire d'ailleurs habilement maquillée par Shakespeare dans Hamlet). Par ailleurs, Brahé s'était fait beaucoup d'ennemi à la cour du Danemark (d'où son hébergement par Rodolphe II à Prague) : au cour d'un duel il avait d'ailleurs perdu son nez qu'il avait remplacé par une postiche en métal (voir photo). Voila, c'était ma contribution à l'année de l'astronomie !

mardi 6 janvier 2009

Spiderman en Moravie


La Moravie du Sud en République Tchèque ne me paraissait pas une région cachant des créatures mystérieuses et dangereuses. Pourtant, c'est dans cette région (dont la principale ville est la très provinciale Brno (là où vivait Mendel)), qu'a été découvert en 2008 une nouvelle espèce d'araignée venimeuse baptisée fièrement Eresus moravicus. La "morsure" de cette araignée n'est pas mortelle mais provoque céphalée et fièvre pendant quelques heures. On connait actuellement 75 000 espèces d'Arachnides dans le monde (soit 30 000 espèces de plus que tout les Vertébrés réunis). Divers estimations montrent que 90% des espèces d'Arachnides sont encore à découvrir (tant qu'elles n'ont pas été éradiquées par l'extinction massive qui a lieu actuellement du fait des activités humaines). La plupart de ces espèces se cachent tapies dans des régions reculées (équatoriales notamment) où la moindre expédition permet d'en trouver de nouvelles. La découverte d'une nouvelle espèce d'Arachnide, qui plus est empoisonnée pour l'Homme, est quand même un évènement rare sous nos latitudes, d'autant plus que coté coloration, cette araignée n'était pas vraiment discrète !! (voir photo).

dimanche 21 décembre 2008

Harry Potter, Bilbo, Walkyrie et Pi

Petit point sur l'actualité des films que l'on attend avec impatience. Tout d'abord le sixième "Harry potter" (et le Prince de Sang Mêlé) est déja fini depuis quelques mois mais ne sortira que mi-Juillet 2009 parceque ça arrangait mieux la production (Warner Bros) !! Sympa...
Pour "Bilbo Le Hobbit" la préquel de la trilogie du Seigneur des Anneaux, la sortie est prévue en 2011. Le réalisateur sera bien Guillermo Del Toro, le réalisateur du "Labyrinthe de Pan" et la production/design artistique reviendra à l'équipe de Peter Jackson, assurant la continuité avec la trilogie (désolé, Nicolas...). C'est finalement une excellente combinaison : du sang neuf mais sous le regard du maitre. Les acteurs du Seigneur des anneaux ont déja accepté de revenir (Ian McKellen (Gandalf), Hugo Weaving (Elrond)...), y compris Ian Holm qui jouait Bilbo dans la trilogie mais bien sur les séquences avec Bilbo (plus) jeune demanderont un autre acteur. L'histoire de Bilbo le Hobbit ne tiendra que sur un film et pas deux comme annoncé précedemment. Le deuxième film qui sera produit simultanément fera le lien entre "Bilbo" et le seigneur des anneaux racontant ce qu'il se passe entre les deux livres d'après les annexes et les écrits de Tolkien. On y verra notamment Saruman commencer à tomber du côté obscur au dernier "White Council", Aragorn guerroyer pour Rohan et Gondor sous le nom de Thorongil, notamment remportant une bataille contre les pirates d'Umbar (qui s'allieront à Sauron). Il y a aussi toute l'histoire de la chute du royaume de Balin dans les mines de la Moria qui pourra être racontée. Que du bonheur...
Plus proche, le film sur "L'opération Walkyrie" qui sortira fin Janvier et que j'irai voir malgré la présence de Tom Cruise (scientologue...) dans le film (cela dit je n'arrête pas de clamer qu'une religion est une secte qui a réussi...). Il s'agit de l'histoire du complot allemand qui a manqué de très peu d'assassiner Hitler en Juillet 1944. C'est un des moments où l'histoire du XXème siècle a tenu (presque littéralement ici) à un fil...J'avais eu connaissance de ce complot lorsque j'ai lu l'année dernière l'inégal "A la recherche de Klingsor" de Jorge Volpi où il est présenté dans un des méandres de l'intrigue (qui traite également de comment le Reich est passé à côté de la bombe atomique...).
Enfin, il y a un projet d'adaptation d'un des livres les plus extraordinaires que j'ai lu : "The life of Pi" de Yann Martel dont j'ai déja parlé avec Jean-Pierre Jeunet à la réalisation (Amélie Poulain, Delicatessen, La cité des enfants perdus...). Il fallait bien lui pour s'attaquer à ce livre que je pensais inadaptable...

