Journal de bord

Les pères prennent le pouvoir

2009-04-29T19:06:00.003Z

Pour le développement harmonieux des embryons, il n'y a pas que les mères qui comptent !! Le papa aussi participe activement...On en avait des preuves déja chez certains animaux et notamment les grenouilles et crapauds où le point d'entrée du spermatozoïde dans l'ovocyte lors de la fécondation est crucial pour la mise en place des axes de polarité de l'embryon (antérieur-postérieur et dorsal-ventral). En fait, lors de la fusion avec l'ovocyte le brave spermatozoïde apporte son ADN (matériel génétique) mais aussi un élément protéique appelé centriole et qui contrôle l'orientation de l'oeuf fécondé puis de l'embryon. L'équivalent chez les Mammifères n'existe pas, ou en tout cas pas de manière aussi claire. Néanmoins, en général, c'est le contenu de l'ovocyte qui est déterminant pour le développement de l'embryon et ainsi on trouve beaucoup de gènes dits à effet maternel. Habituellement, les caractères génétiques sont déterminés à la fois par le père et par la mère. Or pour le développement précoce, la mère joue de son avantage et certains de ces caractères génétiques s'expriment lors de la formation de l'ovocyte (où par définition le père ne peut pas participer - c'est totalement déloyal !!). Ainsi, qu'importe le génome du père, c'est la mère qui commande !! Et ce n'est pas que sur des détails : sans un gène à effet maternel appellé Bicoid, l'embryon drosophile finit sans tête : plutot gênant. Or une decouverte vient nuancer cette vision, car on a trouvé un gène à effet paternel : c'est le génome du père qui compte et non celui de la mère ! Cette découverte a été faite chez Arabidopsis thaliana, une plante aussi insiginfiante qu'une drosophile mais qui est (aussi) un modèle très répandu dans les laboratoires. Le gène impliqué s'appèle SSP. Si on croise du pollen (mâle) mutant avec un pistil (femelle) non muté l'embryon dans la graine obtenu est difforme. A l'inverse, si SSP est normal dans le pollen, que le pistil ait un SSP muté ou absent, ça n'a pas d'importance, l'embryon sera normal. En fait, c'est le pollen qui exprime le gène SSP, accumule un ARNmessager de SSP qui se déverse dans l'oosphère (équivalent d'ovocyte) lors de la fécondation et est traduit dans l'oeuf fécondé en protéine où il active une voie de signalisation intracellulaire appellé Yoda (oui, comme le sage gnome vert bondissant de Star Wars).

Nature et Histoire

2009-03-10T20:19:00.004Z

Je viens de finir un ouvrage du brillantissime Jared Diamond dont j'avais lu et commenté le livre "Effondrement" en Septembre dernier. Le nouvel ouvrage s'appelle "De l"inégalité parmi les sociétés". Une fois de plus, un pur chef-d'oeuvre à la fois extraordinairement érudit et synthétique sur l'histoire mondiale. La question de fond est la suivante : pourquoi ce sont les Européens qui ont envahi les Amériques et non pas l'inverse ? En fait tout s'est joué il y a entre 10 000 et 5 000 ans : la révolution néolithique et la domestication des plantes et des animaux a été la plus efficace dans "Le Croissant fertile" moyen-oriental. Sur les autres continents, le nombre d'espèces domesticables était plus limité. Notamment, en Amérique dès son arrivée via le détroit de Béring, l'Homme a exterminé tous les Mammifères dominants les écosystèmes ne laissant que le lama à domestiquer (le bison n'étant pas domesticable...). Notablement, l'Homme a éradiqué de ce continent les chevaux, ce qui bien sur a des conséquences dramatiques des millénaires plus tard quand on sait que les chevaux espagnols ont terrifié les peuples amérindiens. Le continent eurasien par sa configuration est-ouest et ses faibles obstacles géographiques a favorisé les échanges technologiques, commerciaux et culturels entre les peuples, ce qui n'est pas le cas en Amérique (configuration Nord-Sud donc forte zonation climatique et isthme étroits, Cordillières des Andes...): les Aztèques et les Incas s'gnoraient complètement alors qu'ils sont moins éloignés que l'Italie de Marco Polo et les Chinois...Enfin, la domestication massive a abouti à la transmission de nombreuses maladies des animaux aux hommes et c'est par ces germes (variole, etc...) que les Européens ont surtout conquis les empires aztèques et incas car ces peuples étaient très peu immunisés contre de tels fléaux. Cela a permis de conquérir des empires fortement peuplés et organisés avec un nombre ridiculement bas de "conquistadors" (à peine quelques centaines). C'est l'un des traités les plus anti-racistes qui soit : la supériorité eurasienne n'est pas génétique mais tient à leur environnement favorisé, à une succession de circonstances qui leur ont donné de multiples avantages. Une preuve de plus que l'histoire humaine est très dépendante des conditions naturelles géographiques et biologiques...

Attention le retour

2009-03-03T20:44:00.003Z

Il semblerait aux dernières nouvelles que Michael Jackson prévoit une série de concert à Londres cet été. Espérons que tout se passera bien...Je me suis amusé à collectionner les quelques vidéos sur les "incidents" ou "surprises" qui ont émaillé ses dernières tournées (cliquer sur les liens pour voir les vidéos) : d'abord la scène doit être impeccablement propre, ensuite il ne faut pas se casser la figure en se penchant en avant dans "Smooth criminal" (à 1 min 3 sec), éviter qu'un spectateur complètement inconscient ne monte sur la grue élévatrice pendant "Earth Song" (à partir de 4 min 50) (remarquez comment Michael essaie de l'agripper à la barre de protection pour éviter qu'il ne tombe et aussi le joli "comité d'accueil" qui l'attend à 6 min 30), éviter que la grue ne se crashe toujours pendant "Earth Song" comme à Munich en 1999 (voir vers 5 min 50), éviter de se faire fêter son anniversaire sur scène quand on déteste les anniversaires comme MJ.

Le singe, le mille-patte et le moustique

2009-02-27T19:00:00.003Z

Encore une histoire comme seule la nature sait l'inventer, cette fois-ci sur les singes capucins d'Amérique du Sud. Ces singes ont la particularité de se frotter le corps avec une espèce de mille-patte bien particulière Orthoporus dorsivittatus. Des chercheurs américains (Weldon et al, 2003) ont montré que ce comportement permet aux singes de s'enduire avec les sécrétions de ces charmantes bêtes qui sont bourées de benzoquinones. Ces molécules ont la propriété de repousser les moustiques et d'inhiber leur réflexe de piqure si magré tout ils se posent. Donc les singes trouvent leur lotion anti-moustique dans leur environnement ! De manière intéressante, les chercheurs ont montré que le comportement de badigeonnage du corps est induit par les mêmes molécules benzoquinoniques que celles qui repoussent les moustiques. Ainsi, si on donne aux singes des tissus imprégnées de ces molécules, ils se frottent le corps avec ce qui montre bien qu'ils ne reconnaissent pas en tant que tel le mille-patte.

Manifestation des enseignants et des chercheurs

2009-02-10T19:21:00.004Z

Je viens de participer à la manifestation en faveur de l'université et de la recherche qui a eu lieu à Paris entre Luxembourg et Invalides (on était sensé aller jusqu'à l'Assemblée Nationale mais ça a été bloqué par une bande de CRS (genre Uruk-Hais du Seigneur des Anneaux), ce qui me fait penser qu'entre les CRS et le CNRS il y a de la N).
Les réformes du gouvernement Sarkozy (sic) dans ce domaine suivent la même logique et la même erreur que les réformes hospitalières, les réformes de la justice, les réformes de la SNCF, de la Poste...etc.... Il s'agit d'appliquer à un service public les principes et le management d'une entreprise privée. Il s'agit d'être rentable, avec un retour sur investissement "à court terme". Le tout sous le contrôle de l'"élite" politico-économico-médiatique qui régne de manière totalitaire sur le monde (le totalitarisme c'est réduire la complexité du monde à une idée; le communisme c'était "surtout pas l'individu tout dans le collectif", le nazisme c'était "notre race, c'est la meilleure" et actuellement c'est "l'argent, il n'y a que ça d'important" ; nous vivons bien dans un régime totalitaire). Pour la recherche et l'université, il s'agit de produire avec le plus bas cout possible des brevets (et non plus des connaissances...) et des étudiants corvéables sur un marché du travail dégradé. Dans le cas de la réforme dite de "masterisation" de la formation des enseignants, il s'agit de produire des légions d'étudiants qui n'auront ni le concours du CAPES et de l'Agrégation et qui pourront être embauchés sur emplois précaires dans l'Education Nationale, remettant en cause le statut de fonctionnaires des professionels de l'enseignement. La "réforme" du statut de décret des enseignants-chercheurs aboutit à créer une concurrence et une compétition entre les enseignants-chercheurs d'une même université. Or rien de plus classique pour rendre les gens dociles et corvéables que de créer une course à l'échalote avec dans le rôle de l'arbitre un valet obligé de l'Etat. C'est une méthode de contrôle, une reprise en main administrative de la liberté de chercher et d'enseigner.
Le tout dans un contexte de régression sans précédent des moyens en postes. Or la recherche est encore un travail de main-d'oeuvre. Quand, faute de personnel technique suffisant, je suis obligé de faire des mini-preps ou des génotypages que pourrait faire un technicien payé 30% moins cher que moi, l'Etat a par ailleurs une gestion desastreuse. Pour l'enseignement, on ne compte plus les heures supplémentaires non payées.
Le tout sous les insultes du petit empereur, dont les discours, si ils étaient évalués comme pour une publication scientifique, seraient rejetés tellement ils accumulent d'erreurs factuelles, d'oublis, de caricature, de mauvaise foi. Bien sur, il y a des enseignants-chercheurs qui se la coulent douce et ne remplissent pas sérieusement toutes leurs missions (comme dans tous les métiers; regardez par exemple Valérie Pécresse, conseillère régionale d'Ile de France, qui n'a siégé dans ce conseil qu'un nombre très restreint de fois....); repérons ces 2-3 %, VIRONS-LES (je n'ai aucun soucis avec le fait qu'on puisse renvoyer un fonctionnaire si manifestement il ne fait pas un minimum correctement son travail), mais ne créons pas un système qui pénalise les 97% restants qui font sincèrement des efforts, qui ont été recrutés lors d'un concours ultra-sélectif, qui sont déja évalués dès qu'ils veulent publier, obtenir une bourse pour leurs étudiants, obtenir de l'argent pour un projet, monter en grade, muter dans une autre université, monter un nouveau labo, acheter des équipements lourds....etc....
Bref, c'était bon d'aller manifester si nombreux aujourd'hui !

Le meurtrier de Tycho Brahé

2009-01-17T19:52:00.007Z

J'avais lu pendant les dernières vacances une biographie romancée de l'astronome Tycho Brahé et de Kepler ("La discorde céleste" de Jean-Pierre Luminet), mais je ne me doutais pas que le livre deviendrait si vite obsolète et que la réalité allait dépasser cette biographie. En effet, les circonstances de la mort de Brahé en 1601 à Prague sont éclaircis et il aurait été assassiné au mercure comme le rapporte "Der Spiegel". Tycho Brahé est d'origine danoise et il batit sa réputation de plus grand astronome de son temps (détroné ensuite par Galilée) sur la qualité et la précision de ses instruments d'observation. Mais il avait du mal à imaginer un système pour rendre compte de ses observations et c'est finalement Johannes Kepler qui utilisa les données que Brahé avait accumulé pour définitivement faire triompher l'héliocentrisme que Copernic avait envisagé quelques années plus tot et trouver les figures géométriques qui régissent le mouvement des planètes (ce qui fut une étape décisive vers la théorie de la gravité universelle de Newton).
La version classique de la mort de Brahé raconte que durant un banquet il avait tellement bu sans pouvoir aller aux "toilettes" de l'époque que sa vessie fut irrémédiablement fissurée, ce qui provoqua un épanchement d'urine dans l'abdomen. Dans les années 1990 des doses très importantes de mercure ont été trouvées dans les poils de ses moustaches conservées dans un musée à Prague. Néanmoins, Brahé s'adonnait à l'alchimie (comme beaucoup de savants à la cour de Rodolphe II à Prague) et le mercure aurait pu provenir de ces activités. Actuellement, les restes du corps de Brahé conservé dans la crypte d'une cathédrale de Prague sont analysés. La véritable nouveauté vient de l'analyse d'un journal intime trouvé dans des archives à Stockholm. Ce journal a été tenu par un des cousins éloigné de Brahé (Erich) et présente des indices troublants permettant d'imaginer que c'est lui l'assassin au mercure. Le meurtre aurait été commandité par le roi du Danemark de l'époque, Christian IV, dont Brahé, très bon vivant, était peut-être le père... (une histoire d'ailleurs habilement maquillée par Shakespeare dans Hamlet). Par ailleurs, Brahé s'était fait beaucoup d'ennemi à la cour du Danemark (d'où son hébergement par Rodolphe II à Prague) : au cour d'un duel il avait d'ailleurs perdu son nez qu'il avait remplacé par une postiche en métal (voir photo). Voila, c'était ma contribution à l'année de l'astronomie !

Spiderman en Moravie

2009-01-06T16:05:00.003Z

La Moravie du Sud en République Tchèque ne me paraissait pas une région cachant des créatures mystérieuses et dangereuses. Pourtant, c'est dans cette région (dont la principale ville est la très provinciale Brno (là où vivait Mendel)), qu'a été découvert en 2008 une nouvelle espèce d'araignée venimeuse baptisée fièrement Eresus moravicus. La "morsure" de cette araignée n'est pas mortelle mais provoque céphalée et fièvre pendant quelques heures. On connait actuellement 75 000 espèces d'Arachnides dans le monde (soit 30 000 espèces de plus que tout les Vertébrés réunis). Divers estimations montrent que 90% des espèces d'Arachnides sont encore à découvrir (tant qu'elles n'ont pas été éradiquées par l'extinction massive qui a lieu actuellement du fait des activités humaines). La plupart de ces espèces se cachent tapies dans des régions reculées (équatoriales notamment) où la moindre expédition permet d'en trouver de nouvelles. La découverte d'une nouvelle espèce d'Arachnide, qui plus est empoisonnée pour l'Homme, est quand même un évènement rare sous nos latitudes, d'autant plus que coté coloration, cette araignée n'était pas vraiment discrète !! (voir photo).

Harry Potter, Bilbo, Walkyrie et Pi

2008-12-21T16:15:00.004Z

Petit point sur l'actualité des films que l'on attend avec impatience. Tout d'abord le sixième "Harry potter" (et le Prince de Sang Mêlé) est déja fini depuis quelques mois mais ne sortira que mi-Juillet 2009 parceque ça arrangait mieux la production (Warner Bros) !! Sympa...
Pour "Bilbo Le Hobbit" la préquel de la trilogie du Seigneur des Anneaux, la sortie est prévue en 2011. Le réalisateur sera bien Guillermo Del Toro, le réalisateur du "Labyrinthe de Pan" et la production/design artistique reviendra à l'équipe de Peter Jackson, assurant la continuité avec la trilogie (désolé, Nicolas...). C'est finalement une excellente combinaison : du sang neuf mais sous le regard du maitre. Les acteurs du Seigneur des anneaux ont déja accepté de revenir (Ian McKellen (Gandalf), Hugo Weaving (Elrond)...), y compris Ian Holm qui jouait Bilbo dans la trilogie mais bien sur les séquences avec Bilbo (plus) jeune demanderont un autre acteur. L'histoire de Bilbo le Hobbit ne tiendra que sur un film et pas deux comme annoncé précedemment. Le deuxième film qui sera produit simultanément fera le lien entre "Bilbo" et le seigneur des anneaux racontant ce qu'il se passe entre les deux livres d'après les annexes et les écrits de Tolkien. On y verra notamment Saruman commencer à tomber du côté obscur au dernier "White Council", Aragorn guerroyer pour Rohan et Gondor sous le nom de Thorongil, notamment remportant une bataille contre les pirates d'Umbar (qui s'allieront à Sauron). Il y a aussi toute l'histoire de la chute du royaume de Balin dans les mines de la Moria qui pourra être racontée. Que du bonheur...
Plus proche, le film sur "L'opération Walkyrie" qui sortira fin Janvier et que j'irai voir malgré la présence de Tom Cruise (scientologue...) dans le film (cela dit je n'arrête pas de clamer qu'une religion est une secte qui a réussi...). Il s'agit de l'histoire du complot allemand qui a manqué de très peu d'assassiner Hitler en Juillet 1944. C'est un des moments où l'histoire du XXème siècle a tenu (presque littéralement ici) à un fil...J'avais eu connaissance de ce complot lorsque j'ai lu l'année dernière l'inégal "A la recherche de Klingsor" de Jorge Volpi où il est présenté dans un des méandres de l'intrigue (qui traite également de comment le Reich est passé à côté de la bombe atomique...).
Enfin, il y a un projet d'adaptation d'un des livres les plus extraordinaires que j'ai lu : "The life of Pi" de Yann Martel dont j'ai déja parlé avec Jean-Pierre Jeunet à la réalisation (Amélie Poulain, Delicatessen, La cité des enfants perdus...). Il fallait bien lui pour s'attaquer à ce livre que je pensais inadaptable...

Ca chauffe pour Coldplay

2008-12-10T19:13:00.005Z

Une affaire de plagiat touche l'un des groupes que j'ai "découvert" récemment : Coldplay. C'est la chanson "The scientist" qui a attiré initialement mon attention (évidemment...vu le titre) et dont le clip est très bien fait. J'ai petit à petit découvert les autres titres, notamment "Clocks", qui sont en général magnifiques, subtilement arrangés et très agréables à écouter. La chanson incriminée dans le plagiat est "Viva la vida" qui est un vrai petit chef-d'oeuvre extrait de leur dernier album. C'est un guitariste, Joe Satrani, qui a porté plainte. L'un de ses morceaux a un refrain qui ressemble effectivement à celui de Coldplay. Etre juge dans ce genre d'affaire est assez difficile. Je pense que les compositeurs de Coldplay ont suffisamment de talent pour ne pas avoir à piquer intentionnellement des mélodies. De plus, on peut très bien imaginer qu'avec des mélodies pop somme toute assez simples, deux artistes peuvent très bien parvenir indépendemment à des résultats similaires, un peu comme en Evolution pour les convergences évolutives où deux groupes d'animaux par exemple ont des structures similaires alors qu'elles ne sont pas héritées d'ancêtres communs (par exemple les pattes postérieures repliées en Z de la sauterelle et de la grenouille). Et même si les auteurs de Coldplay ont déja entendu cette mélodie, ils en ont fait une oeuvre infiniment plus intéressante que le morceau besogneux de Satrani.

