vendredi 17 août 2007

Smoking/No smoking

Je viens de voir en DVD les films d'Alain Resnais avec les excellentissimes Sabine Azéma et Pierre Arditi, "Smoking" et "No smoking". L'originalité de ces deux films qui totalisent 5 heures tient non seulement au fait que les deux acteurs jouent tous les personnages mais aussi qu'il y a de multiples fins (12 au total) selon les décisions des protagonistes et les hasards qui jalonnent le récit.
Ce principe peut tout à fait illustrer le principe de contingence en Evolution. L'histoire évolutive sur notre planète est unique et si on remontait 200 millions d'années en arrière, elle ne se déroulerait pas une deuxième fois de la même façon. Des évènements totalement indépendants du monde vivant ont jalonné cette histoire : chute de météorites, éruptions volcaniques massives, mouvements tectoniques. L'exemple classique est la disparition des dinosaures il y a 65 millions d'années qui a laissé les niches écologiques dominantes aux Mammifères. D'autres exemples existent comme par exemple le quasi-remplacement des Brachiopodes par leur équivalent Mollusque, les Lamellibranches (comme la moule ou la coquille Saint-Jacques) après la crise du Permien il y a 250 millions d'années. Sans cette crise (aux origines plus ou moins inexpliqués), on mangerait chez Léon des Brachiopodes avec des frites avec des lophophores qui nous chatouillerait le palais (le lophophore est une structure présente chez les Brachiopodes mais pas chez les Lamellibranches). Mais peut-être que "Chez Léon" n'existerait pas et d'ailleurs nous-même non plus...

dimanche 12 août 2007

Le cil vous plait

Les cils cellulaires sont des protrusions mobiles de la cellule, soutenus par des éléments du cytosquelette (les microtubules) qui ont, jusqu'à il y a peu de temps, peu intéressés les biologistes cellulaires. Il ne faut pas confondre les cils (les rames) avec les flagelles (les hélices) comme ceux des spermatozoïdes. On considérait les cils comme des structures à fonctions purement mécaniques, dont le rôle se borne à battre et à créer un courant qui permet d'évacuer les particules indésirables le long de notre trachée ou de mettre en mouvement l'eau dans la cavité générale de la moule pour sa respiration et sa nutrition ou de faire nager les petites paramécies (fonctions importantes mais qui font bailler d'ennui tous les biologistes cellulaires).
Cela change depuis quelques temps. Il y a eu la découverte très innatendue il y a quelques années de l'implication des cils dans la génération de l'asymétrie droite-gauche chez les embryons de Vertébrés (asymétrie qui se manifeste par la position du coeur, l'enroulement des intestins, les aires du cerveau...). Imaginez un petit bassin appelé noeud de Hensen au beau milieu de l'embryon. Le petit bassin est rempli de liquide. Des cellules déversent dans ce liquide des particules (lipoprotéiques) contenant une protéine appellée Sonic Hedgehog (Shh). Initialement Shh est réparti uniformémént dans le petit bassin. Mais une rangée de cellules possèdent des cils qui battent tous dans le même sens. Donc un courant se crée provoquant l'accumulation de Shh vers un des côtés. Les cellules qui reçoivent plus de Shh que les autres sur un des bords du bassin interprètent et décodent l'information Shh : tu es une cellule à gauche. Et voila pourquoi votre coeur est plus à gauche !!! La question qui ne manque pas d'apparaitre maintenant c'est "Mais pourquoi tous ces cils battent-ils tous vers un même coté ? Il y a une polarité pré-existante ??". On n'en sait encore rien mais vous voyez bien que ces cils sont intéressants...
Deuxième surprise dans un Science du 20 juillet 2007, Rohatgi et al. nous apprend que les récepteurs à Shh se trouvent aussi concentrés sur des cils (immobiles ceux-là qu'on appelle des cils primaires) et qu'ils fonctionnent comme des interrupteurs cellulaires. Shh se fixe sur les cellules sur un récepteur Patched. On savait qu'en absence de Shh, Patched inhibe la protéine Smoothened qui permet d'activer les messagers de Shh appellés Gli à l'intérieur de la cellule. Shh inactive Patched en se fixant à lui donc Patched ne peut plus inactiver Smoothened et les messagers Gli peuvent aller accomplir leur mission. C'est le coup classique de "j'inhibe un inhibiteur pour activer" ou "l'ennemi de mon ami est mon ennemi". L'histoire est un peu plus complexe car Patched sans Shh active quand même les Gli mais sous une forme "répressive de la transcription" alors que quand Shh est là, Patched ne peut pas pervertir nos petits Gli et c'est Smoothened (bien nommé) qui les rend "activateurs de la transcription".
Et le cil dans tout ça ??? Et bien il crée un domaine cellulaire restreint où va se jouer le destin de Gli. Car Gli s'accumule dans le cil. Sans Shh, Patched tout puissant empêche Smoothened de rentrer dans le cil (en inhibant la production d'oxystérol à partir du cholestérol très abondant dans la membrane des cils; cet oxystérol est nécessaire à Smoothened pour être stable dans les cils) et donc Gli ne peut que subir l'éducation de Patched et devenir "répresseur". Quand Shh s'arrime à Patched, Patched se retrouve internalisé dans une vésicule et dégradé donc il laisse le champ libre à Smoothened qui après entrée dans le cil corrige nos petits Gli en activateurs. Longue vie à tous nos petits cils !!!

dimanche 5 août 2007

L'exception culturelle française

Je suis toujours affligé de voir à quel point notre pays est en retard dans certains domaines et notamment pour informer correctement le public en temps réel via des sites Internet et gratuitement.
Dernier exemple en date, ce site qui montre qu'un pays "sous-développé" comme la République Tchèque est capable d'apporter une information claire et pratique sur les trains en retard en direct. Quand on clique sur les petits triangles qui représentent les trains, on a le retard du train en question et en plus on peut accéder à l'historique de tous les retards du train entre différentes stations depuis quelques mois. Cela dit, cela ne m'étonne pas que ce soit la République Tchèque qui ait développé cet outil car les retards de trains sont chroniques.
Pour continuer dans l'info férroviaire, pour rechercher des horaires et des trajets il vaut infiniment mieux utiliser le site de la Deutsche Bahn plutot que celui de la SNCF.
Pareil pour la météo, si vous voulez suivre les impacts de foudre en direct en Europe, vous avez un site...québécois, un site allemand et un site français fait par des amateurs...mais rien de MétéoFrance ou alors il faut payer bien sur...La sécurité a un prix. L'ensemble des sites gratuits que j'ai cité sont accessibles ici.
Et évidemment vous pouvez faire des animations satellites personnalisés sur un site...tchèque, une fois de plus.