mercredi 10 décembre 2008

Ca chauffe pour Coldplay

Une affaire de plagiat touche l'un des groupes que j'ai "découvert" récemment : Coldplay. C'est la chanson "The scientist" qui a attiré initialement mon attention (évidemment...vu le titre) et dont le clip est très bien fait. J'ai petit à petit découvert les autres titres, notamment "Clocks", qui sont en général magnifiques, subtilement arrangés et très agréables à écouter. La chanson incriminée dans le plagiat est "Viva la vida" qui est un vrai petit chef-d'oeuvre extrait de leur dernier album. C'est un guitariste, Joe Satrani, qui a porté plainte. L'un de ses morceaux a un refrain qui ressemble effectivement à celui de Coldplay. Etre juge dans ce genre d'affaire est assez difficile. Je pense que les compositeurs de Coldplay ont suffisamment de talent pour ne pas avoir à piquer intentionnellement des mélodies. De plus, on peut très bien imaginer qu'avec des mélodies pop somme toute assez simples, deux artistes peuvent très bien parvenir indépendemment à des résultats similaires, un peu comme en Evolution pour les convergences évolutives où deux groupes d'animaux par exemple ont des structures similaires alors qu'elles ne sont pas héritées d'ancêtres communs (par exemple les pattes postérieures repliées en Z de la sauterelle et de la grenouille). Et même si les auteurs de Coldplay ont déja entendu cette mélodie, ils en ont fait une oeuvre infiniment plus intéressante que le morceau besogneux de Satrani.

jeudi 4 décembre 2008

Orbival : le tracé f(l)ou


Orbival est le principal projet de métro en rocade qui permettrait, en tout cas dans sa version initiale, de soulager les lignes A, B, C et D du RER à l'Est et au Sud en permettant de passer de l'Est de l'Ile de France au Sud sans passer par Paris.
Le tracé prévu jusqu'à présent était logique : de Val de Fontenay (l'une des stations les plus fréquentées de l'Ile de France, noeud entre la ligne RER A et E, désservant un quartier d'affaires et une grande cité-dortoir + last but not least à 10 minutes à pied de chez moi !!) jusqu'à Arcueil-Cachan ou Bourg-La-Reine selon les versions, bref vers la branche sud du RER B.
Voila comment le projet a été présenté et "vendu" aux habitants du Val-de-Marne qui ont massivement approuvé le projet sur ce tracé. Reste à trouver le financement (mais 2-3 milliards d'Euros pour un projet aussi utile devraient se trouver sans problème...avec des élus et un gouvernement responsables...D'accord c'est pas gagné !!).
La surprise est venue d'une innocente réunion de quartier, hier, où j'ai posé quelques questions au maire de Nogent-sur-Marne, Jacques JP Martin (UMP), sur la position possible d'une station d'Orbival sur le territoire de la commune. Et bien le tracé présenté jusqu'à présent sera peut-être remanié ! Plus de passage à Val-de-Fontenay (sous le prétexte inédit que "trop de correspondances" sur une même station c'est pas bien...) et à la place un tracé qui relierait l'Université de Marne-La-Vallée à l'Université de Créteil puis sans doute vers...l'aéroport d'Orly ! Fini la correspondance avec le RER B donc.
Les deux Universités seraient reliées pour faire plaisir à la ministre Valérie Pécresse (UMP) qui veut fusionner les deux Universités (d'où l'intérêt d'avoir un métro reliant les deux pour que les étudiants puissent être transportés de l'un à l'autre des sites). Donc non seulement Pécresse met un capharnaum pas possible dans les Universités et les instances de Recherche actuellement mais en plus elle vient torpiller un excellent tracé de métro. Pécresse est la future candidate de l'UMP pour les Régionales de 2010, ça promet...Le choix d'aller vers Orly est sans doute dicté (c'est mon interprétation) par le fait que ça va permettre d'ouvrir plus facilement des partenariats de financement avec le privé (vous pensez bien, faire un métro pour la plèbe de la petite couronne parisienne ça n'intéresse personne). Cela dit, Orly est actuellement mal desservi côté transport en commun, c'est vrai...
Le "nouveau" tracé est complètement bizarre et la transversale intiale deviendrait en fait une bi-radiale en forme de V ou de U centrée sur Créteil.
Le drame c'est qu'il faudrait en fait construire les deux tracés car chacun des tracés a son intérêt même si ma préférence va au tracé initial qui privilégie des zones d'habitations denses de la petite couronne.