Orbival : le tracé f(l)ou

2008-12-04T14:19:00.006Z

Orbival est le principal projet de métro en rocade qui permettrait, en tout cas dans sa version initiale, de soulager les lignes A, B, C et D du RER à l'Est et au Sud en permettant de passer de l'Est de l'Ile de France au Sud sans passer par Paris.
Le tracé prévu jusqu'à présent était logique : de Val de Fontenay (l'une des stations les plus fréquentées de l'Ile de France, noeud entre la ligne RER A et E, désservant un quartier d'affaires et une grande cité-dortoir + last but not least à 10 minutes à pied de chez moi !!) jusqu'à Arcueil-Cachan ou Bourg-La-Reine selon les versions, bref vers la branche sud du RER B.
Voila comment le projet a été présenté et "vendu" aux habitants du Val-de-Marne qui ont massivement approuvé le projet sur ce tracé. Reste à trouver le financement (mais 2-3 milliards d'Euros pour un projet aussi utile devraient se trouver sans problème...avec des élus et un gouvernement responsables...D'accord c'est pas gagné !!).
La surprise est venue d'une innocente réunion de quartier, hier, où j'ai posé quelques questions au maire de Nogent-sur-Marne, Jacques JP Martin (UMP), sur la position possible d'une station d'Orbival sur le territoire de la commune. Et bien le tracé présenté jusqu'à présent sera peut-être remanié ! Plus de passage à Val-de-Fontenay (sous le prétexte inédit que "trop de correspondances" sur une même station c'est pas bien...) et à la place un tracé qui relierait l'Université de Marne-La-Vallée à l'Université de Créteil puis sans doute vers...l'aéroport d'Orly ! Fini la correspondance avec le RER B donc.
Les deux Universités seraient reliées pour faire plaisir à la ministre Valérie Pécresse (UMP) qui veut fusionner les deux Universités (d'où l'intérêt d'avoir un métro reliant les deux pour que les étudiants puissent être transportés de l'un à l'autre des sites). Donc non seulement Pécresse met un capharnaum pas possible dans les Universités et les instances de Recherche actuellement mais en plus elle vient torpiller un excellent tracé de métro. Pécresse est la future candidate de l'UMP pour les Régionales de 2010, ça promet...Le choix d'aller vers Orly est sans doute dicté (c'est mon interprétation) par le fait que ça va permettre d'ouvrir plus facilement des partenariats de financement avec le privé (vous pensez bien, faire un métro pour la plèbe de la petite couronne parisienne ça n'intéresse personne). Cela dit, Orly est actuellement mal desservi côté transport en commun, c'est vrai...
Le "nouveau" tracé est complètement bizarre et la transversale intiale deviendrait en fait une bi-radiale en forme de V ou de U centrée sur Créteil.
Le drame c'est qu'il faudrait en fait construire les deux tracés car chacun des tracés a son intérêt même si ma préférence va au tracé initial qui privilégie des zones d'habitations denses de la petite couronne.

Mettez un calmar dans votre moteur !

2008-11-25T14:12:00.003Z

On ne trouve pas/plus de pétrole mais au moins on a des calmars géants !

Un submersible automatisé (de la  compagnie pétrolière Shell) a filmé par
hasard à 2500 m de profondeur ce calmar très rare, apparemment du genre
Magnapinna (voir http://en.wikipedia.org/wiki/Magnapinna )
Ces calmars sont caractérisés par de très longs tentacules (jusqu'à 15 à
20 fois la longueur du reste du corps), qui sont capables de faire une sorte de
coude à 90°, très visible sur la vidéo. La longueur de tous les
tentacules semble être la même, ce qui n'est pas habituel dans ce groupe
(il y a toujours deux tentacules plus longs repliés au repos qui se
projettent brusquement vers les proies). Je serai très curieux de voir
ce que ça donne quand ils attrapent une proie. Mon feeling c'est que nos
amis Magnapinna font de la pure pêche à la ligne, étendent paresseusement leurs longs
tentacules et attendant patiemment qu'une proie s'y accroche, un peu
comme des méduses.
En tout cas, si les bénéfices mirobolants de nos amies les compagnies pétrolières peuvent servir à faire avancer la science zoologique, je suis d'accord. Néanmoins, c'est un peu "regardez la belle nature...avant qu'on ne vous la détruise !".

Michael Jackson invente la "cash cow" (la vache à billets)

2008-11-23T21:29:00.006Z

Diverses vidéos sont apparus sur Internet avec des extraits de dépositions de Michael Jackson pour ses différents procès. Avec des morceaux d'anthologie : le meilleur est vers la fin de cette vidéo (lien) dont je retranscris ici le dialogue traduit en français:

Juge : Comment obteniez-vous de l'argent liquide (du cash) en 2003 ?
Michael : Facilement, mais je ne voulais pas aller à la banque. Je l'obtenais à Neverland (note : sa propriété)
Juge : Comment faisiez-vous ?
Michael : Je l'obtenais avec les vaches...sur la propriété.
Juge : Mais je vous parle de billets verts, de dollars
Michael : Oui, c'est ça des billets...
Juge (hésitant) : Donc cela...venait des...vaches ??
Michael : Oui, en fait nous avions des vaches sur la propriété qui appartiennent à des fermiers voisins. On leur louait l'espace...Je n'aime pas aborder ce sujet. (note : sans doute des sous pas déclarés au fisc...Parceque c'est Michael on lui pardonne)
Juge : Donc tout l'argent que vous utilisez pour le shopping vient des vaches ?
Michael : Eh oui...aussi incroyable que cela puisse paraitre...

Autre moment rigolo où on se rend compte que Michael sait jouer le naïf pour éluder les questions embarrassantes :

Juge : Est-ce que vous l'avez payé pour ce qu'il a fait ? (note : un collaborateur que Michael a fait travailler sur un projet qui est finalement tombé à l'eau)
Michael : Je ne sais pas..mais je suis sur qu'il a été payé...
Juge : Pourquoi en êtes-vous sur ?
Michael : Parcequ'il semblait toujours content...
Juge : Mais l'argent ne fait pas le bonheur...
Michael : Oui, mais là il avait toujours un grand sourire !

Autre vidéo datant de 1993 (lien) pour un procès pour plagiat sur la chanson "The girl is mine" (procès que Michael a évidemment gagné.....). Michael n'hésite pas une seule seconde à reconstituer toute la rythmique avec sa bouche ("beat box") et à chanter une partie a capella ce qui énerve visiblement les avocats de la partie adverse (on entend dans le fond "objection ! objection !").

Bonnes et mauvaises graisses

2008-11-07T09:50:00.003Z

"Gros moi ? Je suis juste bien musclé !". Ca pourrait être avec un peu de mauvaise foi une réponse classique d'Obélix aux remarques désobligeantes dont il fait régulièrement l'objet. Des chercheurs (Seale etal. dans un Nature d'Aout 2008) ont montré que la réponse d'Obélix n'est pas si idiote...
Il existe deux types de tissu adipeux (qui contiennent beaucoup de graisse) : le tissu adipeux blanc et le tissu adipeux brun. Le tissu adipeux blanc est purement un tissu de stockage des réserves lipidiques constituées de cellules rendues obèses par une énorme goutte lipidique qui prend un large volume de leur cytoplasme. Le tissu adipeux brun est constitué également de cellules riches en lipides mais sa fonction est différente. Les cellules de ce tissu contiennent des mitochondries (sorte de centrale nucléaire cellulaire qui produit de l'énergie en déplaçant des protons...si, si) particulières qui produisent de la chaleur. Le tissu adipeux brun est très important chez les Mammifères hibernants qui doivent revenir à leur 37-39°C habituels après une hibernation où leur température corporelle peut descendre jusqu'à 10°C. Les nouveaux-nés des Primates (dont nous) ont transitoirement du tissu adipeux brun (entre les omoplates) ce qui permet de faciliter la transition entre le bain thermostaté à 37°C de maman et le monde atmosphérique froid et hostile. Les chercheurs ont montré que ces deux tissus adipeux n'ont pas du tout la même origine chez l'embryon puisque les cellules du tissu adipeux brun sont des dérivés...de précurseurs de cellules musculaires !! Ce qui n'est pas du tout le cas des cellules du tissu adipeux blanc qui ont une origine complètement différente. De manière amusante, remarquons que les muscles ont aussi un rôle dans la thermogénèse, via le frisson thermique, qui crée de la chaleur mais sans utiliser directement les mitochondries.

Du dopage dans le "Spore"

2008-10-29T11:25:00.004Z

Je m'en doutais un peu et je l'attendais...Le jeu vidéo "Spore" qui a été mentionné plusieurs fois ici ne fait pas plaisir à la communauté scientifique, surtout lorsqu'il essaie de trop se prendre au sérieux. Le concept du jeu avait suscité à la fois un certain enthousiasme (enfin un jeu basé en partie sur la biologie et sa théorie la plus importante, la théorie darwinienne de l'Evolution) mais aussi une certaine inquiétude (le grand public, complètement ignare en science, allait prendre les quelques simplifications nécessaires pour faire fonctionner le jeu comme "argent comptant" et l'appliquer au monde réel). Comme je l'ai déja évoqué, le jeu est décevant du point de vue de la "modélisation scientifique" même si il est plaisant à jouer. Ca aurait pu s'arrêter là mais le marketing, finalement assez agressif autour de ce jeu, a dépassé récemment les limites acceptables. En effet, un documentaire visiblement produit sur commande par la chaine du National Geographic, a fait participer d'éminents chercheurs américains dans le domaine de l'Evolution. Ce documentaire avait pour but la promotion de "Spore". Or les chercheurs n'étaient pas au courant et pensaient qu'il s'agissait d'un documentaire très sérieux sur l'évolution. Sans le savoir, ils apportent donc une "illusion" de caution scientifique sérieuse au jeu, qu'il ne mérite sans doute pas (malheureusement).
Il y a aussi dans le dernier Science, un article intéressant qui analyse ce que pensent vraiment les scientifiques à propos de ce jeu.

Duos gagnants "chanson + film"

2008-10-21T19:56:00.005Z

J'aime beaucoup certains clipvidéos faits maison produits par les internautes. Très souvent, ils combinent les images d'un film avec une musique et ça donne de véritables oeuvres à part entière. Il suffit de trouver les bons couples "film-chanson" et de monter le tout avec gout c'est-à-dire être à la fois sensible aux intonations musicales et à l'oeuvre cinématographique pour entrelacer deux univers qui se rencontrent pour la première fois.
Evidemment, mes clips préférés sont ceux qui associent une chanson et un film que j'adore tout deux et que je considérais jusqu'à présent comme deux entités complètement séparées.
Mes deux clips préférés du moment sont :
"My immortal" du groupe Evanescence sur les images du magnifissime film de Coppola sorti en 1992 "Dracula". Pour le voir, suivre le lien. Remarquons l'humour du réalisateur du clip pour le choix des images sur la phrase de la chanson "This pain is just too real"...
et "Desert Rose" de Sting et Cheb Mami sur les images de la série brillantissime "Dune". Voici le lien
Incidemment, le dernier clip est assez troublant car l'acteur qui joue Paul Atréide ressemble beaucoup à Sting. Et la aussi des rapprochements très intéressants : notamment le passage de la chanson "No sweet perfume ever tortured me more than this" sur une image des vers des sables qui sentent l'Epice dans le monde de Dune. Tout cela démontre une grande connaissance des oeuvres.

Un nobel technicolor

2008-10-09T18:30:00.004Z

Saluons le prix de Nobel de chimie (en fait le prix Nobel de biochimie de manière récurrente ces dernières années) sur la GFP. La GFP est une protéine initialement découverte chez la méduse Aequorea victoria qui émet de la lumière verte lorsqu'elle est excitée par une lumière bleue. Cette bioluminescence dans la nature permet sans doute à la méduse d'attirer ses proies. La protéine a été purifiée dans les années 70 mais ce n'est que vers le milieu des années 90 que son intérêt pour la biologie cellulaire a été compris. En effet, on dispose avec elle d'une protéine pas trop grosse et bien compacte qui est aisément repérable sous une lumière bleue. Ainsi on peut par exemple produire une protéine chimérique couplée à la GFP et on peut savoir très facilement où cette protéine se trouve dans la cellule. Et en plus, on peut le faire dans des cellules vivantes, donc on peut voir bouger des structures contenant cette protéine dans la cellule en direct live. Des dérivés de la GFP et d'autres molécules fluorescentes sont maintenant couramment utilisés permettant de réaliser un véritable arc-en-ciel dans le vivant (dont j'ai déja donné un exemple ici).

Palin fait un Bide(n)

2008-10-04T16:48:00.005Z

J'ai regardé la plus grande partie du débat des colistiers des élections présidentielles US : Biden contre Palin. Débat organisé dans une Université et présenté par une présentatrice noire, deux choses par ailleurs inimaginables en France. Il est évident que mon regard n'est pas vraiment objectif, vu que je suis clairement pro-démocrate et que les républicains US constituent l'un des gangs les plus toxiques de la planète, même si il peut y avoir de bonnes surprises (finalement Schwarzenegger en Californie n'est pas si mauvais...). Sans misogynie aucune, la prestation de Palin rappelle les pires prestations de Ségolène Royal pendant notre campagne, notamment pendant le débat face à Sarko où elle fut très mauvaise. On sent les phrases-slogans apprises par coeur, la fausse proximité avec le peuple. Sur le fond, les débats US sont assez exotiques par rapport aux débats politiques français. Par exemple, les débatteurs n'arrêtent pas de s'envoyer dans la figure les statistiques des votes aux Congrès ou au Sénat : par exemple Palin insiste que Obama a voté 94 fois contre des baisses d'impots (note : les baisses d'impots pour les plus riches...) au Sénat, ou va même lui reprocher qu'il a voté à 96% comme le reste de son parti ! Palin répond régulièrement à coté de la plaque notamment sur l'économie où Biden l'enfonce facilement sur les éternelles volontés dérégulatrices du parti Républicain. Palin défend McCain en rappellant que celui-ci a voté en faveur de régulations...contre l'industrie du tabac (encore heureux !)
Quand Obama propose de donner une Sécurité Sociale à tous les américains, elle répond que l'on ne va tout de même pas laisser l'Etat et le gouvernement à Washington décider de quels médicaments prendre quand on est malade (oui, vous savez le grand méchant Etat bolchévique avec un couteau entre les dents). Mieux vaut bien entendu que ce soit les compagnies privées dénoncées brillamment par Michael Moore dans "Sicko"....
Coté climat et énergie, elle trépigne d'impatience de forer le sol américain pour récupérer les pétrole domestique quand Biden lui rappelle gentiment qu'au mieux il y a 3% de réserves mondiales de pétrole aux US qui consomment 20% de la production mondiale actuelle et que ça n'allait pas changer grand'chose à la donne sur le long terme. Pour les dérèglements climatiques, elle ne peut s'empêcher de signaler que le climat subit des cycles naturels, ce qui est techniquement vrai sauf que le réchauffement actuel n'a rien de naturel (le CO2 produit de l'effet de serre; l'effet de serre réchauffe la planète; l'humanité dégage des quantités gigantesques de CO2 depuis la révolution industrielle que ne peuvent absorber en totalité les puits habituels (océan, végétaux...); donc l'humanité réchauffe la planète; c'est aussi simple qu'une équation chimique) et aucun cycle "naturel" n'est prévu actuellement de réchauffer la planète. Mais venant de quelqu'un qui a soutenu il y a quelques années que les dinosaures et les hommes se sont cotoyés sur la planète il y a 6000 ans, il ne faut pas s'étonner que la science donc la vie réelle, ça n'est pas son problème (d'ailleurs dans un des derniers magazine Science, Obama a accepté de répondre à une interview et pas McCain, cela veut tout dire...).

Quelques extraits du débat : extrait 1, extrait 2

Collapse

2008-09-20T18:45:00.004Z

Je viens de lire l'un des essais les plus intéressants parus ces dernières années : "Collapse" (soit "Effondrement") de Jared Diamond. C'est assez inclassable, étant un subtil mélange d'archéologie scientifique, d'histoire, de géographie et de sociologie. Il s'agit de trouver les différents facteurs qui permettent d'expliquer l'effondrement et la disparition de civilisations. Parmi ces facteurs, les facteurs environnementaux sont assez souvent présents et quelquefois déterminants (de notables exceptions sont par exemple l'effondrement de l'Empire Romain (d'Occident puis d'Orient) ou la destruction de Carthage (purement militaire)).
Les principaux exemples détaillés de civilisations qui se sont autodétruites sont la civilisation de l'Ile de Paques, les Anasazis (un ensemble de tribus sur le territoire actuel du sud-ouest des USA), les Mayas, les Vikings au Groenland. Très souvent, l'effondrement a suivi de quelques dizaines d'années seulement l'apogée de la civilisation notamment sur l'Ile de Paques et les Mayas et donc l'effondrement peut être qualifié de brutal même si les mécanismes étaient à l'ouvre depuis longtemps (déforestation et surexploitation agricole créant l'érosion des sols notamment...). Diamond traite aussi de cas de quasi-effondrement de société comme le Rwanda au moment du génocide de 1994 dont un des facteurs est la surpopulation et le manque de terres agricoles : de nombreux membres de la population civile ont massacré leurs voisins (sous le prétexte idiot qu'ils ne sont pas de la même ethnie) surtout pour récupérer leurs terres pour survivre.
Diamond traite aussi de quelques succès : des civilisations qui ont survécu des siècles malgré des conditions géographiques difficiles comme par exemple les Islandais et les Japonais. Le chapitre le plus intéressant concerne les tentatives d'explication des comportements suicidaires des civilisations, c'est-à-dire comprendre ce qui se passe dans la tête des habitants de l'ile de Paques qui abattent le dernier arbre de l'ile. Ignorance, déni de réalité, aveuglement, égoïsme ("de toute manière quelqu'un mangera le dernier thon rouge pêché en Méditerrannée alors autant que cela soit moi"), incapacité à s'adapter (typiquement les Vikings du Groenland arque-bouté sur leurs traditions et incapables d'adopter les usages des Inuits, pourtant voisins, qui seront méprisés par les Vikings mais qui leur survivront). Diamond souligne que les castes les plus riches de ces civilisations n'ont gagné que le droit de mourir de faim en dernier.
Le dernier chapitre pointe évidemment le fait que la quasi-totalité des facteurs qui ont de multiples fois abouti à l'effondrement localisé de civilisations sont actuellement à l'oeuvre, mais à l'échelle mondiale.

La dissémination de Spore

2008-09-11T17:56:00.005Z

Le jeu vidéo "Spore", attendu depuis des années et dont j'avais déja parlé ici , est sorti. Je l'ai acheté et joué jusqu'à la phase "civilisation" (en gros les 3/4 du jeu). J'en suis très content mais pas pour les raisons que j'attendais. En fait, l'aspect "évolution" du jeu est assez limité et les changements réalisés sur les créatures au fur et à mesure que l'on accumule des points ADN sont quelquefois purement esthétiques et n'ont quelquefois pas d'incidences majeures (l'auteur du jeu serait-il acquis à la théorie neutraliste de l'évolution ???). Néanmoins, quelques aspects peuvent être importants par exemple le développement du vol qui, pour ma petite créature herbivore, a permis d'accéder aux fruits perchés sur les arbres et non plus seulement les fruits dans les buissons ou les fruits tombés. Néanmoins, la réalisme du jeu retombe quand, pour gagner des points ADN, ma créature doit affronter d'autres créatures et les tuer. J'ai essayé de manger mes victimes mais ma créature herbivore a vomi (les développeurs ont pensé à tout...). On peut aussi gagner des points ADN en impressionnant d'autres espèces par diverses aptitudes (charme, danse...). Et c'est là où le jeu excelle, c'est qu'il est vraiment drôle. L'animation des créatures est très réussie, avec pleins de mimiques comiques. Ca ne se prend pas du tout au sérieux et on passe un bon moment. Par contre, une fois l'effet de surprise passé je ne suis pas sur que ce jeu marche sur le long terme. J'ai déja joué au bas mot une dizaine de fois à "Civilization IV" ou à "SimCity III" ou à "Railroad Tycoon II" sans me lasser, mais je ne pense pas que ce sera le cas pour ce jeu. Spore patit d'un défaut qui a tendance à se généraliser dans les jeux de stratégie trop grand public : l'absence de profondeur et de complexité qui limite l'intérêt sur le long terme.
J'ai mis en ligne une vidéo de ma créature, Sabraptor plaensis sur ce lien que j'ai dessiné comme un Insecte avec des mains préhensiles et des avant-bras munies de pointes défensives en forme de sabre (défense mécanique) et de glandes projetant du venin (défense chimique).
En lien également, un article d'Agoravox sur le jeu.

De l'obésité chez les copépodes

2008-09-06T10:49:00.006Z

Les copépodes sont des Crustacés (et vraiment des Crustacés - voir plus bas le post sur la classification des espèces revue chez le Figaro) qui sont essentiels dans les chaines alimentaires marines. De la taille de l'ordre du millimètre, ils appartiennent au zooplancton. Certaines espèces ont souvent des grandes expansions qui leur permettent de "nager" bien que leurs mouvements horizontaux soient largement déterminés par les courants. Par contre, leurs mouvements verticaux sont actifs : ils remontent à la surface le soir et se nourrissent du phytoplancton (le plancton dont la source d'énergie est la lumière) qui se masse juste la surface de l'eau le soir et profite des derniers rayons de soleil pour faire marcher leur photosynthèse. Ils redescendent plus profondément le jour ce qui leur permet à la fois de suivre le phytoplancton qui s'éloigne de la surface (trop de lumière) et d'échapper aux prédateurs (petits poissons...) qui les repéreraient trop facilement à la lumière. En hiver, les copépodes du genre Calanus descendent à de grandes profondeurs (entre 800 et 1500 m) pour entrer en diapause (une sorte d'hibernation). Le contrôle de la profondeur des copépodes ne se fait pas que par la nage mais aussi par la quantité de lipides dans le corps. En effet, les lipides sont moins denses que l'eau et donc plus il y a de lipides, moins il y a de densité, plus il y a de flottaison.
Or des chercheurs norvégiens ont découvert que les Calanus qui avaient trop mangé ont trop de goutellettes lipidiques et ne peuvent plus contrôler correctement leur profondeur. Ils ne peuvent plus redescendre à des profondeurs importantes et sont mangés par les prédateurs (qui au passage profitent des lipides en excès). C'est donc sans doute l'explication derrière le fait que certains Calanus entrent en diapause AVANT la fin de la période où la nourriture est abondante. La sélection naturelle dans ce cas a tendance à éliminer les Calanus trop gourmands qui se goinfrent jusqu'au bout et deviennent obèses et se font manger faute de descendre à des niveaux en sécurité.

Do the locomotion

2008-08-30T12:40:00.003+01:00

Un article de Nature cette semaine sur l'avenir (écologique) des trains avec une série d'innovations qui laissent néanmoins un peu sur notre faim. Première innovation : le train propulsé par un moteur à hydrogène testé par des japonais et bientot des danois. Ca ne produit certes que de l'eau au final mais ça ne fait que repousser le problème, il faut produire et compresser de l'hydrogène, ce qui nécessite de l'électricité et l'hydrogène est produit à partir du méthane donc pas une ressource renouvelable...Plus étonnant est le projet des anglais de revenir aux locomotives à vapeur. Plus question d'utiliser du charbon mais du diesel et du gasoil pour chauffer l'eau et créer la vapeur. Les systèmes pour bruler diesel ou gasoil sont suffisamment efficaces pour assurer un rejet quasi-nul de gaz toxiques et polluants style NOx et composés soufrés. Par le bilan carbone (rejets de CO2) est plus défavorable que pour une locomotive diesel classique qui, elle, produit plus des autres polluants (NOx etc...). Donc c'est un peu le choix entre la peste et le choléra...Autre innovation : il faut de l'énergie pour alimenter en électricité les gares (lumière, panneaux d'affichage...etc...). D'où l'idée des japonais d'utiliser le voyageur lui-même. Le sol légèrement mou de la gare cachent des éléments piézoélectriques qui transforment le petit enfoncement sous chaque pas des voyageurs en électricité. De plus, on peut faire passer les voyageurs dans des tourniquets (comme dans le métro parisien) pour valider leur billet. Tout cela permet de produire une partie de l'électricité dont la gare a besoin (on ne précise pas quelle fraction dans l'article). Enfin, on termine par le Maglev ou Transrapid où train magnétique dont j'ai déja parlé ici. C'est à mon avis le moyen le plus intelligent de faire baisser le relargage de CO2 en substituant à l'avion (et à la route) un mode de transport super-rapide (400 voire 500 km/h) de centre-ville à centre-ville, ce qui va avoir pour effet de tuer toute l'aviation court et moyen courrier si le réseau est à l'échelle européenne par exemple. La dépense électrique pour aller aussi vite n'est pas si énorme que ça car le train est en lévitation donc pas de frottement rail-roue (restent les frottements de l'air sauf à être dans un tube sous vide). En attendant que cela se concrétise peut-être un jour...(les allemands viennent de renoncer à un projet de liaison transrapid par contre les chinois vont prolonger la voie existante reliant Shangai à son aéroport à une autre ville distante de 150km) une vidéo à bord du seul transrapid en exploitation à l'heure actuelle en Chine. Ca décoiffe !

Les moustiques prennent le métro

2008-08-18T13:53:00.004+01:00

Une jolie histoire évolutive parue dans la presse scientifique il y a quelques années (Byrne et al. Heredity 82, 7 (1999)) mais que je n'ai découvert que maintenant grâce à un article du Libé de ce matin. Il s'agit d'une histoire de moustique à Londres. Certains moustiques de l'espèce Culex pipiens se sont faits piégés dans les souterrains du métro de Londres lors de sa construction et ces populations ont évolué pour donner une sous-espèce particulière appellée molestus. Ces populations ont des caractéristiques différentes (et héritables) par rapport à leurs cousins restés à l'air libre. Par exemple, ils s'attaquent en priorité aux Mammifères et non aux Oiseaux, ce qui semble logique vu que le métro londonien grouille de Mammifères (!) et que les Oiseaux y sont plus rares...Et cette caractéristique persiste si on les confronte en labo à des oiseaux. Autres modifications, les populations souterraines n'ont pas de diapause hivernale (sorte d'hibernation) contrairement aux populations aériennes qui ont une telle diapause. Evidemment, la température souterraine est plus constante et relativement chaude. Plus besoin d'hibernation ! De plus, les variations de la durée du jour qui sont des élements déclencheurs de la diapause n'ont pas cours évidemment dans le métro. Autre caractéristique constatée par les chercheurs : les sous-populations du métro sont beaucoup plus fractionnées que les populations aériennes qui sont génétiquement plus homogènes. Cela vient du fait que les échanges génétiques entre les différents moustiques d'une ligne à l'autre voire d'une station à l'autre sont plus difficiles qu'à l'air libre. On pourrait bientot savoir quelle ligne de métro et quelles stations on a fréquenté en fonction du pedigree du moustique qui nous a piqué !!

De bons Allen

2008-08-06T21:24:00.004+01:00

Je viens de voir coup sur coup deux des plus récents films de Woody Allen "Match Point" et "Scoop" et ce sont des réussites. Allen a réussi à sortir de sa série de films (excellents par ailleurs) sur un intellectuel-juif-newyorkais-névrosé pour nous offrir des intrigues brillantes, très finement scénarisées avec un art consommé du suspens. Les deux films ont en commun de se passer à Londres (aussi somptueusement filmé que l'était Manhattan à une autre époque) et d'avoir dans un des rôles principaux Scarlett Johannson qui joue beaucoup mieux que son look de bimbo blonde laisse penser. "Match Point" est sans aucun doute le plus dramatique, le plus sombre et le plus réussi des deux. Le film commence doucement mais les trente dernières minutes sont absolument "breathtaking" comme disent les ricains. C'est une réflexion sur ce que veut dire la chance, illustrée dès l'ouverture du film par une balle de tennis qui ricoche sur le haut du filet et qui peut tomber d'un coté comme de l'autre au bout de sa chute. Le dénouement du film dépend de l'issue de cette situation sauf que ce ne sera ni un filet de tennis, ni une balle (de tennis) qui seront en jeu. "Scoop" est plus léger, ne serait-ce que parceque malgré tout Allen ne peut s'empêcher d'apparaitre dans le film et de distribuer ses légendaires réflexions philosophiques. Mais le propos général est loin d'être comique et est une réflexion sur la vérité, les apparences et les preuves.
Pour finir, une petite sélection de dialogues extraits de ces deux films (tout droit sorti du site imdb.com) :

Match Point:

Nola Rice: He saw me across the room and he honed in on me like a guided missile.

Christopher "Chris" Wilton: Sophocles said, "To never have been born may be the greatest chance of all."

Christopher "Chris" Wilton: It would be fitting if I were apprehended... and punished. At least there would be some small sign of justice - some small measure of hope for the possibility of meaning.

Christopher "Chris" Wilton: The man who said "I'd rather be lucky than good" saw deeply into life. People are afraid to face how great a part of life is dependent on luck. It's scary to think so much is out of one's control. There are moments in a match when the ball hits the top of the net, and for a split second, it can either go forward or fall back. With a little luck, it goes forward, and you win. Or maybe it doesn't, and you lose.

Scoop:

Sid Waterman: Well did you accomplish anything besides a possible pregnancy?

Sid Waterman: I was born into the Hebrew persuasion, but when I got older I converted to narcissism

Sondra Pransky: How can we meet him?
Sid Waterman: You know, I don't know... They have a class system. He's an aristocrat and, you know, we're... we're commoners. In fact according to his system, we're... I think we're probably classified as scum.

Sid Waterman: I was in the lounge, I heard you drowning, I finished my tea and scones and came immediately!

Sid Waterman: You know not everything in the world is sinister... just practically everything.

Sid Waterman: This guy must be some lover if you're ready to drop the whole investigation! I must find out what breakfast cereal he eats...

Le Figaro refait la classification des espèces

2008-07-26T13:21:00.005+01:00

J'avais déja dénoncé ici les articles du "Monde" qui sont quelquefois bourrés d'erreurs zoologiques. Il semble que le "Figaro" va bientôt faire partie du palmarès, grâce à cet article sur la mort pour l'instant mystérieuse des huitres sur les cotes européennes (8 milliards de mort ! on cultive donc plus d'huitres en Europe qu'il n'y a d'êtres humains sur Terre...). L'auteur au détour d'une phrase traite les huitres de Crustacés, sans doute à cause de la coquille calcaire. Mais évidemment l'huitre est un Mollusque et la coquille calcaire est une jolie convergence évolutive avec la carapace calcifiée des Crustacés. C'est quand même de la zoologie élémentaire et un collégien devrait savoir cela. Sauf qu'en général il ne le sait pas car désormais dans les programmes jamais on ne passe en revue les différentes espèces les plus courantes et jamais on ne les classe systématiquement dans les différents groupes d'animaux. Bilan, la population générale est complètement ignare des bases de la classification des espèces. Est-ce grave ? Oui, la culture générale de tout citoyen doit comporter une vision claire des bases du monde vivant et tout particulièrement de ce qu'il mange sinon on peut lui faire avaler n'importe quoi...

Le secret de l'horloge des serpents

2008-07-17T11:10:00.004+01:00

Le nombre de vertèbres est l'une des caractéristiques très précisément controlée au cours du développement embryonnaire pour chaque espèce (de Vertébré bien sur). Les champions en la matière sont les serpents qui peuvent avoir des centaines de vertèbres (jusqu'à 500 pour les plus longs). Et il fallait bien sur trouver une explication concrète moléculaire et cellulaire...Elle vient d'être apporté dans un article de Nature d'aujourd'hui (Gomez et al.). On sait depuis longtemps que les vertèbres sont issues de structures répétées le long de l'axe avant-arrière de l'embryon qu'on appelle les somites. Or ces somites sont issus d'un tissu non divisé, le mésoderme pré-somitique qui se débite épisodiquement en rondelle de saucisson, les somites justement. Ce mésoderme pré-somitique crée une nouvelle rondelle de somite de manière très précise, par exemple toutes les 90 minutes chez l'embryon de poulet jusqu'à donner le nombre total de somite caractéristique d'une espèce qui correspond (en gros) au nombre de vertèbres. Le contrôle temporel de ce phénomène a été expliqué par une horloge moléculaire, c'est-à-dire des gènes qui s'expriment puis s'éteignent de manière régulière (selon un mécanisme trop compliqué à expliquer ici mais parfaitement connu). A chaque vague d'expression correspond la formation d'un somite. Chez les serpents, l'horloge tourne beaucoup plus vite que chez les autres vertébrés, c'est-à-dire que la succession allumage/extinction de gènes va jusqu'à 4 fois plus vite, ce qui aboutit à débiter plus de rondelles de saucisson (somites) par unité de temps. Au final, beaucoup plus de somites et donc de vertèbres. En compensation, histoire que les somites ne soient pas trop petits, le nombre de divisions cellulaires dans le mésoderme pré-somitique est aussi plus élevé, ce qui compense partiellement les effets de l'emballement de l'horloge. Maintenant, comme d'habitude on ne fait que repousser le problème : quels gènes font accélérer l'horloge ??

And the winner is...

2008-07-10T18:33:00.002+01:00

Je suis en train de redécouvrir "Questions pour un champion" à l'occasion de l'achat d'un jeu vidéo qui permet de participer virtuellement à l'émission comme candidat face à des joueurs pilotés par l'intelligence artificielle ou d'autres joueurs réels.
Je me souviens que je regardais ce jeu régulièrement au début des années 90, quelquefois avec ma grand-mère tchèque qui ne comprenait pas un mot aux questions mais qui suivait quand même passionément ce jeu (ah, ce beau Julien Lepers !). Le jeu vidéo reconstitue tous les "Lepersismes" ou "Lepersinades" avec envolée des fameuses fiches jaunes quand il y a une belle victoire, phrasé scandé dès qu'il dit le titre du jeu...etc...mais ça tombe un peu à plat car on sent que le pauvre Julien a enregistré ces séquences tout seul dans le studio et pas au cours d'un "vrai" jeu.
Je me débrouille plutot bien, en fait je n'ai perdu qu'une fois (en une dizaine de jeu) et en plus sur une question de biologie : dans le face-à-face on en était à égalité 11/11 et j'ai pas su trouver tout de suite "la mangrove", ce que mon adversaire (virtuel) a découvert quand je lui ai passé la main. Heureusement que je dis à mes étudiants de ne pas oublier la mangrove quand il s'agit de parler de la faune et de la flore du littoral...

Voir aussi une petite séquence amusante tirée du jeu réel.

De l'usage de stupéfiants et autres substances hallucinogènes chez les concepteurs des sujets de philo au bac

2008-06-16T19:20:00.003+01:00

C'est peu dire que l'un des sujets de philo de la série littéraire au bac m'a laissé complètement stupéfait : "La connaissance scientifique du vivant est-elle possible ?". Quel est l'intérêt de poser une question dont la réponse est tellement évidente ? Et dans le contexte où on démantèle le département des sciences du vivant du CNRS, c'est une véritable provocation !!
Je sais certes, qu'il faut remettre en question tous les sujets sans tabous, mais là je crois qu'objectivement il n'y a qu'une seule réponse possible à cette question. Ou alors cela veut dire que Pasteur et Darwin, parmi les esprits les plus brillants qui ont eu la grâce de fouler cette planète, ont fait une oeuvre complètement inutile voire inexistante (car impossible si je reprends l'antithèse de la question posée). Je pense en fait qu'il s'agit d'un sujet très mal posé. La question aurait du être "Une connaissance du vivant en dehors de la science est-elle possible ?", ce qui est plus ouvert et infiniment plus intéressant. Par exemple, l'agriculteur du néolithique, les jardiniers, le chasseur-cueilleur paléolithique ont une connaissance du vivant mais est-elle scientifique ? Ca c'est intéressant.
Mais avec le sujet tel qu'il a été réellement posé, je voudrais me transformer en petite souris et lire quelques copies de bacheliers derrière l'épaule des correcteurs. Le sujet a été posé aux séries littéraires donc il faut malheureusement s'attendre à une avalanche d'erreurs factuelles sur la biologie. J'attends aussi de pied ferme un corrigé de ce sujet hallucinant, ça devrait être un des textes de haute voltige de br...ette intellectuelle et complètement stérile (donc).

Whatever may have happened

2008-06-07T12:22:00.003+01:00

Il y a de nombreux évènements culturels pourtant heureux qui auraient pu arriver, et qui ont même été à deux doigts d'arriver mais qui ont échoué à la dernière minute. Concernant Michael Jackson, il y en a des dizaines comme par exemple le duo prévu de Jackson et Prince sur la chanson "Bad". La chanson avait d'ailleurs été écrite spécialement pour cela, ce qui explique d'ailleurs sa structure bizarre et notamment le couplet "de trop" qu'il y a entre le premier et le deuxième refrain ("Your talk is cheap....etc..."). Ce couplet était prévu pour Prince. Michael l'a gardé dans la version finale où il chante tout seul mais ça déséquilibre la chanson.
Autre exemple, lors de la promotion de l'album "Invincible" en 2001-2002 il était prévu de sortir en vidéoclip "Unbreakable" et "Whatever happens". Tout est tombé à l'eau à cause de la maison de disque Sony qui a arrêté la promotion pour faire pression sur Michael pour qu'il revende la part qu'il détient dans les droits des chansons des Beatles (une histoire longue et complexe...). Donc, pas de clip, pas de choréographie (ni même sur scène car pas de tournée), pour "Whatever happens" qui est un véritable petit bijou musical. Donc je me propose de réparer cela en imaginant une choréographie possible présentée sur ce lien. Il a fallu fondre le style de Jackson dans un style hispano-arabisant plus coulant, même si le caractère changeant de la chanson permet de retrouver de temps à autre du pur style Jackson.
Et en guise de récréation, une choré 100% Jackson garantie sans additif ni conservateur sur "Jam", l'un des funk les plus durs du répertoire sur ce lien.

Profitez en. Je ne sais pas si dans 5-10 ans je serai encore capable de faire ces trucs.