mardi 25 novembre 2008

Mettez un calmar dans votre moteur !


On ne trouve pas/plus de pétrole mais au moins on a des calmars géants !

Un submersible automatisé (de la compagnie pétrolière Shell) a filmé par
hasard à 2500 m de profondeur ce calmar très rare, apparemment du genre
Magnapinna (voir http://en.wikipedia.org/wiki/Magnapinna )
Ces calmars sont caractérisés par de très longs tentacules (jusqu'à 15 à
20 fois la longueur du reste du corps), qui sont capables de faire une sorte de
coude à 90°, très visible sur la vidéo. La longueur de tous les
tentacules semble être la même, ce qui n'est pas habituel dans ce groupe
(il y a toujours deux tentacules plus longs repliés au repos qui se
projettent brusquement vers les proies). Je serai très curieux de voir
ce que ça donne quand ils attrapent une proie. Mon feeling c'est que nos
amis Magnapinna font de la pure pêche à la ligne, étendent paresseusement leurs longs
tentacules et attendant patiemment qu'une proie s'y accroche, un peu
comme des méduses.
En tout cas, si les bénéfices mirobolants de nos amies les compagnies pétrolières peuvent servir à faire avancer la science zoologique, je suis d'accord. Néanmoins, c'est un peu "regardez la belle nature...avant qu'on ne vous la détruise !".

dimanche 23 novembre 2008

Michael Jackson invente la "cash cow" (la vache à billets)

Diverses vidéos sont apparus sur Internet avec des extraits de dépositions de Michael Jackson pour ses différents procès. Avec des morceaux d'anthologie : le meilleur est vers la fin de cette vidéo (lien) dont je retranscris ici le dialogue traduit en français:

Juge : Comment obteniez-vous de l'argent liquide (du cash) en 2003 ?
Michael : Facilement, mais je ne voulais pas aller à la banque. Je l'obtenais à Neverland (note : sa propriété)
Juge : Comment faisiez-vous ?
Michael : Je l'obtenais avec les vaches...sur la propriété.
Juge : Mais je vous parle de billets verts, de dollars
Michael : Oui, c'est ça des billets...
Juge (hésitant) : Donc cela...venait des...vaches ??
Michael : Oui, en fait nous avions des vaches sur la propriété qui appartiennent à des fermiers voisins. On leur louait l'espace...Je n'aime pas aborder ce sujet. (note : sans doute des sous pas déclarés au fisc...Parceque c'est Michael on lui pardonne)
Juge : Donc tout l'argent que vous utilisez pour le shopping vient des vaches ?
Michael : Eh oui...aussi incroyable que cela puisse paraitre...

Autre moment rigolo où on se rend compte que Michael sait jouer le naïf pour éluder les questions embarrassantes :

Juge : Est-ce que vous l'avez payé pour ce qu'il a fait ? (note : un collaborateur que Michael a fait travailler sur un projet qui est finalement tombé à l'eau)
Michael : Je ne sais pas..mais je suis sur qu'il a été payé...
Juge : Pourquoi en êtes-vous sur ?
Michael : Parcequ'il semblait toujours content...
Juge : Mais l'argent ne fait pas le bonheur...
Michael : Oui, mais là il avait toujours un grand sourire !