Indiana Jones et le royaume des crânes d'oeufs

2008-05-31T16:10:00.004Z

En trentenaire régressif et nostalgique des années 80, je me devais de voir le dernier Indiana Jones. Le premier, L'arche perdue, était brillant malgré une fin un peu ratée (déja...on va y revenir...); le second, le temple maudit, était un peu dans la surenchère mais ça passait; le troisième, la dernière croisade, était génial et je ne m'étais plus autant amusé au ciné jusqu'à Pirates des caraïbes ou American Beauty (dans un autre genre...). Le quatrième suit un peu la trajectoire d'une cascade (sans mauvais esprit sur une des parties de l'intrigue). Le début est génial, brillant et inventif. Ensuite, on a l'impression que les scénaristes ont rempli point par point le cahier des charges d'un Indiana Jones : il faut :
* des temples qui s'effondrent
* des autochtones primitifs très...primitifs
* la course-poursuite de 20 minutes avec rebondissements multiples
* la scène "alibi" à l'université pour nous rappeler que Jones est un prof
* des bébêtes repoussantes (alors les serpents c'est fait, les rats c'est fait, les cafards c'est fait; ah oui ! bien sur les scorpions et les fourmis mangeuses d'homme !)
* le running gag avec le chapeau d'Indiana
* la carte mystérieuse avec plein de dessins qu'on comprend rien dessus
* la relation chaotique père-fils
* caser quelque part le "gag" de la fille qui donne un coup de pied dans les c....es d'un héros
* des tombes avec des cadavres à des états de décomposition divers
A la fin du film, on est en bas de la cascade. C'est assez mauvais et totalement prévisible : Non Steven, pas le vaisseau spatial, non, pas le vaiss...eh si ! c'est un vaisseau spatial ! Ne pensez pas que je suis vicieux et que je vous dévoile la fin, de toute manière on le voit arriver à des kilomètres en jaune fluorescent et clignotant. En fait, ce film c'est la version agitée de "téléphone rentrer maison" de ET. Et il y a une morale à tout ça : la connaissance c'est mieux que l'or. Et l'un des personnages nous le dit au cas où on n'aurait pas compris...
Malgré tout, on passe quand même un bon moment et puis il y a Cate Blanchett. Ah ! Cate...

De Materpiscis et des articles foireux du "Monde"

2008-05-30T19:41:00.004Z

Dans le dernier Nature du 29 mai, on annonce la découverte d'un des plus ancien embryons fossiles connu qui appartient à une nouvelle espèce du genre bien nommé (vous verrez pourquoi) Materpiscis, un poisson placoderme. Les placodermes sont des poissons gnathostomes (à machoire) exclusivement connus à l'état de fossile. Ils ont vécu il y a environ 400 millions d'années environ (du silurien au dévonien). Leur tête et leur thorax étaient recouvertes de plaques renforcées d'où leur nom. La surprise est venu du fait que l'embryon a été découvert dans le ventre de sa mère et reliée à elle par un cordon ombilical formé à partir du sac vitellin, une situation que l'on retrouve actuellement chez certains requins. Même certains Mammifères ont des placentas qui se forment de manière similaire. On a donc un exemple fossile de viviparité vraie c'est à dire une incubation d'un embryon dans les voies génitales femelles avec nutrition par la mère. C'est bien sur exceptionnel chez les poissons et c'est encore plus exceptionnel de l'avoir trouvé chez un fossile. La viviparité est clairement apparue des multiples fois de manière indépendante au cours de l'évolution : chez les insectes (si, si, chez la mouche tsé-tsé), chez les requins, chez les placodermes (donc), chez certains amphibiens (salamandre noire) et reptile et bien sur chez les mammifères marsupiaux et euthériens.
La fête est un peu gâchée par l'article que Le Monde a publié sur le sujet. L'auteur, Christiane Galus (qui n'en est d'ailleurs pas à ses premières bêtises : si mes souvenirs sont bons, il y a quelques années c'est elle qui avait traité les trilobites de poisson ce qui est une monstrueuse hérésie que même mes élèves les plus nuls ne feraient pas (et c'est pas peu dire...)) a accumulé les erreurs parlant d'un cas d'ovoviviparité (alors que les auteurs de l'article précisent bien justement que ce n'est pas de l'ovoviviparité (car ici l'embryon n'est pas juste "incubé" dans les voies génitales maternelles mais en plus il y est nourri par la mère). Donc elle ne sait pas lire correctement les articles. Ensuite, il y a cette phrase monstrueuse : "il y a 375 millions d'années, certains poissons osseux ont transformé leurs nageoires en membres pour se hisser sur la terre ferme". Totalement finaliste et complètement faux, puisque les nageoires (paires) se sont transformés en membre AVANT la sortie des eaux et le fameux "hissage" sur la terre ferme. Je crois qu'il y a un plan de licenciement au Monde. Je connais une très bonne candidate pour le départ...

Adoptez un Massospondylus

2008-05-17T16:49:00.004Z

Cherchez l'erreur sur cette image !
Oui, je crois que ça crève les yeux que ce brave Massospondylus exposé ainsi au British Museum n'est pas un quadrupède mais un bipède. Or il a fallu attendre 2007 pour rectifier sa position à la suite d'un article dans une revue de paléontologie. Nos amis les Massospondylus sont des dinosaures du Jurassique de 4 mètres de long pour 135 kg en moyenne (très svelte finalement). Le premier fossile a été découvert par le britannique Richard Owen en 1854. A la fin des années 1970s, on a retrouvé des embryons de ces dinosaures (la première découverte de ce genre).
Ces embryons étaient assez âgés, quasiment près à éclore et sans dents, ce qui fait penser qu'ils ne pouvaient pas se nourrir par eux-mêmes et donc dépendait de papa-maman dinosaure. Des soins parentaux de dinosaure, rien d'exceptionnel; rappelons que les oiseaux sont des dinosaures. Les jeunes dinosaures de cet espèce étaient clairement quadrupèdes, ce qui fait dire que la quadrupédie des sauropodes sont ils seraient les ancêtres est un exemple de pédomorphose (rétention des caractères juvéniles). Enfin les Massospondylus avaient des os avec des cavités formant des sacs aériens, là aussi un caractère que l'on retrouve chez les oiseaux et qui a apparemment existé chez les dinosaures totalement indépendamment de la baisse de densité nécessaire au vol.

Questions pour un champion ?

2008-05-07T19:19:00.002Z

J'ai participé tout à l'heure au chat sur lemonde.fr et telerama.fr avec le
Ministre de l'Education Nationale M. Xavier Darcos.
Deux de mes questions ont été retenues. Je vous les retranscrits en dessous.
Vous pouvez voir l'ensemble du compte-rendu du chat sur le site
http://www.telerama.fr/monde/retranscription-darcos,28676.php

Patrick PLA : Quel est l'avenir des concours de recrutement des enseignants,
comme l'Agrégation ou le CAPES ? Jusqu'où ira la baisse du nombre de postes à
ces concours ?

Xavier Darcos : Nous recruterons 18 000 fonctionnaires l'année prochaine.
C'est un chiffre important. Ni le CAPES ni l'Agrégation ne seront remis en
cause. Nous souhaitons simplement, dans le cadre des équivalences européennes,
que les candidats à nos concours soient au niveau master.

Patrick PLA : Quand est-ce qu'on en finira avec le système idiot qui veut
qu'on envoie les enseignants les plus jeunes, les plus inexpérimentés et les
plus fragiles dans les zones d'éducation les plus difficiles ?

Xavier Darcos : Excellente question, sur laquelle nous nous sommes tous cassé
les dents. Je ferai des propositions en ce sens, mais je ne vois pas comment
imposer à un titulaire qui est en milieu de carrière de quitter un service qui
lui convient pour aller occuper un emploi plus difficile. Mais je le répète,
c'est une des sources de nos difficultés, notamment parce que nous avons
besoin, dans les zones sensibles, d'une stabilité des équipes pédagogiques.

Mon commentaire sur les réponses de Xavier Darcos :
Mauvaise foi absolue sur la première question : 18 000 est un chiffre important certes, c'est plus important que 17 999 effectivement... Le ministre se garde bien de nous dire le nombre d'Agrégés et de Capésiens les années précédentes. Il ne répond pas à la dernière partie de ma question sur la baisse. Pour l'équivalence Agrégation/Master il y a ambiguité : l'Agrégation est un concours et le Master un diplome. Darcos veut-il dire que tous ceux qui obtiendront l'Agrégation auront le Master ?

Deuxième question : eh bien si, Monsieur le Ministre, il faut imposer à un titulaire en milieu de carrière d'aller dans une zone difficile !! Car en échange en début de carrière il aura été en zone plus "facile" (même si ce genre de zone a tendance à se rétrécir...). Le temps passé dans des zones faciles ou difficiles restera le même à l'échelle d'une carrière mais réparti différemment dans le temps. Les enseignants en fin de carrière (plus de 50 ans) retourneraient dans les zones faciles et serviraient de tuteur pour leur collègue qui iront en zone difficile. Les enseignants sont, je pense, suffisamment matures et intelligents pour accepter ce "deal". Les syndicats peut être un peu moins....

Les fourmis et les champignons

2008-04-22T13:49:00.005Z

Encore une histoire de société animale mais cette fois-ci concernant les fourmis à travers un article paru dans PNAS (les compte-rendus de l'académie des sciences des USA) : Mueller et al., vol. 105, p. 5287. Elle concerne les fourmis qui cultivent des champignons pour se nourrir, un véritable équivalent d'élevage agricole dans le monde animal. Parmi ces fourmis, il y a les fourmis qui découpent les feuilles et font se développer sur ces feuilles des champignons dans des "niches" bien structurées de leur fourmilière souterraine gigantesque. Ces fourmilières peuvent survivre jusqu'à 20 ans (ce qui est une sorte de record) avec jusqu'à 10 millions d'ouvriers et le volume de champignon cultivés par fourmilière atteint le volume d'un bus. L'avantage de se nourrir de champignons est que le tissu mycélien est beaucoup plus dense et nutritif que le tissu végétal. La co-évolution fourmi-champignon et donc la révolution néolithique myrmécorienne a commencé il y a 50 millions d'années. Pendant 30 à 40 millions d'années, les fourmis prélevaient un morceau de champignon "sauvage" poussant dans la nature pour la fondation de chaque nouvelle fourmilière. Puis, il y a eu passage à un système plus fermé où les champignons se transmettent de fourmilière en fourmilière, la nouvelle reine emportant un morceau de champignon avec elle. Ce qui a changé la donne, car les populations de champignons cultivés n'échangent plus de gènes avec les populations "sauvages", ce qui a encore plus renforcé leur spécialisation et leur co-évolution avec les fourmis. La situation devient encore plus complexe lorsqu'on considère que les fourmis abritent sur leur cuticule une bactérie qui produit des molécules qui protègent les champignons contre un parasite du genre Escovopsis. Donc les fourmis fournissent à leurs champignons le gite, le couvert, la soupe et la pharmacie !

La reine, l'ouvrière et l'ADN méthyltransférase

2008-04-09T12:35:00.004Z

Quelques infos sur un article très intéressant paru dans un des derniers Science (Kucharski et al., Science, vol. 319, 1827-1830) qui apporte un début d'explication moléculaire à la différenciation des ouvrières et des reines au sein des sociétés d'abeille.

Petit rappel : Les abeilles mâles (les faux bourdons) sont issus de la parthénogénèse de la reine. Il s'agit du développement de l'ovule sans fécondation par un spermatozoïde et pour cause : la reine ferme le sphincter de sa spermathèque (l'organe qui stocke les spermatozoïdes obtenus lors des précédents accouplements) quand elle produit les mâles. Donc les mâles n'ont qu'un lot de chromosomes alors que normalement on en a deux (un lot de maman, un lot de papa).
Les abeilles femelles sont issus d'une reproduction sexuée avec fécondation (sphincter de la spermathèque royale ouvert). Les abeilles femelles deviennent ouvrières ou reine selon la nourriture reçue : toutes les larves sont nourries avec de la gelée royale pendant 3 jours (la gelée royale est une sécrétion des glandes hypopharyngiennes des ouvrières). Ensuite, seules les futures reines continuent à être nourries de gelée royale (et en grande quantité), les futures ouvrières sont nourries avec un mélange de pollen, de nectar ou de miel dilué. Seules les futures reines développent alors des organes sexuels matures. C'est un des cas les plus clairs de l'influence de l'environnement (ici la nutrition) sur la développement (ici en particulier la différenciation des organes sexuels et aussi sur la morphologie générale).

Comment ça marche au niveau moléculaire ? Les auteurs de l'article suggèrent que c'est une histoire de méthylation de l'ADN et donc de contrôle de l'expression des gènes. Un gène est plus ou moins exprimé selon l'état de l'ADN d'une région appellée promoteur. La méthylation, c'est-à-dire l'ajout d'une fonction chimique CH3 sur les protéines entourant l'ADN ou sur l'ADN lui-même modifie l'état de ce promoteur et donc l'expression du gène.
Les auteurs ont aboli artificiellement la fonction de Dnmt3, une ADN méthyltranférase, une enzyme qui accroche des CH3 sur l'ADN. Dans ce cas, la majorité des larves nourries selon la recette pour donner des ouvrières devient des reines avec des ovaires parfaitement matures ! Ils montrent en plus qu'effectivement la méthylation de certains fragments d'ADN est modifiée entre les futures reines, les futures ouvrières et les futures reines qui ont subi le siRNA et destinées initialement à donner des ouvrières.

Donc on a la démonstration d'une modification sur l'ADN (la méthylation) qui est déterminée par un facteur environnemental (la nourriture) (comment ? mystère pour l'instant...) et qui influence le développement des organes (notamment reproducteur) dans un contexte de société animale.

Des nouvelles de Sirius, Oscar, Julie et Rossy

2008-03-29T09:23:00.006Z

Un site suisse permet de suivre la migration des oiseaux et tout particulièrement des milans royaux qui ont été bagués avec l'équivalent d'un GPS. Chacun des milans a un prénom.
Aux dernières nouvelles, Sirius a parcouru 220 km en 24h de son lieu d'hivernage dans les Pyrénées vers l'Aveyron où il est encore. Va-t'il rester quelques jours la-bas ou va-t'il repartir pour la Suisse ? Le suspense est insoutenable...Oscar de son coté est déja retourné en Suisse. Il y est d'ailleurs depuis le 18 Janvier 2008 ce qui est un record de précocité pour un retour d'hivernage (un peu perturbé par le climat l'ami Oscar ??). Il est actuellement prêt de son nid de l'année dernière. Nichera-t'il à nouveau dans le même nid ? Pendant ce temps, Julie reste pénard en Espagne, près de Burgos et Rossy est déja en Suisse depuis le 13 février et vu son age nichera pour la première fois cette année. Bientot dans vos kiosques un magazine people sur les milans royaux. Je suis sur que cela serait plus intéressant que les magazines peoples classiques...

Six feet under toujours plus haut

2008-03-26T21:48:00.005Z

Je viens de terminer de voir la 5ème et dernière saison de Six feet under, confirmant que c'est sans doute la meilleure série télévisée faite à ce jour. La qualité d'écriture, de jeu et de réalisation est digne des meilleurs films et tous les thèmes essentiels de la vie (et de la mort) sont abordés avec originalité, humour, beaucoup d'émotion sans perdre de réalisme. Cela peut paraitre paradoxal pour une série qui fait parler les morts, mais c'est justement le "tour de force" réussi des scénaristes. Les trois derniers épisodes sont des chef-d'oeuvres du genre et les dernières 10 minutes où on découvre le destin final de tous les personnages est complètement bouleversant.
La vidéo en lien au-dessus est la campagne promotionelle pour la 5ème saison. En fait, toute l'histoire de cette saison est très habilement et subtilement codée dans ce film mais on ne peut s'en rendre compte qu'après avoir vu la fin !

En bonus, quelques phrases de dialogue piochés dans différents épisodes et tirées de leur contexte mais qui résument bien l'esprit :

Maggie Sibley: I know that if you think life's a vending machine where you put in virtue and take out happiness that you're going to be disappointed.

Claire: If we live our lives the right way then everything we do can become a work of art.

Nate: Why do you treat me like shit all the time, Brenda?
Brenda: Because I've had a really fucked-up life and I need sarcasm to hide how ridiculously miserable I am!

Officer Keith Charles: [talking to his gay friend David about marriage] You're in my will, I'm in yours. We basically are married, even if the law refuses to recognize it. But then again, I refuse to recognize most of the Bush Administration. I guess it all evens out.

Marc's Boyfriend: [of a blaring car stereo] Hey, so, does bad music make people deaf or do deaf people just have really bad taste in music?
Marc Foster: Well, there is Beethoven...

Margaret: Ruth, it isn't the '50s anymore, no matter how you dress.

Claire: So how have you been with your art?
Russell Corwin: I've been good. Been really really good. My work has gone to some amazing places since I got hit by a car.

Edie: I really like your penis. To bad you're attached to it.

Claire Fisher: I wish I was gay.
David Fisher: Ohh, no.
Claire Fisher: Well, then I wouldn't have to deal with unfamiliar sex organs!
David Fisher: They're all unfamiliar unless they're yours.

David Fisher: I forgot to pray. Can you believe it? I totally forgot to pray.
Claire: That's OK. God saved you anyway, right?

Ruth Fisher: I want to know why your other wives left you!
George Sibley: Because they asked too many fucking questions!

Nate Fisher: None of this turned out the way I wanted it to. I wanted to love you. I did love you. And I just felt like we were beginning to... I know we were. I know it in my heart. I feel like I had this once-in-a-lifetime chance and I fucked it up.
Lisa Kimmel Fisher: Nate, I'm not a chance. I'm a person.

Nate Fisher: [witnessing his open-casket funeral] Damn it, David, I told you I wanted to be cremated.

Nate Fisher: Will you hurry up? I don't want to be late for my funeral.

Claire: Let's just sleep together!
Edie: Now?
Claire: In a second. I need to brush my teeth

Les créationnistes contre-attaquent

2008-03-23T08:05:00.003Z

Un article intéressant sur une tentative d'interprétation créationniste des
mitochondries passée dans une revue scientifique avec peer-review (revue par
les pairs) pourtant réputée "sérieuse", Proteomics.

http://www.rue89.com/2008/03/22/quand-un-puissant-createur-sinvite-dans-une-revue-scientifique

Il s'agit d'une interprétation complètement farfelue, créationniste, noyée au milieu de données scientifiques relativement juste, ce qui la rend d'autant plus dangereuse.

Ce qui est très fort, c'est que quand on va sur PubMed (une base de données scientifique) pour voir le résumé de l'article en question, l'article a été retiré, non pas sous prétexte que son
contenu est en partie farfelu mais à cause du fait qu'il contient des "copier-coller" d'autres articles publiés par ailleurs !

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18214846

Le plus grave est que cet article ait pu intialement être publié la revue par les pairs, c'est-à-dire une relecture par des scientifiques indépendants. Ils ont certainement manqué de vigilance ou sont des crypto-créationnistes eux-mêmes.

Signalons que l'article (celui de rue89.com et non pas l'article de Proteomics
incriminé (D... nous en garde) a été écrit par une des mes anciennes étudiantes (Fabienne Gallaire).

Les fantômes du métro de Paris

2008-03-19T14:14:00.003Z

On trouve des articles très intéressants dans Wikipédia (c'est un pléonasme)...notamment sur les transports en Ile-de-France. Il y a notamment une page spéciale sur les stations de métro fantôme à Paris où l'on apprend que pas moins de 5 stations ont été construites...mais jamais ouvertes au public. Notamment une station de métro en plein milieu de l'aéroport d'Orly appellé Orly-Sud qui était prévu pour un prolongement de la ligne 7 qui n'est pas allé au-delà de Villejuif. Quand je pense que les voyageurs voulant se rendre à Orly doivent prendre le RER B (et contribuent à la surcharge chronique de cette ligne de RER (encore un pléonasme...)) et changer à Antony pour OrlyVAL alors qu'une liaison directe par métro était prévue...Le ministre des Transports à l'époque de la construction d'Orly avait posé la première pierre de la station, mais elle n'a jamais été inaugurée !
Mais les stations fantômes peuvent être ramenées à la vie : l'une de ces stations, Haxo, située entre la Porte des Lilas et la Place des Fêtes pourrait être enfin utilisée (plus de 70 ans après sa construction !) pour la ligne de métro 15 qui serait en fait la fusion entre les lignes 7bis et 3bis. C'est prévu pour 2013.

Miroir déformant

2008-03-18T19:21:00.004Z

Une intéressante initiative de l'Observatoire des Médias et de Rue89.com qui publient les cartes subjectives des pays du monde selon la fréquence des articles qui les traitent dans les journaux.
Voici la carte pour les journaux français. Plus c'est rouge, plus c'est gros, plus il y a d'articles. Outre l'évidente hypertrophie de la France, on voit que l'Afrique se résume à l'Algérie, au Maroc et à l'Afrique du Sud; que l'Amérique du Sud se résumé au Brésil et que la Colombie doit sans doute sa teinte orange pâle à cette pauvre Ingrid Bétancourt. L'ex-bloc de l'Est est un no-article land sauf peut-être la Pologne. La carte serait encore bien pire si on regardait les journaux télévisés : l'étranger se résume à Israël (et ses annexes palestiniennes), la Chine, les USA, la Russie, l'Allemagne et l'Angleterre sans oublier l'Irak, l'Afghanistan et le Pakistan. Même des pays pourtant peuplés et intéressants comme le Japon ou l'Inde sont très mal couverts à la télé.
Mais à part ça vous saurez tout sur la dernier micro-remaniement du staff de Nicolas S...

Lord of the parody

2008-03-14T21:27:00.004Z

Une brillantissime parodie des bonus que l'on peut trouver dans les DVD ou que serait-il arriver si "Lord of the rings" avait été tourné par Georges Lucas, le créateur de "Star wars". C'est assez critique sur une certaine manière d'aborder le cinéma qui montre bien la limite du système Star Wars.
Une autre parodie, cette fois-ci du conseil d'Elrond avec un Anneau Unique qui finit par être utilisé pour faire un piercing, je vous laisse imaginer où...C'est vraiment très drôle et c'est un superbe montage entre les images du film et des images "additionnelles".
Ensuite notons également un montage d'un remix "musical" sur la phrase culte de "Pirates des Caraïbes 2" : "I have a jar of dirt".
Enfin le Harry Potter rap.

Le tambour

2008-03-07T17:54:00.003Z

Je viens de terminer "Le tambour", un très bon livre de Gunter Grass. C'est l'histoire d'une personne internée dans un asile, Oskar, et qui raconte sa vie dans l'Allemagne et la Pologne aux destins tumultueux des années 30 et 40. Oskar raconte qu'il a décidé de ne pas grandir (c'est un nain) et de passer sa vie à jouer du tambour. Il est aussi doué d'un don qu'on qualifiera de castafioresque: celui de briser du verre par ses cris. La part de folie et de réalisme qui anime son récit sont complètement indiscernables, ce qui donne au texte un aspect totalement unique. Le genre du livre est d'ailleurs le "réalisme magique". Grass utilise aussi un procédé assez déroutant puisqu'il alterne souvent les phrases à la première et à la troisième personne, comme pour mieux montrer la schizophrénie du personnage. Le texte est très dense, avec une dizaine de bonnes idées narratives par page et un style qui évite soigneusement toute phrase simple et linéairement construite. Ca peut fatiguer à la longue et le livre aurait gagné à être 10% plus court. Mais les aventures d'Oskar et de sa famille valent le détour : notamment la scène où il attend un miracle en espérant que la statue de Jésus dans une église joue de son tambour, ou encore toute la description d'une situation familiale peu ordinaire où le mari de la mère d'Oskar (qui n'est pas son père) devient le père présumé du fils d'Oskar (relisez-le lentement...), ou l'observation nocturne de la réaction des passants lorsqu'il crée par sa voix des ouvertures dans les vitrines des bijouteries, ou encore une scène de pêche aux anguilles avec un tête de cheval comme appât.

L'attaque des éponges carnivores

2008-02-27T14:41:00.003Z

Ce n'est pas le titre d'un nouveau film d'horreur mais une découverte scientifique intéressante. Les Eponges ou Spongiaires sont des animaux à structure peu "élaboré" formé de deux couches de cellules organisées en une structure totalement asymétrique et remplie de pores qui permettent de faire circuler l'eau à travers l'animal. Les éponges (sauf notre cas) sont de pacifiques filtreurs qui mettent en mouvement l'eau dans les pores grâce à des cellules particulières appellés choanocytes qui agitent leur flagelle (un peu comme un spermatozoïde mais immobile). Les particules alimentaires (plancton, petites algues, déchets des poissons...) sont phagocytés (mangés) par les cellules.
Mais l'espèce découverte récemment (Asbestopluma hypogea, auteurs : Vacelet et Duport, publication en 2004) dans une grotte sous-marine méditerranéenne est toute différente. D'abord la structure évoque plutot un Cnidaire (un autre groupe d'animaux "simples" qui comprend les hydres d'eau douce, les méduses, les coraux...). Mais c'est bien un spongiaire. Ensuite son mode d'alimentation : il capture ses proies grâce à des filaments recouverts de spicules recourbés. Puis les cellules du reste du corps migrent vers la proie ainsi fixée pour la digérer. C'est un peu comme si vous allongiez le bras sur votre steack et que vos différentes cellules viennent tour à tour se servir un petit morceau en se déplaçant le long du bras !
Une digestion extracellulaire semble avoir lieu (ce qui est exceptionnel pour un Spongiaire où habituellement chaque cellule digère "pour soi" dans ses vacuoles de digestion après phagocytose). L'éponge semble aussi s'aider de la décomposition de la proie induite par des bactéries. Le tout peut prendre 8 à 10 jours pour les grosses proies.
Précisons que votre éponge de bain est tout à fait inoffensive...

Taratata

2008-02-24T17:46:00.004Z

Je signale que des dizaines de vidéos de chansons extraites de l'excellente émission "Taratata" sont disponibles sur ce lien.
Par exemple, on peut y trouver ce pur moment de grâce, "The bridge over troubled water" de Simon-Garfunkel chanté par Noa et Maurane ou "Brought to my senses" qui est une des meilleurs chansons (peu connue pourtant) de Sting ou un medley de Véronique Sanson qui est sympa même si elle chante faux de tant à autre. Pour trouver les vidéos il suffit de taper dans le moteur de recherche en haut de la page du site Taratata.

Il va y avoir du "Spore"

2008-02-14T18:58:00.002Z

On est très impatient de la sortie prochaine d'un nouveau jeu vidéo, conçu par le créateur des
Sims, appellé "Spore" dont un des aspects s'inspire TRES LIBREMENT de
l'Evolution. Il s'agit de faire évoluer des êtres vivants du microbe à des êtres intelligents capables de coloniser une autre planète (la fin du jeu ressemblera sans doute à "Civilization").
Comme on peut le constater sur cette vidéo de démonstration :

http://video.google.com/videoplay?docid=-394434397798392775&q=spore

le concept de base pour l'évolution des "créatures" sera le suivant : la créature doit manger (des créatures d'espèces différentes) et gagner des points ADN. Elle ne doit pas se faire manger. Elle
doit "séduire" une autre créature de la même espèce, et
se reproduire avec elle. On retrouve "manger, ne pas se faire manger, se reproduire" : les bases de la vie ! Une fois la reproduction effectuée, la créature doit protéger ses oeufs.
Pendant ce temps, vous faites évoluer les embryons dans les oeufs à l'aide des
points ADN engrangés au cours de la précédente génération. Plus il y a de
points ADN, plus vous pouvez modifier des paramètres et des formes de la
génération suivante, histoire de lui donner plus de chances de survie et de
reproduction. Les oeufs éclosent et le jeu repart pour une nouvelle
génération. Pendant ce temps, l'ordinateur a fait évoluer les autres créatures
de l'écosystème selon le même principe (ou les autres joueurs l'ont fait en
mode multijoueur). L'ordinateur peut aussi insidieusement modifier
l'environnement dans lequel évolue les créatures, modélisant des changements
des paramètres abiotiques (climat, niveau des mers, etc..).
Vivement Septembre !!

Du pet de mouche

2008-02-13T09:18:00.002Z

Une jolie étude dans le dernier Science sur le contrôle de la flore intestinale...de la mouche (mais pas n'importe quelle mouche, la célèbre Drosophile !). Alors évidemment ça fait sourire, mais si on avait à l'étudier chez l'humain (ou la souris) avec plus de 100 milliards de bactéries (chez l'homme) appartenant à plus de 500 groupes différents, ça serait beaucoup plus compliqué. En effet, la Drosophile ne possède des bactéries que de 25 groupes différents avec juste quelques espèces dominantes dans cet "écosystème" et bien sûr on a accès à tous les outils génétiques rapides développés pour ce modèle.
Les invertébrés comme la Droso possèdent une immunité en grande partie fondée sur la production de peptides anti-microbiens. Pour la flore intestinale, c'est les cellules intestinales qui produisent le cas échéant ces peptides. Or lorsqu'aucune bactérie pathogène n'est présente dans l'intestin il n'y a pas de production de ces peptides. La flore intestinale est auto-contrôlée (les bactéries d'une espèce inhibant la croissance d'une autre espèce) et les cellules intestinales produisent de faibles quantités de dérivés toxiques de l'oxygène qui évite tout "débordement". Mais pas de peptides anti-microbiens. La production de ces peptides est sous le contrôle d'une voie de signalisation Toll (qui est homologue à la voie NF-kB qu'on retrouve dans le système immunitaire des Mammifères). Or cette voie est activée ! Les chercheurs ont découvert que c'est la protéine Caudal qui empêche la voie de signalisation Toll d'activer la production de peptides anti-microbiens. Quand on bloque artificiellement la production de Caudal, les peptides sont produits et toute la flore intestinale est bouleversée (les bactéries les plus sensibles meurent d'abord ce qui déséquilibre toute la population) et cela aboutit à la mort de l'hôte Drosophile. Heureusement que chez nous, la flore intestinale est régulée de façon plus fine car nous aussi on peut tuer certaines membres de la flore intestinale lorsqu'on prend des antibiotiques (sinon les antibiotiques tueraient le malade...).
Point intéressant : la protéine Caudal tout comme Toll sont des vieilles connaissances en embryologie; Caudal est important pour la mise en place de l'axe antéro-postérieur de la Droso et la signalisation Toll pour son axe dorso-ventral. Encore un exemple du grand bricolage évolutif où les protéines contrôlant les axes de polarité embryonnaires sont réutilisés chez la larve et l'adulte, ici pour des fonctions immunitaires.

Le barbier de service

2008-02-05T20:00:00.000Z

Il était évident que j'irai voir "Sweeney Todd" au cinéma. Un Tim Burton avec un Johnny Depp dans le rôle du barbier "démoniaque "qui vous rase de très près, ça ne se refuse pas d'autant plus que se joint à la fête une bonne partie du casting d'Harry Potter à savoir Snape (Rogue) himself (Alan Rickman, fabuleusissime as always), Peter Pettigrew et Bellatrix Lestrange (Helene Carter Bonham qui recycle les victimes de son voisin en tourte à la viande).
Comme toujours macabre et humour noir sont au rendez-vous avec une efficacité maximale de mise en scène. Les mélodies de Danny Elfman sont remplacées par celles de la comédie musicale dont le film est tiré et les chansons se mêlent parfaitement au reste (et Depp a visiblement pris des bons cours de chant, peut-être avec sa Vanessa Paradis de femme). C'est très sanglant mais on survit (!); je pense que la notion de pression artérielle carotidienne est désormais une notion bien comprise du grand public...Et moi, je suis très content de mon rasoir électrique.

Rhétorique créationiste

2008-02-03T14:44:00.001Z

Un peu facile mais tellement vrai....

"Six pieds sous terre" vole très haut

2008-01-22T20:38:00.001Z

Nouvelle série culte : Six feet under. Il fallait oser une série sur une famille qui tient une petite entreprise dans les pompes funèbres et qui organise des enterrements. Chaque épisode commence par la mort d'une personne (dans les circonstances les plus "banales" ou les plus innatendues). Ensuite reprend l'histoire mouvementée de cette petite famille mais le mort de l'épisode va leur apprendre quelque chose, soit par le témoignage de ses proches sur sa vie lors de la préparation de l'enterrement, soit...directement. En effet, il n'est pas rare que les personnages (vivants) parlent aux morts...et inversement. Le père de famille qui est décédé dans le premier épisode revient d'ailleurs assez régulièrement guider ou se moquer de ses fils. Autres petites séquences intéressantes quand on entre dans l'imaginaire des personnages (vivants ou morts, vous aurez compris que la frontière est ténue...) et qu'on voit ce qu'ils pensent ou ce qu'ils craignent ou ce qu'ils espèrent. Le tout sans transitions avec le réel. Ca donne des scènes assez étonnantes.
La série a été initiée par Alan Ball, le scénariste d'American Beauty qui est fermement accroché à mon Top10 des films préférés. Les dialogues sont brillantissimes, comme dans Oz mais en plus subtil. Les personnages sont (évidemment) attachants et surtout superbement joués.
Voir par exemple l'une des meilleures scènes de ménage filmée
ou cette "touchante" scène mère/fille
ou encore le personnage principal visiblement sous l'empire d'une substance euphorisante dans une scène culte de la deuxième saison.

Miroir, mon beau neurone-miroir...

2008-01-20T20:59:00.000Z

Dans le dernier Nature de cette semaine, une étude sur les neurones miroirs. Ces neurones d'une région du cerveau appellé cortex "pré-moteur" qui prépare en quelque sorte nos actions motrices ont un comportement assez fascinant. Ils sont activés à la fois lorsqu'on exécute une action et lorsqu'on observe un autre individu (de la même espèce ou d'une espèce proche (singe-homme ça marche)) faire la même action. Ces neurones auraient un rôle dans l'apprentissage par imitation, qui est massivement utilisé par les bébés pour progresser. En gros, ils serviraient d'une sorte de miroir interne qui compare ce qui a été vu chez les autres avec ce que l'on souhaite exécuter.
Ils seraient aussi impliqués dans l'empathie c'est-à-dire dans le fait que l'on se met à la place d'une personne qui souffre ou qui a une certaine émotion (pleur, rire, dégout...). Les autistes (et certains psychopathes) auraient des défauts de fonctionnement des circuits neuronaux impliquant les neurones miroirs.
Les auteurs de l'article de Nature ont isolé une classe de neurones miroirs activés chez les oiseaux lorsqu'ils entendent un chant et qu'ils chantent ou essaient de chanter ce même chant. Leurs rôles seraient d'aider au système d'essai-erreur qui permet à un oiseau d'apprendre le chant caractéristique de son espèce ou même plus finement du chant caractéristique de son "état émotionnel" (alerte, sélection partenaire sexuel..etc...) lorsqu'une espèce possède un répertoire diversifié de chant.
Moi qui ai d'assez bonnes capacités à retenir et à restituer très vite une mélodie, je dois avoir des neurones miroirs performants !

Vénérons le spaghetti géant !

2008-01-11T16:39:00.000Z

Une initiative très intelligente de chercheurs en physique américains qui ont inventé une nouvelle "religion" : la religion du spaghetti monstrueux volant.
Les adeptes de cette nouvelle religion sont les Pastafarianistes.
Cette nouvelle religion a été fondée pour faire face au développement aux USA de la théorie de l'Intelligent Design qui veut que les espèces vivantes aient été dessinées par Dieu ou qu'il a orienté l'évolution de telle manière qu'on arrive à la situation aujourd'hui : l'homme et des espèces animales et végétales (pour le servir bien sur). Les partisans de l'intelligent design ont souhaité que leurs théories soient présentées à égalité et en même temps que les théories scientifiques darwiniennes sur le sujet dans les classes (les enfants croient toujours plus facilement au Père Noël, non ?).
L'idée des Pastafarianistes n'est pas tant de fustiger la religion que de la combattre lorsqu'elle se prend pour de la science. Il ne faut pas confondre croyance et preuve. Or il n'y a pas plus de preuves en faveur des mythes et dogmes classiques des religions et de l'intelligent design que de preuves que l'homme a été crée par une entité à la forme de spaghetti géant et monstrueux. On touche du doigt une chose essentielle à comprendre au sujet des religions : on peut parfaitement dire n'importe quoi, tant qu'il y a des gens pour y croire...Le principe de réalité n'est pas un principe pertinent en matière de religion.
Autre élément apporté par les Pastafarianistes : la croyance que le réchauffement climatique est causé par la baisse du nombre de pirates à partir des années 1800s. C'est dans le but de montrer en fait par l'absurde qu'une corrélation n'indique pas forcément une relation de cause à effet. C'est une notion qui est à la base de la pratique scientifique de tous les jours et une notion de logique élémentaire mais qui est une notion qui a beaucoup de mal à passer chez certains, qui établissent des connexions magiques entre deux évènements parfaitement indépendants.

Trop de plancton tue le plancton

2008-01-08T20:48:00.000Z

Intéressant article dans Libé de ce matin sur la société Planktos qui cherche à, je cite, "sauver le monde tout en faisant un peu d'argent". Cette société se donne pour but de fertiliser les océans avec du fer de telle manière à doper le développement du plancton marin. Le développement du plancton marin est freiné par des facteurs limitants dont la carence en fer (en ions issus de l'atome de fer pour être plus précis) est la plus importante. Or une partie du plancton (le phytoplancton) absorbe du CO2 lors de son développement par photosynthèse. D'où l'idée simple, de faire pousser le plancton qui absorbera notre CO2 en trop en ajoutant du fer dans les océans et youpi, la vie est belle...Des essais scientifiques de ce genre de fertilisation ont déja été faits et ont donné des résultats satisfaisants dans certaines cas (d'où l'expression d'un océanographe : "Donnez-moi un demi-tank de fer et je vous crée un age glaciaire" (beaucoup de CO2 absorbé donc moins d'effet de serre)). Mais les conséquences de manipulations de bio-géo-ingénierie à grande échelle ne sont pas connues. D'ailleurs le stockage de CO2 pourrait s'avérer de courtes durées puisque le surplus de plancton finirait par être dégradé par des bactéries qui rejettent du CO2. La forme de distribution de fer pose problème et ne correspond pas aux formes du fer apporté naturellement (venant du fond des océans ou des particules érodés du continent portées par le vent). Enfin, le ratio fer mis/CO2 avalé est bien trop optimiste dans les prévisions de notre société-Superman qui compte gagner de l'argent en revendant le CO2 englouti (ou plutot les estimations de CO2 engloutis car tout cela est difficilement mesurable...) sur le marché international du carbone.
En plus, les conséquences écologiques sont difficilement estimables à l'heure actuelle. La prolifération du plancton butera forcément assez vite sur un autre facteur limitant. Ensuite, tout la chaine alimentaire sera perturbée. Enfin, certaines espèces planctoniques produisent des toxines néfastes pour l'homme comme on en a déja parlé ici.
Donc Planktos est prié d'aller sauver le monde ailleurs...