Autre vidéo datant de 1993 (lien) pour un procès pour plagiat sur la chanson "The girl is mine" (procès que Michael a évidemment gagné.....). Michael n'hésite pas une seule seconde à reconstituer toute la rythmique avec sa bouche ("beat box") et à chanter une partie a capella ce qui énerve visiblement les avocats de la partie adverse (on entend dans le fond "objection ! objection !").

vendredi 7 novembre 2008

Bonnes et mauvaises graisses

"Gros moi ? Je suis juste bien musclé !". Ca pourrait être avec un peu de mauvaise foi une réponse classique d'Obélix aux remarques désobligeantes dont il fait régulièrement l'objet. Des chercheurs (Seale etal. dans un Nature d'Aout 2008) ont montré que la réponse d'Obélix n'est pas si idiote...
Il existe deux types de tissu adipeux (qui contiennent beaucoup de graisse) : le tissu adipeux blanc et le tissu adipeux brun. Le tissu adipeux blanc est purement un tissu de stockage des réserves lipidiques constituées de cellules rendues obèses par une énorme goutte lipidique qui prend un large volume de leur cytoplasme. Le tissu adipeux brun est constitué également de cellules riches en lipides mais sa fonction est différente. Les cellules de ce tissu contiennent des mitochondries (sorte de centrale nucléaire cellulaire qui produit de l'énergie en déplaçant des protons...si, si) particulières qui produisent de la chaleur. Le tissu adipeux brun est très important chez les Mammifères hibernants qui doivent revenir à leur 37-39°C habituels après une hibernation où leur température corporelle peut descendre jusqu'à 10°C. Les nouveaux-nés des Primates (dont nous) ont transitoirement du tissu adipeux brun (entre les omoplates) ce qui permet de faciliter la transition entre le bain thermostaté à 37°C de maman et le monde atmosphérique froid et hostile. Les chercheurs ont montré que ces deux tissus adipeux n'ont pas du tout la même origine chez l'embryon puisque les cellules du tissu adipeux brun sont des dérivés...de précurseurs de cellules musculaires !! Ce qui n'est pas du tout le cas des cellules du tissu adipeux blanc qui ont une origine complètement différente. De manière amusante, remarquons que les muscles ont aussi un rôle dans la thermogénèse, via le frisson thermique, qui crée de la chaleur mais sans utiliser directement les mitochondries.

mercredi 29 octobre 2008

Du dopage dans le "Spore"

Je m'en doutais un peu et je l'attendais...Le jeu vidéo "Spore" qui a été mentionné plusieurs fois ici ne fait pas plaisir à la communauté scientifique, surtout lorsqu'il essaie de trop se prendre au sérieux. Le concept du jeu avait suscité à la fois un certain enthousiasme (enfin un jeu basé en partie sur la biologie et sa théorie la plus importante, la théorie darwinienne de l'Evolution) mais aussi une certaine inquiétude (le grand public, complètement ignare en science, allait prendre les quelques simplifications nécessaires pour faire fonctionner le jeu comme "argent comptant" et l'appliquer au monde réel). Comme je l'ai déja évoqué, le jeu est décevant du point de vue de la "modélisation scientifique" même si il est plaisant à jouer. Ca aurait pu s'arrêter là mais le marketing, finalement assez agressif autour de ce jeu, a dépassé récemment les limites acceptables. En effet, un documentaire visiblement produit sur commande par la chaine du National Geographic, a fait participer d'éminents chercheurs américains dans le domaine de l'Evolution. Ce documentaire avait pour but la promotion de "Spore". Or les chercheurs n'étaient pas au courant et pensaient qu'il s'agissait d'un documentaire très sérieux sur l'évolution. Sans le savoir, ils apportent donc une "illusion" de caution scientifique sérieuse au jeu, qu'il ne mérite sans doute pas (malheureusement).
Il y a aussi dans le dernier Science, un article intéressant qui analyse ce que pensent vraiment les scientifiques à propos de ce jeu.

mardi 21 octobre 2008

Duos gagnants "chanson + film"

J'aime beaucoup certains clipvidéos faits maison produits par les internautes. Très souvent, ils combinent les images d'un film avec une musique et ça donne de véritables oeuvres à part entière. Il suffit de trouver les bons couples "film-chanson" et de monter le tout avec gout c'est-à-dire être à la fois sensible aux intonations musicales et à l'oeuvre cinématographique pour entrelacer deux univers qui se rencontrent pour la première fois.
Evidemment, mes clips préférés sont ceux qui associent une chanson et un film que j'adore tout deux et que je considérais jusqu'à présent comme deux entités complètement séparées.
Mes deux clips préférés du moment sont :
"My immortal" du groupe Evanescence sur les images du magnifissime film de Coppola sorti en 1992 "Dracula". Pour le voir, suivre le lien. Remarquons l'humour du réalisateur du clip pour le choix des images sur la phrase de la chanson "This pain is just too real"...
et "Desert Rose" de Sting et Cheb Mami sur les images de la série brillantissime "Dune". Voici le lien
Incidemment, le dernier clip est assez troublant car l'acteur qui joue Paul Atréide ressemble beaucoup à Sting. Et la aussi des rapprochements très intéressants : notamment le passage de la chanson "No sweet perfume ever tortured me more than this" sur une image des vers des sables qui sentent l'Epice dans le monde de Dune. Tout cela démontre une grande connaissance des oeuvres.

jeudi 9 octobre 2008

Un nobel technicolor


Saluons le prix de Nobel de chimie (en fait le prix Nobel de biochimie de manière récurrente ces dernières années) sur la GFP. La GFP est une protéine initialement découverte chez la méduse Aequorea victoria qui émet de la lumière verte lorsqu'elle est excitée par une lumière bleue. Cette bioluminescence dans la nature permet sans doute à la méduse d'attirer ses proies. La protéine a été purifiée dans les années 70 mais ce n'est que vers le milieu des années 90 que son intérêt pour la biologie cellulaire a été compris. En effet, on dispose avec elle d'une protéine pas trop grosse et bien compacte qui est aisément repérable sous une lumière bleue. Ainsi on peut par exemple produire une protéine chimérique couplée à la GFP et on peut savoir très facilement où cette protéine se trouve dans la cellule. Et en plus, on peut le faire dans des cellules vivantes, donc on peut voir bouger des structures contenant cette protéine dans la cellule en direct live. Des dérivés de la GFP et d'autres molécules fluorescentes sont maintenant couramment utilisés permettant de réaliser un véritable arc-en-ciel dans le vivant (dont j'ai déja donné un exemple ici).

samedi 4 octobre 2008

Palin fait un Bide(n)

J'ai regardé la plus grande partie du débat des colistiers des élections présidentielles US : Biden contre Palin. Débat organisé dans une Université et présenté par une présentatrice noire, deux choses par ailleurs inimaginables en France. Il est évident que mon regard n'est pas vraiment objectif, vu que je suis clairement pro-démocrate et que les républicains US constituent l'un des gangs les plus toxiques de la planète, même si il peut y avoir de bonnes surprises (finalement Schwarzenegger en Californie n'est pas si mauvais...). Sans misogynie aucune, la prestation de Palin rappelle les pires prestations de Ségolène Royal pendant notre campagne, notamment pendant le débat face à Sarko où elle fut très mauvaise. On sent les phrases-slogans apprises par coeur, la fausse proximité avec le peuple. Sur le fond, les débats US sont assez exotiques par rapport aux débats politiques français. Par exemple, les débatteurs n'arrêtent pas de s'envoyer dans la figure les statistiques des votes aux Congrès ou au Sénat : par exemple Palin insiste que Obama a voté 94 fois contre des baisses d'impots (note : les baisses d'impots pour les plus riches...) au Sénat, ou va même lui reprocher qu'il a voté à 96% comme le reste de son parti ! Palin répond régulièrement à coté de la plaque notamment sur l'économie où Biden l'enfonce facilement sur les éternelles volontés dérégulatrices du parti Républicain. Palin défend McCain en rappellant que celui-ci a voté en faveur de régulations...contre l'industrie du tabac (encore heureux !)
Quand Obama propose de donner une Sécurité Sociale à tous les américains, elle répond que l'on ne va tout de même pas laisser l'Etat et le gouvernement à Washington décider de quels médicaments prendre quand on est malade (oui, vous savez le grand méchant Etat bolchévique avec un couteau entre les dents). Mieux vaut bien entendu que ce soit les compagnies privées dénoncées brillamment par Michael Moore dans "Sicko"....
Coté climat et énergie, elle trépigne d'impatience de forer le sol américain pour récupérer les pétrole domestique quand Biden lui rappelle gentiment qu'au mieux il y a 3% de réserves mondiales de pétrole aux US qui consomment 20% de la production mondiale actuelle et que ça n'allait pas changer grand'chose à la donne sur le long terme. Pour les dérèglements climatiques, elle ne peut s'empêcher de signaler que le climat subit des cycles naturels, ce qui est techniquement vrai sauf que le réchauffement actuel n'a rien de naturel (le CO2 produit de l'effet de serre; l'effet de serre réchauffe la planète; l'humanité dégage des quantités gigantesques de CO2 depuis la révolution industrielle que ne peuvent absorber en totalité les puits habituels (océan, végétaux...); donc l'humanité réchauffe la planète; c'est aussi simple qu'une équation chimique) et aucun cycle "naturel" n'est prévu actuellement de réchauffer la planète. Mais venant de quelqu'un qui a soutenu il y a quelques années que les dinosaures et les hommes se sont cotoyés sur la planète il y a 6000 ans, il ne faut pas s'étonner que la science donc la vie réelle, ça n'est pas son problème (d'ailleurs dans un des derniers magazine Science, Obama a accepté de répondre à une interview et pas McCain, cela veut tout dire...).