Le premier rallye Paris-...Paris

2008-01-04T12:22:00.000Z

Et commençons l'année par une excellente nouvelle. Le rallye Paris-Dakar est annulé ! Certes, pour des raisons peu réjouissantes (menaces terroristes notamment en Mauritanie). Mais cela fait longtemps que ce genre de rallye aurait du être éliminé de même que les rallyes plus "locaux" sur des circuits et bien sur les courses de Formule 1. Quand on imagine la quantité de CO2 et de pollution que ces activités génèrent parfaitement "inutilement" !! Certes, cela ne doit être qu'une petite fraction de ce qui est produit par la circulation automobile mondiale mais c'est toujours ça de gagner et bien sur cette suppression aurait une dimension symbolique forte. Le temps où les "transports" étaient un divertissement sans conséquence est terminé (cela dit, si j'étais cohérent on devrait aussi supprimer tous les petits trains touristiques à vapeur, mais bon ça reste des trains, qui polluent beaucoup moins par "tête" transportée que les bagnoles...).
Ce genre de course ne sert qu'à s'enrichir pour certains et je ne suis pas sûr que les nouveautés technologiques développées pour les voitures et les motos à l'occasion de ces courses ne puissent pas être faites à d'autres occasions et ne servent souvent qu'à gagner de la vitesse, ce qui est évidemment parfaitement inutile sur route.
On peut d'ailleurs aussi se demander si il reste une dimension humaine au sport automobile tant la technologie semble désormais prépondérante, surtout en Formule 1. Et cela, à l'heure où même dans les sports classiques, la biotechnologie semble dominer...

La Bible du Diable

2007-12-22T19:45:00.000Z

Une jolie histoire découverte par hasard grâce à la fonction "Pages au hasard" de Wikipédia. Il s'agit de la "Bible du diable" ou Codex gigas, un livre manuscrit médiéval tchèque de 75 kg, mesurant presque 1 mètre de hauteur. Le parchemin est fait à partir de peaux de 160 veaux environ. Il contient 624 pages, il manque 8 pages mystérieusement arrachées. C'est l'un des plus grands livres du monde et sans équivalent dans le monde médiéval. Il a été réalisé vers 1229 dans un monastère bénédictin tchèque de Podlazice près de Chrast et Chrudim à quelques kilomètres au nord du village (Holosiny) où j'avais l'habitude de passer mes vacances d'été. La similitude parfaite des lettres d'un bout à l'autre du livre indique que c'est une même personne qui a sans doute tout rédiger (ce qui a demandé 12 ans de travail d'après diverses estimations). La légende veut qu'un moine ait écrit ce livre en une seule nuit avec l'aide du Diable fièrement dessiné à la page 290 et qui est vraiment sympa (cf. photo). Les textes sont des copies de divers traités dont les fameuses Chroniques de Bohême de Cosmas.
Le livre a subi une histoire mouvementée. Il a été donné à des moines de Sedlec près de Kutna Hora puis au Monastère de Brevnov près de Prague. Les raids hussites du début du XVème siècle ont détruit son monastère d'origine et le monastère de Brevnov a été pillé mais les moines réussirent à sauver le livre et à la cacher dans un monastère fortifié à Broumov. Il réapparait dans les collections de l'Empereur Rudolf II à Prague. Mais durant la guerre de Trente Ans, les forces suédoises assiègent et pillent Prague en 1648 et mettent la main sur le manuscrit et l'emporte en Suède où il est actuellement. Ca serait bien que les Suédois le rendent aux Tchèques, maintenant qu'ils sont devenus plus civilisés.

Un premier cadeau pour Noël

2007-12-21T20:37:00.000Z

Ouf ! La raison l'a emporté et c'est bien Peter jackson qui réalisera Bilbo Le Hobbit, la pré-quel du Seigneur des Anneaux. Voir ce communiqué. Il y avait à peu près un an, je me lamentais ici qu'une vilaine querelle juridique empêche cette réalisation.
La surprise vient du fait qu'il y a deux films de prévu. J'avoue ma perplexité car le livre me semble pas suffisamment épais pour faire deux films... A suivre.

Une boussole presque correcte

2007-12-09T19:12:00.000Z

Je viens de voir l'adaptation au cinéma du premier épisode des "Royaumes du Nord", "La boussole d'or" d'après la magnifique histoire de Philip Pullman. L'impression est mitigée. D'un coté, les effets spéciaux sont OK, les décors et notamment les batiments superbes, le casting est très bon avec une Nicole Kidman acide à souhait en Mrs Coulter, une Lyra extraordinaire jouée par la jeune Dakota Blue Richards, la voix de mon cher Ian McKellen pour l'ours Iorek et même une apparition éclair de Christopher Lee qui décidément aura tout fait, du Seigneur des Anneaux, à Star Wars en passant par les derniers Tim Burton (il ne manque plus que de lui trouver une place dans un des derniers Harry Potter et les prochaines Chroniques de Narnia...). Le principal défaut est que ça va beaucoup trop vite, on zappe d'une scène à une autre et l'histoire aurait mérité un développement plus important et que l'on se pose de temps en temps. Pourtant, le film ne fait que deux heures et donc on aurait bien pris une vingtaine de minutes de plus sans problème et sans activer le fameux "bladder effect" (l'effet vessie). J'ai détesté les premières secondes du film où presque toute l'explication de la trilogie est dévoilée (on explique la "Poussière", le passage entre les mondes alors que cela aurait mériter de rester mystérieux).
Le film est critiqué par des groupes religieux pour promouvoir l'athéisme. Effectivement, c'est un de ses intérêts majeurs, surtout comparé au pro-christianisme dégoulinant et béat des "Chroniques de Narnia". Le combat de Lord Asriel ressemble d'ailleurs à celui de Giordano Bruno, brûlé vif en 1600 par l'Eglise car il pensait qu'il existe un univers infini peuplé de multiples mondes analogues au nôtre.

La mémoire visuelle du singe

2007-12-04T19:51:00.000Z

Une expérience au résultat complètement étonnant publié dans le dernier Current Biology et relaté par Le Monde. Les chimpanzés ont clairement une meilleure mémoire visuelle que les humains. Les chercheurs japonais ont appris aux chimpanzés à reconnaitre les chiffres et leur ordre croissant (ce qui déja nécessite de bonnes capacités d'abstraction; un enfant humain de 2 ans n'en est pas (encore) capable). Puis ils ont joué à une forme moderne de "Memory". Cinq ou six chiffres apparaissent dispersés dans le désordre sur un écran. Ces chiffres sont rapidement (en moins d'une seconde) recouverts par des carrés blancs et il faut toucher ces carrés dans l'ordre croissant des chiffres qu'ils masquent. Et bien les chimpanzés ont été bien plus doués à ce petit jeu que des étudiants. La vidéo disponible ici est d'ailleurs assez bluffante. J'ai été incapable de mémoriser quoi que ce soit alors que le chimpanzé n'a visiblement pas de problème. Pour vérifier j'ai du faire arrêt sur image quand les chiffres apparaissent et le chimpanzé ne se trompe qu'une seule fois sur toute la série.
Bref, encore une leçon de modestie pour notre espèce.

La dérive des (in)continents

2007-11-30T12:16:00.000Z

Pour fêter le 100ème message de ce blog, voici une grande nouvelle : un nouveau continent est en train d'apparaitre dans le Pacifique Nord ! Un continent digne de notre époque, le Poubellifère.
Voir ce lien et aussi celui-ci.

L'histoire du sous-marin de Troie

2007-11-28T20:08:00.000Z

Je viens de revoir "Troie" en DVD et je me rends compte que le film a été réalisé par Wolfgang Petersen, qui est un réalisateur allemand passé à Hollywood. J'ai vu trois films de lui et on a du mal à imaginer que l'on a affaire à la même personne. D'abord, étant petit, j'ai vu de lui "L'Histoire sans fin", qui a été à la base de tout mon intérêt pour les films et les récits fantastiques. J'avais visité au cours d'un voyage en Allemagne (échange avec une correspondante allemande) les studios à Munich (Bavaria Studios) et c'était bien encore l'époque des effets spéciaux sans effets numériques (à part le fameux écran bleu qui peut d'ailleurs devenir vert si il y a un élement bleu dans les personnages) où il fallait des trésors d'imagination pour faire tout fonctionner et pas seulement "chauffer du silicium" sur l'équivalent animation de Photoshop. Entre parenthèses, signalons que les suites de ce film, le II et surtout le III (non réalisés par Petersen) sont des navets purs et simples, tellement mauvais que cela devient un divertissement à part entière de lire les commentaires assassins des spectateurs sur imdb.
Le deuxième film est "Das Boot" que j'ai emprunté à la biblio-vidéothèque de ma ville (qui n'a pas (encore) brulée). J'ai pris la version longue sans faire attention : 5 heures à suivre des nazis enfermés dans les quelques mètres carrés d'un sous-marin, une galère ? Et bien non, je ne me suis pas ennuyé un seul instant. C'est vraiment un film formidable, très éclairant sur la nature humaine. Et enfin "Troie" superproduction qui est tout le contraire du minimaliste "Das Boot", à la fois par l'aspect grandiose, la beauté des corps (Brad Pitt et Orlando Bloom nus ou en jupette pendant 2 heures, mesdames...), et la mécanique parfaitement prévisible (oui, je sais, on connait tous l'histoire, évidemment ça gache le suspens...). Il y a quand même quelques belles scènes notamment celle où Priam (Peter O'Toole) demande le corps d'Hector à Achille (Brad Pitt) - "I loved this boy from the moment he opened his eyes to the moment you close them" - ou quand Paris (Orlando Bloom) insiste pour qu'on brule ce cheval géant ridicule abandonné sur la plage face à Troie.
Bref, un réalisateur vraiment versatile qui sert le sujet qu'il doit traiter, sans vraiment laisser de touches personnelles. Finalement, le Spielberg de "Indiana Jones" à "La liste de Schindler" est un peu pareil même si sa personnalité semble plus marquée. Petersen s'oppose aux Tim Burton/Woody Allen/Jean-Pierre Jeunet dont on reconnait le style dès la première minute de film.

Actualités musicales

2007-11-27T20:43:00.000Z

Les chansons qui me trottent actuellement dans la tête :

http://www.youtube.com/watch?v=_EIBi2uojwM
C'est un inédit de notre Michael préféré qui ne figure sur aucun album. Une bombe. Le montage fait par un fan est pas mal non plus...

http://www.youtube.com/watch?v=p8Z-DIAthbM
1,2,3 de Feist. Très frais et un peu naif, ça fait du bien. Le clip en un seul plan séquence est remarquable. Ca a évidemment nécessité des effets spéciaux mais ils sont très subtils.

http://www.youtube.com/watch?v=259yZDfxs4c
Sympa. A suivre. Du potentiel.

http://www.youtube.com/watch?v=DhEDbqktSEM
Ca swingue et ça pète.

et puis histoire de plomber un peu l'atmosphère
http://www.youtube.com/watch?v=YxQrPXPSVhQ
Je pleure à chaque fois que j'écoute cette chanson, maintenant plus que jamais.

Les souris arc-en-ciel

2007-11-25T19:17:00.000Z

Après la souris verte (qui courait dans l'herbe) voici les souris brainbow, joli mot-valise sur cerveau et arc-en-ciel en anglais. Ce sont des chercheurs de Harvard qui les ont présentées dans un des derniers Nature. Il s'agit de mieux pouvoir comprendre la structure des réseaux neuronaux dans le cerveau, la structure la plus complexe du système solaire (juste devant l'administration française). Les chercheurs ont eu l'idée d'utiliser les multiples gènes qui codent des protéines fluorescentes (clonés à partir de gènes de divers organismes dont des méduses fluorescentes) et de permettre de les combiner de façon aléatoire de façon à obtenir de multiples couleurs différentes (jusqu'à 90 couleurs). Techniquement, c'est habilement réalisé grâce à la technique Cre/Lox. Cre est une enzyme qui, lorsqu'elle reconnait deux séquences Lox sur l'ADN, excise (enlève) le morceau d'ADN entre ces séquences. Or, quand Cre rencontre un fragment d'ADN avec plus de deux sites Lox , il va "utiliser" deux sites Lox choisis au hasard parmis ceux disponibles. Ainsi, une fois activé, Cre ne va pas découper l'ADN de la même manière d'une cellule à l'autre. On peut encore rajouter un degré de complexité en utilisant le fait que lorsque deux sites Lox sont montés "à l'envers", l'enzyme Cre inverse la séquence d'ADN entre les deux sites. Chaque cellule va finir par exprimer une combinaison de doses des différentes couleurs.
Cette nouvelle technique, outre son aspect esthétique indéniable, apportera des renseignements rapides sur la mise en place de réseaux neuronaux et les défauts de ces réseaux dans les différentes souris qui modélisent des maladies neurodégénératives par exemple. On peut en effet connaitre les connexions de plusieurs centaines de cellules à la fois, ce qui permet un gain de temps considérable par rapport aux techniques classiques.

Pour se détendre...

2007-11-09T12:32:00.000Z

Evident site culte, le site où on peut détourner la couverture des albums "Martine", héroïne nunuche des bouquins pour enfants du siècle dernier.

http://martine.logeek.com/index.php

Voici mon préféré à gauche et à droite une création personnelle...

Tout va bien... (suite et pas fin)

2007-11-06T14:58:00.000Z

Donc si je résume l'actualité sociale, face aux mécontentements (à tort ou à raison) des conducteurs RATP/SNCF, des électriciens-gaziers, des postiers, des fonctionnaires, des magistrats, des policiers, des associations des droits de l'homme, des associations du droit au logement (qui est un droit de l'homme d'ailleurs), des étudiants...on décide de satisfaire les revendications des internes (et on ne les oblige plus à aller s'installer quelques années dans des contrées hostiles, sauvages et infestées de cannibales comme le Limousin, la Haute-Normandie ou la Picardie (là où on manque le plus de médecins)) et les revendications des marins pêcheurs (baisse des charges patronales) qui peuvent ainsi joyeusement continuer à vider la mer des quelques poissons qui restent.

Du cerveau au petit embryon

2007-10-30T15:16:00.000Z

Intéressant article dans le dernier "Developmental Biology" (Kawamura et al. Dev Biol 311, pp147-158 (2007)) qui montre qu'une molécule de signalisation intercellulaire qu'on croyait jusqu'alors cantonnée au développement des neurones, BDNF (ou Brain Derived Neurotrophic Factor), a aussi un rôle dans le développement des blastocystes de souris, c'est-à-dire des jeunes embryons qui sont encore très loin d'avoir un cerveau et des neurones. Le ligand BDNF et son récepteur appellé TrkB sont exprimés dans les cellules du trophectoderme, c'est-à-dire les cellules qui forment la sphère qui délimite le blastocyste à ce stade. De plus, BDNF est aussi exprimé par les voies génitales maternelles, ouvrant la possibilité d'une communication paracrine mère-blastocyste à ce stade. La signalisation BDNF est importante pour la survie des cellules du blastocyste et l'inhibition de l'apoptose (le suicide cellulaire).
Ce n'est pas la première fois qu'on retrouve des voies de signalisation classiques de cellules différenciées "reprises" pour des cellules embryonnaires. Par exemple, l'endothéline et ses récepteurs qui ont un rôle dans le contrôle de la contraction des vaisseaux sanguins ont aussi un rôle dans la migration de cellules dans l'embryon, une fonction qui n'a rien à voir avec la précédente et à un autre stade du développement. Voila comment on fait de grandes choses avec un nombre de gènes qui n'est pas si grand que ça : on recycle sans arrêt les mêmes molécules !

Le nouveau tube de Jason Malachi...

2007-10-23T19:40:00.000Z

Situation très bizarre sur le Net avec une chanson inédite composée et chantée par un certain Jason Malachi...Mais à écouter de plus près (voir par exemple ce site), on sent bien que le véritable compositeur-chanteur est un quasi anagramme du nom précédent. Alors soit c'est un fake (un faux) mais alors sacrément réussi ou alors est-ce une vraie chanson inédite de Michael Jackson. Je penche nettement pour la deuxième solution, tellement ça colle avec le style, l'intonation, le timbre. Par exemple, toute la partie comprise entre 1min40 et 2min, c'est du Michael pur jus sans additif ni conservateur. Question subsidiaire : est-ce une chanson non sélectionnée pour le dernier album paru (Invincible) ou est-ce que c'est une chanson du futur album?

Pas du tout élémentaire, mon cher Watson

2007-10-20T19:16:00.000Z

L'un des découvreurs de la structure en double hélice de l'ADN, James Watson, s'est laissé aller à des propos qui ont choqué toute la communauté scientifique et au-delà (voir l'article du Monde). Il a été licencié de l'Institut Cold Spring Harbor qui l'employait (encore, malgré son age (79 ans)...).
Watson a déclaré qu'il aurait aimé que tout le monde soit égal, mais que "ceux qui ont à traiter avec des employés noirs savent que ce n'est pas vrai". "Nos politiques sociales se fondent sur le fait que leur intelligence est la même que la nôtre (Occidentaux blancs), alors (...) que toutes les recherches concluent que ce n'est pas vraiment le cas".
Ces déclarations font d'ailleurs suite à diverses autres déclarations fracassantes sur les gènes de l'homosexualité et le lien supposé entre pulsions sexuelles et couleurs de peau (je vous laisse imaginer le gros préjugé...).
Le problème n'est pas tant que ces propos sont choquants (quelquefois la vérité peut choquer...), que le fait qu'ils sont faux. Watson, obnubilé sans doute par sa découverte majeure sur l'ADN et la génétique, surestime l'impact de l'inné (génétique) et sous-estime l'influence de l'acquis. Il est évident que le contexte familial, la présence plus ou moins forte d'une religion abrutissante et infantilisante, l'accès à l'éducation scientifique...va influer massivement sur les capacités cognitives logiques d'un individu. Le danger avec Watson, c'est que ses propos vont être repris par ce que j'appelle les partisans des "petites cases" (ceux qui aiment classer les gens dès leur naissance avec tous les préjugés possibles) avec le label "Un Nobélisé l'a dit c'est que ça doit être vrai". Je rappelle donc que les Nobélisés ont un cerveau qui dégénère comme tout le monde avec l'âge et que ce n'est pas parcequ'on a été doué un jour en génétique et en biochimie que l'on peut échapper à une éducation raciste et xénophobe très répandue à l'époque où Watson a développé ses propres facultés cognitives.