Quelques extraits du débat : extrait 1, extrait 2

samedi 20 septembre 2008

Collapse

Je viens de lire l'un des essais les plus intéressants parus ces dernières années : "Collapse" (soit "Effondrement") de Jared Diamond. C'est assez inclassable, étant un subtil mélange d'archéologie scientifique, d'histoire, de géographie et de sociologie. Il s'agit de trouver les différents facteurs qui permettent d'expliquer l'effondrement et la disparition de civilisations. Parmi ces facteurs, les facteurs environnementaux sont assez souvent présents et quelquefois déterminants (de notables exceptions sont par exemple l'effondrement de l'Empire Romain (d'Occident puis d'Orient) ou la destruction de Carthage (purement militaire)).
Les principaux exemples détaillés de civilisations qui se sont autodétruites sont la civilisation de l'Ile de Paques, les Anasazis (un ensemble de tribus sur le territoire actuel du sud-ouest des USA), les Mayas, les Vikings au Groenland. Très souvent, l'effondrement a suivi de quelques dizaines d'années seulement l'apogée de la civilisation notamment sur l'Ile de Paques et les Mayas et donc l'effondrement peut être qualifié de brutal même si les mécanismes étaient à l'ouvre depuis longtemps (déforestation et surexploitation agricole créant l'érosion des sols notamment...). Diamond traite aussi de cas de quasi-effondrement de société comme le Rwanda au moment du génocide de 1994 dont un des facteurs est la surpopulation et le manque de terres agricoles : de nombreux membres de la population civile ont massacré leurs voisins (sous le prétexte idiot qu'ils ne sont pas de la même ethnie) surtout pour récupérer leurs terres pour survivre.
Diamond traite aussi de quelques succès : des civilisations qui ont survécu des siècles malgré des conditions géographiques difficiles comme par exemple les Islandais et les Japonais. Le chapitre le plus intéressant concerne les tentatives d'explication des comportements suicidaires des civilisations, c'est-à-dire comprendre ce qui se passe dans la tête des habitants de l'ile de Paques qui abattent le dernier arbre de l'ile. Ignorance, déni de réalité, aveuglement, égoïsme ("de toute manière quelqu'un mangera le dernier thon rouge pêché en Méditerrannée alors autant que cela soit moi"), incapacité à s'adapter (typiquement les Vikings du Groenland arque-bouté sur leurs traditions et incapables d'adopter les usages des Inuits, pourtant voisins, qui seront méprisés par les Vikings mais qui leur survivront). Diamond souligne que les castes les plus riches de ces civilisations n'ont gagné que le droit de mourir de faim en dernier.
Le dernier chapitre pointe évidemment le fait que la quasi-totalité des facteurs qui ont de multiples fois abouti à l'effondrement localisé de civilisations sont actuellement à l'oeuvre, mais à l'échelle mondiale.