Affichage du deuxième type

2007-10-15T19:07:00.000Z

Saluons une intéressante initiative de la SNCF (je ne parle pas de la grève de jeudi qui est une très mauvaise initiative rien que par la quantité massive de CO2 supplémentaire que cela fera rejeter dans l'atmosphère). Les tableaux d'affichage classiques des trains indiquent les différents trains par ordre chronologique. Si cela peut être satisfaisant pour les grandes lignes où en général on réserve et donc on sait l'heure de départ de son train, cela ne l'est plus pour les voyages régionaux ou les trains de banlieue où on cherche plutot à atteindre une destination sans connaitre l'heure du départ. Voila donc logiquement installé à la gare Saint-Lazare qui est la première gare de Paris pour le trafic banlieue un nouveau tableau d'affichage où les trains sont classés par ordre alphabétique de destination avec ensuite l'heure de départ, le quai et la durée du trajet pour les 2 prochains trains s'arrêtant à cette gare. C'est intéressant notamment pour repérer les dépassements de trains par exemple le train de 16h12 pour Mantes La Jolie y sera en 1h18 alors que celui partant à 16h30 y sera en 55 minutes, donc 5 minutes plus tot que celui qui partait avant !!

Les magiciens d'"Oz"

2007-10-12T19:44:00.000Z

J'ai découvert récemment une série américaine en DVD qui s'appelle "Oz". Rien à voir avec un univers féérique puisque c'est le diminutif de Oswald Penitentiary Institution, une prison américaine où sont envoyés les prisonniers les plus durs. Au sein de cet établissement, le surveillant en chef (Tim McManus) tente une expérience : recréer une "ville" dans la prison où les prisonniers pourraient réapprendre à vivre en société. Il est clair que ce ne sera pas de tout repos. C'est violent, cruel, très politiquement incorrect mais brillant, excellentissimement joué et remarquablement bien écrit (cf. quelques extraits de dialogue plus bas extrait du site imdb). La population carcérale est divisée en clans : les Nazis (les blancs racistes), les Noirs junkies, les Noirs musulmans, les mafieux (italiens) et les Irlandais, sans oublier le clan des surveillants de prison dont les moeurs et habitudes sont quelquefois difficilement distinguables de ceux des prisonniers....L'histoire de chaque épisode est commenté par l'un des prisonniers, Augustus Hill, handicapé à la suite de brutalités policières, de manière particulièrement percutante, ironique ou absurde (un type d'expression très rare dans les séries américaines...). La série se positionne très clairement contre la peine de mort. Il y a aussi de très bons moments comiques notamment la scène inoubliable du dentiste de la prison qui doit retirer une dent à un prisonnier qui a mangé ses victimes.

Leo Glynn: Hey, Tim, want to grab some dinner?
Tim McManus: Appreciate it, Leo. I can't.
Leo Glynn: Too much work to do, right? You can take a break from saving the world. Even Jesus had supper. Tim McManus: Yeah, and right afterwards he was betrayed and crucified.
Leo Glynn: I'll try not to take that personally.

Donald Groves: [gives Alvarez a stamp] Here.
Miguel Alvarez: I don't wanna write anybody a fucking letter. I wanna get fucking high.
Donald Groves: You lick the back. It's liquid LSD.
Miguel Alvarez: Groves, this gives stamp collecting a whole new meaning, baby

Vernon Schillinger: So the state's gonna let Keane choose which way he's gonna go out. Me, I'd take hanging.
Mark Mack: What about lethal injection?
Vernon Schillinger: That's for pussies.
Donald Groves: They say that lethal injection causes no pain. How do they know? Did someone come back from the dead and say they didn't feel anything?

Tim McManus: You say you've changed. Why should I believe you?
Vern Schillinger: Trust me, McManus, you lose an eye, you get kicked in the balls, you get a face full of shit, you become a different man.

Beecher: You've got to transfer me to another cell block.
Tim McManus: All the other cell blocks are full.
Beecher: Well transfer me to another prison.
Tim McManus: Do I look like a travel agent to you?

Leo Glynn: People, we've got three murders in two weeks. I got the Commissioner yelling in my ear and the press shoved up my ass. The Governor's threatening to send in the feds. And my daughter wants to move into an apartment with her boyfriend. Somebody, help me out here.

Vernon Schillinger: You're not a Jew, are you?
Tobias Beecher: Me? Jewish? I don't even like Barbra Streisand.

Augustus Hill: Do we care for people when they're sick because we actually care about them? Or do we care for them because when our time comes, we want someone to care for us? Or does it matter? At least you got your health. Don't you hate it when people say that? I mean, you lose your job, you lose your wife, you're in prison, and some punkass dude gonna say, "At least you got your health." Like that's supposed to make me feel better. So what if I'm broke? So what if some drug dealer wants to cap my ass? At least I ain't got a tumor. I swear, the next person that says ALYGYH to me, I'm gonna make sure they ain't got their health much longer.

Des Nobels qui ont échoué...

2007-10-09T18:06:00.000Z

Le prix Nobel de médecine vient d'être attribué à deux américains (c'est un pléonasme) et à un anglais pour leurs travaux vieux de 20 ans qui ont permis la mise au point de la technique dite du "knock-out" (KO). Il s'agit de comprendre la fonction d'un gène en le détruisant (on n'est pas forcément très subtil en biologie moléculaire...) ou mieux en le remplaçant par un autre gène (ça s'appelle très finement le knock-in) chez la souris. Nos Nobels ont découvert que pour réussir cela il fallait réaliser la mutation dans les fameuses cellules embryonnaires souches (cellules ES). La souris est suffisamment proche de l'homme (tout est relatif...mais nous raisonnons par rapport aux autres modèles classiques : levure, drosophile, xénope...) pour espérer modéliser des maladies génétiques humaines chez des souris. Le plus drôle dans l'histoire c'est que nos Nobélisés ont en fait commencé par échouer dans la modélisation d'une maladie.

Le premier KO réalisé par Martin Evans publié
en 1987 dans Nature consistait en une tentative de modélisation du
syndrome de Lesch-Nyhan (troubles neurologiques et comportementaux
(auto-mutilations) dus à l'accumulation d'acide urique) qui est
associé chez l'homme à des mutations dans HPRT (hypoxanthine-guanosine
phosphoribosyl transferase, une enzyme impliquée dans le recyclage des
bases puriques (des constituants de l'ADN). Et les souris KO obtenus, bien que ne produisant pas de HPRT,...n'ont pas présenté de phénotype (de maladie) !! C'est que les voies de
biosynthèse impliquées sont différentes entre l'homme et la souris.
C'est donc assez amusant de voir que dès le premier KO, les chercheurs
sont tombés sur le principal défaut de cette approche pour modéliser
des pathologies humaines... Mais en vingt ans bien d'autres KO ont été générés pour environ la moitié des gènes de la souris et ont amené une quantité d'informations incroyables dans tous els domaines de la biologie.

Par ailleurs, signalons que l'un des Nobélisés pour la Physique est Normalien et travaille à Orsay. J'aime bien son parcours...

La plante, la larve et le taxonomiste

2007-10-03T10:55:00.000Z

Voila une jolie histoire qui pourrait être une fable :
Tous les taxonomistes (les chercheurs qui classent les organismes vivants) pensaient que les Brunfelsia (espèces de buissons et d'arbustes sud-américains) étaient des végétaux de la famille des Scrophulariacées. Cette plante est parasitée par les larves de Thyridia (un Lépidoptère, famille du papillon). Or toutes les autres plantes mangées par les larves de Thyridia sont des Solanacées (la famille de la tomate et de la pomme de terre), ce qui amena à une meilleure observation des structures de Brunfelsia et...à son déplacement vers le groupe des Solanacées. Merci donc les larves de Thyridia qui n'ont pas une connaissance plus fine de la taxonomie végétale mais qui sont très sensibles à des métabolites secondaires qui constituent la signature chimique de chaque groupe de végétaux.

Raconte moi des moutons

2007-09-28T18:47:00.000Z

Je viens de terminer un livre original "Qui a tué Glenn ?" de Léonie Swann où un troupeau de mouton "mène l'enquête" pour trouver l'assassin de son berger. L'anthropomorphisation des moutons est faite de manière très subtile et légère et en fait, les moutons gardent bien un caractère de moutons : c'est très drole de les voir adopter tous la même opinion sur un problème, même la plus débile. De même, ils sont complètement obnubilés pour l'herbe et par le broutage, c'est le centre de leur existence et tout se ramène à cela. Plusieurs fois, ils sont au bord de trouver ou d'interpréter un indice important, mais ils partent dans une toute autre direction car ils interprètent mal le monde des humains (notamment tout ce qui concerne la religion, mais ça c'est plutot une marque d'intelligence...) ou sont bien trop casaniers. On se doute qu'à la fin ils trouveront la solution, mais le moins que l'on puisse dire c'est que ce ne sera pas en empruntant une ligne droite !
Il y a aussi de beaux moments de poésie quand les moutons contemplent les moutons-nuages dans le ciel et essaient de communiquer avec eux.

On n'a pas fini d'écouter France Info

2007-09-24T19:39:00.000Z

Encore un brillantissime et documenté article dans Agoravox concernant la situation géopolitique actuelle. En résumé, pour sauver les Républicains et l'économie américaine, les USA préparent une attaque sur l'Iran, y compris avec des armes anti-bunkers qui sont à technologie nucléaire. Et pour justifier le tout, il est possible qu'il y ait une opération"False Flag", c'est-à-dire un attentat organisé par les USA sans doute sur leur sol mais ce serait l'Iran qui serait désigné comme coupable. Déja les USA avaient prévu de faire ce coup-là pour Cuba avant que JFKennedy y mette son veto.
Le 11 septembre 2001 est-il un "false flag"?? Un article de Wikipédia fait le point.

Les doubles dents de la mer

2007-09-23T19:14:00.000Z

Un article du Nature du 7 septembre 2007 apporte un éclairage étonnant sur les modes de capture de proie de la murène, un poisson de la forme d'une anguille et qui est un prédateur féroce vivant tapi dans des cavernes sous-marines et des anfractuosités des récifs coraliens (où il est d'ailleurs au sommet de la chaine alimentaire). Il possède en plus de ses machoires dentées habituelles, des machoires pharyngiennes également dentées qu'il est capable de projeter dans sa cavité buccale pour attraper sa proie dans sa bouche et la trainer vers son oesophage (en la charcutant un peu plus au passage). C'est un peu comme si on avait une seconde bouche dentée dans la gorge que l'on projeterait dans la première bouche puis retirerait vers l'arrière pour être sur de ne rien perdre de son repas. Ca serait d'ailleurs très pratique pour manger des spaghetti.

Lovestoned (I think that she knows)

2007-09-14T19:42:00.000Z

J'ai depuis quelques jours cette excellente chanson vissée dans la tête. Alors j'essaye de vous contaminer...

Je croyais que Justin Timberlake était juste un chanteur lambda pour midinettes mais force est de constater qu'il aligne une série de bons titres depuis quelques temps (voir aussi cette chanson). La première chanson "Lovestoned" musicalement c'est d'ailleurs du Michael Jackson pur jus comme on n'en fait plus. Coté danse, il faut qu'il s'améliore le petit Justin; ça ne suffit de bouger son beau petit c... pour être un bon danseur.

Les producteurs de pétrole se la pètent

2007-09-07T19:08:00.001Z

Un article du Spiegel à faire dresser les cheveux sur la tête !
Les plate-formes et les forages pétroliers brulent chaque année en pure perte 50 milliards de mètre-cube de gaz (soit 5% de la consommation annuelle). Le gaz (surtout du méthane) surplombe les couches pétrolifères et pour les compagnies purement pétrolières c'est un déchet. Vu que le pétrole est suffisamment cher pour assurer des jours heureux à leurs actionnaires et PDGs, ces compagnies "qui se soucient de l'environnement" (style Total, vous voyez le genre...) ne sentent pas le besoin d'investir dans des tuyaux pour récupérer et acheminer le gaz. Bilan : un gachis épouvantable (alors qu'on s'inquiète des réserves de gaz mondiales) et surtout une contribution majeure à la hausse de l'effet de serre d'autant plus que le méthane a un effet vingt fois supérieur par rapport au CO2.

Deep impact factor

2007-09-06T14:20:00.000Z

Intéressant article dans le dernier Current Biology qui fait le résumé des travers du système actuellement en vigueur pour évaluer "objectivement" les scientifiques.
Les scientifiques publient leurs travaux dans des journaux spécialisés avec "revue par les pairs" c'est-à-dire que pour publier il faut que deux ou trois scientifiques indépendants sensés s'y connaitre dans le domaine valident l'article en vérifiant que les expériences ont été bien et complètement menées et si les travaux amènent quelque chose de réellement nouveau. Les différents journaux ne sont pas équivalent mais ont chacun un impact factor c'est-à-dire un nombre qui correspond au nombre moyen de fois qu'un article dans ce journal est cité par d'autres publications (avec le biais que évidemment la médecine est surévaluée par rapport aux autres disciplines). Les scientifiques sont évalués par leur nombre de publication, l'impact factor des journaux où ils ont publié et le nombre de fois que leur article a été cité deux ans après sa parution.
Ce système qui parait juste au premier abord amène de nombreux problèmes si il est considéré seul comme le critère absolu pour trier le bon grain de l'ivraie chez les scientifiques. Tout d'abord, publier dans un journal avec un fort impact factor ne veut pas dire que l'article en question sera très cité, même si ce dernier paramètre est aussi pris en compte. Ensuite, ce système entraine des effets de mode .Par exemple plus on va étudier une molécule plus les travaux sur cette molécule seront cités, plus ce sera rentable de faire un nième article sur cette molécule. A contrario, des articles pourtant fondamentaux comme celui décrivant la double hélice d'ADN en 1953 ou le complexe Hox en 1978 n'ont été cités que très peu durant les deux premières années car trop en avance en quelque sorte sur leur temps. Ensuite, beaucoup de chefs d'équipe préfèrent essayer de "passer en force" dans un journal avec un haut impact factor au prix d'une perte de temps considérable, notamment pour les petits thésards et les post-docs, au lieu de chercher à publier dans un journal vraiment au niveau de l'article, où il sera accepté sans trop de problème ou de délais. Enfin, il y a un aspect assez "commercial" dans tout ça. Beaucoup de chefs d'équipe hantent les congrès, non pas pour partager leur savoir, mais pour "vendre" leur travail à de futurs "reviewers" potentiels.

Smoking/No smoking

2007-08-17T20:08:00.000Z

Je viens de voir en DVD les films d'Alain Resnais avec les excellentissimes Sabine Azéma et Pierre Arditi, "Smoking" et "No smoking". L'originalité de ces deux films qui totalisent 5 heures tient non seulement au fait que les deux acteurs jouent tous les personnages mais aussi qu'il y a de multiples fins (12 au total) selon les décisions des protagonistes et les hasards qui jalonnent le récit.
Ce principe peut tout à fait illustrer le principe de contingence en Evolution. L'histoire évolutive sur notre planète est unique et si on remontait 200 millions d'années en arrière, elle ne se déroulerait pas une deuxième fois de la même façon. Des évènements totalement indépendants du monde vivant ont jalonné cette histoire : chute de météorites, éruptions volcaniques massives, mouvements tectoniques. L'exemple classique est la disparition des dinosaures il y a 65 millions d'années qui a laissé les niches écologiques dominantes aux Mammifères. D'autres exemples existent comme par exemple le quasi-remplacement des Brachiopodes par leur équivalent Mollusque, les Lamellibranches (comme la moule ou la coquille Saint-Jacques) après la crise du Permien il y a 250 millions d'années. Sans cette crise (aux origines plus ou moins inexpliqués), on mangerait chez Léon des Brachiopodes avec des frites avec des lophophores qui nous chatouillerait le palais (le lophophore est une structure présente chez les Brachiopodes mais pas chez les Lamellibranches). Mais peut-être que "Chez Léon" n'existerait pas et d'ailleurs nous-même non plus...

Le cil vous plait

2007-08-12T12:35:00.000Z

Les cils cellulaires sont des protrusions mobiles de la cellule, soutenus par des éléments du cytosquelette (les microtubules) qui ont, jusqu'à il y a peu de temps, peu intéressés les biologistes cellulaires. Il ne faut pas confondre les cils (les rames) avec les flagelles (les hélices) comme ceux des spermatozoïdes. On considérait les cils comme des structures à fonctions purement mécaniques, dont le rôle se borne à battre et à créer un courant qui permet d'évacuer les particules indésirables le long de notre trachée ou de mettre en mouvement l'eau dans la cavité générale de la moule pour sa respiration et sa nutrition ou de faire nager les petites paramécies (fonctions importantes mais qui font bailler d'ennui tous les biologistes cellulaires).
Cela change depuis quelques temps. Il y a eu la découverte très innatendue il y a quelques années de l'implication des cils dans la génération de l'asymétrie droite-gauche chez les embryons de Vertébrés (asymétrie qui se manifeste par la position du coeur, l'enroulement des intestins, les aires du cerveau...). Imaginez un petit bassin appelé noeud de Hensen au beau milieu de l'embryon. Le petit bassin est rempli de liquide. Des cellules déversent dans ce liquide des particules (lipoprotéiques) contenant une protéine appellée Sonic Hedgehog (Shh). Initialement Shh est réparti uniformémént dans le petit bassin. Mais une rangée de cellules possèdent des cils qui battent tous dans le même sens. Donc un courant se crée provoquant l'accumulation de Shh vers un des côtés. Les cellules qui reçoivent plus de Shh que les autres sur un des bords du bassin interprètent et décodent l'information Shh : tu es une cellule à gauche. Et voila pourquoi votre coeur est plus à gauche !!! La question qui ne manque pas d'apparaitre maintenant c'est "Mais pourquoi tous ces cils battent-ils tous vers un même coté ? Il y a une polarité pré-existante ??". On n'en sait encore rien mais vous voyez bien que ces cils sont intéressants...
Deuxième surprise dans un Science du 20 juillet 2007, Rohatgi et al. nous apprend que les récepteurs à Shh se trouvent aussi concentrés sur des cils (immobiles ceux-là qu'on appelle des cils primaires) et qu'ils fonctionnent comme des interrupteurs cellulaires. Shh se fixe sur les cellules sur un récepteur Patched. On savait qu'en absence de Shh, Patched inhibe la protéine Smoothened qui permet d'activer les messagers de Shh appellés Gli à l'intérieur de la cellule. Shh inactive Patched en se fixant à lui donc Patched ne peut plus inactiver Smoothened et les messagers Gli peuvent aller accomplir leur mission. C'est le coup classique de "j'inhibe un inhibiteur pour activer" ou "l'ennemi de mon ami est mon ennemi". L'histoire est un peu plus complexe car Patched sans Shh active quand même les Gli mais sous une forme "répressive de la transcription" alors que quand Shh est là, Patched ne peut pas pervertir nos petits Gli et c'est Smoothened (bien nommé) qui les rend "activateurs de la transcription".
Et le cil dans tout ça ??? Et bien il crée un domaine cellulaire restreint où va se jouer le destin de Gli. Car Gli s'accumule dans le cil. Sans Shh, Patched tout puissant empêche Smoothened de rentrer dans le cil (en inhibant la production d'oxystérol à partir du cholestérol très abondant dans la membrane des cils; cet oxystérol est nécessaire à Smoothened pour être stable dans les cils) et donc Gli ne peut que subir l'éducation de Patched et devenir "répresseur". Quand Shh s'arrime à Patched, Patched se retrouve internalisé dans une vésicule et dégradé donc il laisse le champ libre à Smoothened qui après entrée dans le cil corrige nos petits Gli en activateurs. Longue vie à tous nos petits cils !!!