jeudi 11 septembre 2008

La dissémination de Spore

Le jeu vidéo "Spore", attendu depuis des années et dont j'avais déja parlé ici , est sorti. Je l'ai acheté et joué jusqu'à la phase "civilisation" (en gros les 3/4 du jeu). J'en suis très content mais pas pour les raisons que j'attendais. En fait, l'aspect "évolution" du jeu est assez limité et les changements réalisés sur les créatures au fur et à mesure que l'on accumule des points ADN sont quelquefois purement esthétiques et n'ont quelquefois pas d'incidences majeures (l'auteur du jeu serait-il acquis à la théorie neutraliste de l'évolution ???). Néanmoins, quelques aspects peuvent être importants par exemple le développement du vol qui, pour ma petite créature herbivore, a permis d'accéder aux fruits perchés sur les arbres et non plus seulement les fruits dans les buissons ou les fruits tombés. Néanmoins, la réalisme du jeu retombe quand, pour gagner des points ADN, ma créature doit affronter d'autres créatures et les tuer. J'ai essayé de manger mes victimes mais ma créature herbivore a vomi (les développeurs ont pensé à tout...). On peut aussi gagner des points ADN en impressionnant d'autres espèces par diverses aptitudes (charme, danse...). Et c'est là où le jeu excelle, c'est qu'il est vraiment drôle. L'animation des créatures est très réussie, avec pleins de mimiques comiques. Ca ne se prend pas du tout au sérieux et on passe un bon moment. Par contre, une fois l'effet de surprise passé je ne suis pas sur que ce jeu marche sur le long terme. J'ai déja joué au bas mot une dizaine de fois à "Civilization IV" ou à "SimCity III" ou à "Railroad Tycoon II" sans me lasser, mais je ne pense pas que ce sera le cas pour ce jeu. Spore patit d'un défaut qui a tendance à se généraliser dans les jeux de stratégie trop grand public : l'absence de profondeur et de complexité qui limite l'intérêt sur le long terme.
J'ai mis en ligne une vidéo de ma créature, Sabraptor plaensis sur ce lien que j'ai dessiné comme un Insecte avec des mains préhensiles et des avant-bras munies de pointes défensives en forme de sabre (défense mécanique) et de glandes projetant du venin (défense chimique).
En lien également, un article d'Agoravox sur le jeu.

samedi 6 septembre 2008

De l'obésité chez les copépodes



Les copépodes sont des Crustacés (et vraiment des Crustacés - voir plus bas le post sur la classification des espèces revue chez le Figaro) qui sont essentiels dans les chaines alimentaires marines. De la taille de l'ordre du millimètre, ils appartiennent au zooplancton. Certaines espèces ont souvent des grandes expansions qui leur permettent de "nager" bien que leurs mouvements horizontaux soient largement déterminés par les courants. Par contre, leurs mouvements verticaux sont actifs : ils remontent à la surface le soir et se nourrissent du phytoplancton (le plancton dont la source d'énergie est la lumière) qui se masse juste la surface de l'eau le soir et profite des derniers rayons de soleil pour faire marcher leur photosynthèse. Ils redescendent plus profondément le jour ce qui leur permet à la fois de suivre le phytoplancton qui s'éloigne de la surface (trop de lumière) et d'échapper aux prédateurs (petits poissons...) qui les repéreraient trop facilement à la lumière. En hiver, les copépodes du genre Calanus descendent à de grandes profondeurs (entre 800 et 1500 m) pour entrer en diapause (une sorte d'hibernation). Le contrôle de la profondeur des copépodes ne se fait pas que par la nage mais aussi par la quantité de lipides dans le corps. En effet, les lipides sont moins denses que l'eau et donc plus il y a de lipides, moins il y a de densité, plus il y a de flottaison.
Or des chercheurs norvégiens ont découvert que les Calanus qui avaient trop mangé ont trop de goutellettes lipidiques et ne peuvent plus contrôler correctement leur profondeur. Ils ne peuvent plus redescendre à des profondeurs importantes et sont mangés par les prédateurs (qui au passage profitent des lipides en excès). C'est donc sans doute l'explication derrière le fait que certains Calanus entrent en diapause AVANT la fin de la période où la nourriture est abondante. La sélection naturelle dans ce cas a tendance à éliminer les Calanus trop gourmands qui se goinfrent jusqu'au bout et deviennent obèses et se font manger faute de descendre à des niveaux en sécurité.