L'exception culturelle française

2007-08-05T16:37:00.000Z

Je suis toujours affligé de voir à quel point notre pays est en retard dans certains domaines et notamment pour informer correctement le public en temps réel via des sites Internet et gratuitement.
Dernier exemple en date, ce site qui montre qu'un pays "sous-développé" comme la République Tchèque est capable d'apporter une information claire et pratique sur les trains en retard en direct. Quand on clique sur les petits triangles qui représentent les trains, on a le retard du train en question et en plus on peut accéder à l'historique de tous les retards du train entre différentes stations depuis quelques mois. Cela dit, cela ne m'étonne pas que ce soit la République Tchèque qui ait développé cet outil car les retards de trains sont chroniques.
Pour continuer dans l'info férroviaire, pour rechercher des horaires et des trajets il vaut infiniment mieux utiliser le site de la Deutsche Bahn plutot que celui de la SNCF.
Pareil pour la météo, si vous voulez suivre les impacts de foudre en direct en Europe, vous avez un site...québécois, un site allemand et un site français fait par des amateurs...mais rien de MétéoFrance ou alors il faut payer bien sur...La sécurité a un prix. L'ensemble des sites gratuits que j'ai cité sont accessibles ici.
Et évidemment vous pouvez faire des animations satellites personnalisés sur un site...tchèque, une fois de plus.

Lindalë

2007-07-31T19:35:00.000Z

Une chanson magnifique pour l'un des plus beaux et des meilleurs films de tous les temps.

L'explosion des méduses

2007-07-31T18:55:00.000Z

Article très complet avec de nombreux liens sur AgoraVox sur les invasions de méduses en Méditerrannée, un phénomène que j'ai pu constaté de visu (et heureusement pas in carne) dès l'année dernière dans le Var.

L'explosion des trilobites

2007-07-30T19:26:00.000Z

Un joli article dans le dernier Science sur les relations entre la morphologie des trilobites et l'explosion cambrienne. Les Trilobites sont ces fameux Arthropodes qui ont joyeusement rampé dans les fonds marins du Cambrien (un peu avant 500 millions d'années) jusqu'au Permien (250 millions d'années), victimes de la plus grande vague d'extinction de l'histoire du vivant (pour le moment...). C'est du pain bénit pour les paléontologistes avec leur cuticule durcie qui fossilise si bien. La photo que je vous ai mise correspond à Cyphaspis, l'un des plus jolis et originaux Trilobites, à la forme de chauve-souris, et qui fut aussi l'un des ultimes genres du groupe au Permien.
L'explosion cambrienne caractérise la période entre il y a 580 et 500 millions d'années où les formes animales se sont extrêmement diversifiés, générant notamment tous les grands embranchements actuels, y compris le notre, les Cordés. On estime maintenant que c'est une diversification réelle et généralisée et non pas un effet d'optique du au fait qu'il y ait apparition de plus d'animaux facilement fossilisables (à carapace ou à coquille). Cette période de foisonnement évolutif se retrouve chez les Trilobites comme le montre l'article. Ce n'est que durant cette période qu'on trouve une augmentation aussi importante du nombre d'espèces de trilobites mais aussi un polymorphisme aussi important au sein d'une même espèce (même si le terme d'espèce est délicat à manier avec des espèces fossiles). Par exemple, le nombre de segments thoraciques, un paramètre qu'on imagine étroitement contrôlé par les gènes homéotiques Hox, est très variable, y compris au sein d'une même espèce. Après le Cambrien, le nombre sera fixe. Pareil pour maints autres caractères (des petites encoches au niveau de la tête...etc...j'imagine les thésards et les post-docs passant leurs journées à compter les encoches millimétriques dans la tête de milliers de fossiles de Trilobites !!).
Ces histoires de variations puis de fixation rappelle un peu le nombre de doigts des premiers Tétrapodes au Dévonien avec un nombre de doigts allant de 4 à 8 (mais pas dans la même espèce quand même...). Puis c'est le chiffre 5 qui a dominé, sans soute car l'ancêtre des Tétrapodes qui a engendré la lignée était par hasard doté de 5 doigts.
La période de l'explosion cambrienne a donc été une période de plasticité assez étonnante. Que s'est-il passé à cette période pour expliquer ça ? Je vous renvoie à l'excellent article wikipédien qui fait le tour des différents hypothèses.

Le labyrinthe de Pan

2007-07-27T18:56:00.000Z

Je viens de voir en DVD le superbe film de Guillaume Del Toro "Le labyrinthe de Pan". Une fille de 11 ans, obligée de vivre dans un camp de franquistes pendant la guerre d'Espagne dirigé par ce qui est présenté comme son père (Sergio Lopez, excellent acteur), s'évade des horreurs de la guerre grâce à un monde imaginaire. C'est un film fantastique où les contes de fée font encore peur, car le monde imaginaire n'est pas de tout repos et peuplé de monstres qui sont la projection des propres angoisses de la fille. Le réel et l'imaginaire se mélangent à merveille. Les scènes "imaginaires" bénéficient de superbes maquillages et décors, avec des personnages vraiment hors du commun. On ne peut s'empêcher de penser à Tim Burton bien sur, qui est tapi comme une ombre à maints tournants du labyrinthe.
Mais les scènes fantastiques ne forment qu'un quart du film. Le reste c'est un film de guerre (ici la guerre civile d'Espagne avec les franquistes s'opposant aux résistants) avec ses grands classiques : les innocents tués, le blessé qu'on ampute, le prisonnier qu'on torture et divers giclements de boites craniennes...Ce sont les femmes qui apportent un peu de vie dans tout ça avec la mère de la fille qui est enceinte des oeuvres du commandant franquiste et la servante du commandant qui travaille en fait pour les résistants. C'est autour de ces deux femmes que se nouent la partie intéressante de l'histoire qui va se mêler avec celle de la fille.
La fin est terrible, d'ailleurs "le monde est cruel" comme le dit l'un des personnages. Une catastrophe pour l'univers réel de la petite fille, mais un happy end dans le monde imaginaire. C'est toujours ça de gagné...

Et voilà !

2007-07-23T10:57:00.000Z

Le 19 Mars 2007, sur cette page de ce blog :

http://journaldebord-pat.blogspot.com/2007/03/harry-potter-7.html

je vous avais donné des éléments clés du dernier Harry Potter qui est tout juste sorti samedi dernier. Mes théories se sont donc révélées juste et sur Snape et sur les relations Horcruxes/Harry Potter. Je devrais peut-être me mettre à écrire des romans fantastiques...

650 ans du pont Charles

2007-07-09T14:01:00.001Z

Prague, ma ville natale, fête le 650ème anniversaire de son plus célèbre monument : le Pont Charles.

http://www.lemonde.fr/web/portfolio/0,12-0@2-3214,31-933244@51-933254,0.html

Malheureusement, ce pont unique en son genre, subit deux dangers bien typiques de notre époque : tout d'abord, les vandales stupides qui abiment les statues et essaient de graver leur pauvre petit nom ou pseudonyme sur les murs du pont. C'est d'un égoïsme et d'une prétention assez incroyables, mais c'est le coté "Star Academy" de notre époque : je deviens célèbre à moindre frais et pas forcément par un acte intelligent et original...
Deuxième danger, la privatisation rampante avec récemment Vuitton qui a essayé de louer le pont Charles pour une soirée privée de promotion publicitaire. La municipalité a d'ailleurs failli dire oui vu que le maire est de droite (partie ODS l'équivalent de l'UMP en plus dur...le maire vient d'ailleurs de se distinguer en passant un mois hors de son poste à gravir l'Everest...quand on est maire d'une capitale d'1 million d'habitants, cela n'est pas très responsable...). Il a fallu la mobilisation des habitants pour éviter cela.
Par ailleurs, Prague a reçu un avertissement de la part de l'UNESCO car il y a des projets de construction de hauts immeubles voire de gratte-ciels qui pourraient abimer la beauté visuelle du site classé au Patrimoine de l'Humanité (Dresde a reçu un avertissement encore plus sévère pour un projet de pont routier avec la menace de déclassement du site).

Persepolis

2007-07-02T14:43:00.000Z

J'ai vu hier l'excellent film de Marjane Satrapi "Persepolis". C'est une histoire très émouvante où un personnage très attachant (la petite puis l'ado Marjane) est complètement secouée par les soubresauts de l'histoire de son pays, l'Iran. Face à tous ces bouleversements, ses parents essaient de survivre tant bien que mal tandis que sa grand-mère représente ce qui est stable et éternel : les valeurs de l'humanisme. Après l'espoir lié au départ du Shah, vite déçu par l'arrivée des fanatiques religieux et la guerre avec l'Irak, Marjane doit grandir dans une société aux valeurs infantilisantes et grotesquement stupides. Cependant, le salut ne vient pas de l'Occident : les quelques mois en exil à Vienne de Marjane seront hauts en couleur et réussissent à rendre l'Autriche plus exotique que l'Iran !!
Le maintien du noir et blanc de la BD et l'aspect très vivant et sophistiqué de l'utilisation des ombres, des lumières sont très réussis. Ce n'est pas un dessin animé mais vraiment une BD animée.

Amo Tori Amos

2007-06-24T20:03:00.001Z

Il y a des fois on aimerait bien se transformer en microphone...

http://video.google.fr/videoplay?docid=1499860677305339849

Bravo Tori Amos, encore une superbe chanson !! Et une autre chanson (encore meilleure):

http://www.youtube.com/watch?v=NAjARR1USDk

Ces superbes chansons sont issus du nouvel album "American Doll Posse". Pour l'instant, malgré quelques joyaux, je le trouve moins bon que ses illustres prédécesseurs "The beekeeper", "Scarlet's walk" ou "From the choirgirl hotel" mais les albums de Tori Amos demandent plusieurs écoutes avant d'être apprivoisés.

Une surprise dans les marées rouges

2007-06-22T15:03:00.000Z

Intéressante étude rapportée dans le Science du 15 juin 2007, sur des applications thérapeutiques innattendues de Karenia brevis. Cette petite bête est un être unicellulaire Eucaryote (un Dinoflagellé) qui fait partie du plancton et peut se multiplier jusqu'à rendre l'océan rouge lorsque les conditions de croissance sont particulièrement favorables (ça arrive régulièrement par exemple au large de la Floride). Or ces charmantes cellules produisent des toxines (pourquoi d'ailleurs ?) qui s'accumulent dans l'atmosphère au dessus des "marées rouges" et causent des problèmes aux asthmatiques et aux personnes ayant déja des difficultés respiratoires car ces toxines (les brevetoxines) sont des bronchoconstricteurs c'est à dire qu'ils diminuent le diamètre des bronches. Or, étonnament Karenia produit aussi son propre antidote puisqu'il produit une molécule (le brévenal) qui bloque la bronchoconstriction et permet même à des patients atteints de mucoviscidose d'avoir moins de mucus dans leurs voies respiratoires. Visiblement, il n'en produit pas suffisamment pour contre-balancer ses mauvaises toxines mais le brévenal a pu être synthétisé in vitro. La découverte de ce composé est un cas d'école de découverte faite au hasard. Les tests de toxicité des toxines planctoniques sont réalisées sur des petits poissons : les guppies qui y sont très sensibles. D'habitude, lorsque des guppies survivent à un test ils ne sont pas réutilisés pour ne pas interférer avec les autres expériences. Or, ce jour-là dans le labo américain en question, il n'y avait plus assez de guppies pour faire tous les tests alors exceptionnellement des guppies ont été réutilisés. Or, des guppies venaient de survivre au test d'un composé nouveau (le futur brévenal), ont survécu et ont été utilisés pour une expérience témoin avec une toxine léthale. Mais ils ont survécu. Le brévenal les avait protégés ! Comme quoi, une petite entorse aux protocoles n'est pas forcément toujours mauvaise...

Courage Fillon

2007-06-18T19:43:00.000Z

Un article intéressant d'Agoravox où on apprend que Fillon est allé inaugurer le TGV Est en avion.

http://www.agoravox.fr/article.php3?id_article=25876

Ca c'est bien de l'écologie garantie 100% UMP.

Carte scolaire

2007-06-14T18:43:00.000Z

La réforme de la carte scolaire semble à l'ordre du jour mais le gouvernement actuel prend le chamin inverse de ce qu'il faudrait faire. Il légitime et amplifie le contournement de la carte scolaire au lieu de la réformer.
La carte scolaire s'est transformée en piège à partir du moment où la carte géographique est devenue une carte sociale et où les quartiers se sont ghéttoisés, pauvre ou riche. Du coup la carte scolaire n'a fait qu'entériner l'"entre soi" et a permis de projeter la fracture sociale sur la génération suivante. Il faut donc redessiner la carte scolaire de telle manière à casser cette logique. Sur le site du Ministère de l'Education et des syndicats enseignants on peut parfaitement connaitre le pourcentage d'élèves issues de familles défavorisées dans l'établissement. Et bien ce taux, fort différent selon les établissements, doit être lissé autant que possible. Il faut faire une carte scolaire où les enfants des centre ville se mélangent aux enfants de la périphérie. Il ne faut surtout pas que les gamins d'une même cité se retrouvent dans le même collège : c'est l'assurance d'importer les problèmes de la cité dans le collège. Au contraire, il faut les éclater entre plusieurs établissements : diviser pour mieux régner : un grand classique qui fonctionne toujours. En utilisant intelligemment les lignes de bus existantes ou en réactivant ponctuellement le transport scolaire si il le faut, on peut y arriver. Et il n'y aura plus aucune raison de contourner la carte scolaire...

The life of Pi

2007-06-04T18:41:00.000Z

Je viens de lire un roman extraordinaire : "Life of Pi" de Yann Martel (je l'ai lu en englais). Il s'agit de l'histoire de M. Piscine Molitor Patel (si, si), le fils d'un directeur de zoo en Inde. Très curieux, il décide de s'initier à la religion et souhaite être chrétien ET musulman ET hindou, ce qui pose quelques problèmes, évidemment. En parallèle, il apprend à connaitre les animaux du zoo. Une expérience qui lui sera utile car la famille doit émigrer au Canada...avec les animaux du zoo. Le cargo coule lors d'une tempête dans le Pacifique et Pi Patel se retrouve dans un caneau de sauvetage avec un rat, un zèbre, une hyène...et un tigre. Commence alors une version déjantée de "Toto et Titi sont dans un bateau". Je vous laisse deviner qui va rester sur le bateau, mais la solution finale est plus complexe qu'il n'y parait. L'odyssée nautique de Pi durera 244 jours et sera riche en péripéties.
C'est ce qu'on peut appeller un livre-monde : il crée son propre univers, et aborde de multiples sujets avec une richesse extraordinaire. Chaque paragraphe recèle des trouvailles narratives et des remarques caustiques très imaginatives. La truculence et la verve de l'auteur rappelle assez Salman Rushdie. Et surtout, l'histoire peut se lire à différents niveaux, notamment avec une fin qui amène à revoir tout le récit sous un autre angle.
Donc à lire d'urgence : http://www.amazon.com/Life-of-Pi/dp/0770430074/ref=pd_bbs_sr_1/
002-4896197-5146431?ie=UTF8&s=books&qid=1180983285&sr=8-1

Le souffle des autoroutes

2007-06-01T19:19:00.000Z

Je suis un grand fan des éoliennes mais là j'avoue que c'est peut-être osé. Selon un projet développé par un étudiant de l'Université d'Arizona il s'agirait de placer des placer des éoliennes au-dessus des autoroutes pour récupérer une partie de l'énergie des tourbillons d'air générés par le passage des voitures. Il y aurait apparemment suffisamment d'énergie pour permettre à l'autoroute de ne pas consommer d'électricité c'est-à-dire que les stations services, aires de repos et l'éclairage nocturne fonctionnerait sans apport externe. Pour l'éclairage nocturne, le meilleur moyen est déja de le supprimer : ça ne me parait pas utile. Ensuite j'imagine que notre étudiant a fait ses calculs mais il n'y a pas de précision sur la densité du trafic nécessaire. Si ça ne peut fonctionner que sur les autoroutes américaines à 6 voies, alors ça restera de l'autre coté de l'Atlantique.

Référence : http://groups.google.fr/group/fr.soc.environnement/
browse_thread/thread/6a6c03cdc34a7c31/60a506252e77bfa8?hl=fr#60a506252e77bfa8

Empreinte écologique

2007-05-28T19:03:00.000Z

Le site http://www.agir21.org/#ee permet de calculer son empreinte écologique c'est-à-dire la surface de planète nécessaire pour subvenir à ses besoins en tenant compte des ressources disponibles d'un coté et de sa consommation en nourriture, en énergie de l'autre. J'ai fait le test : si tout le monde sur la planète se comportait comme moi, il faudrait 2,94 planètes pour subvenir aux besoins de tout le monde !!! Je me situe pourtant juste sous la moyenne européenne et largement sous la moyenne américaine. J'ai un score très bon au niveau énergétique, n'utilisant quasiment jamais la bagnole, ne surchauffant pas mon appart', ayant quelques ampoules basse consommation. Mais j'ai un score quasi-américain en ce qui concerne la nourriture car je mange beaucoup de viandes, de fromages et évidemment une vache ou un boeuf ça coute beaucoup d'énergie à "produire". Il ne faut pas moins d'une surface de 5,4 terrains de football pour subvenir à mes besoins nutritionnels !! Et si je faisais un régime ??

Mettons nous au parfum

2007-05-25T18:25:00.000Z

Viens de sortir en DVD le superbe film que j'avais vu sur grand écran en Octobre dernier "Le Parfum" d'après le roman de Patrick Süskind. L'adaptation a été écrite par le spécialiste des adaptations dites "impossibles" au cinéma, Bernd Eichinger, qui avait déja adapté "Le nom de la rose" pour Annaud. L'obstacle supposé majeur, le fait que le film ne soit pas en odorama, n'est finalement pas gênant (et même il vaut mieux vu les odeurs parisiennes de l'époque). Mais le film est sensuel à souhait : la lumière, le son, la musique sont des ravissements. Les acteurs sont tous excellents : bien sur Ben Whishaw en Jean-Baptiste Grenouille, mais aussi Alan Rickman, le Snape des Harry Potter transformé en père angoissé (à raison) pour sa fille. Il y a quelquefois un peu trop de voix off : il n'est pas toujours forcément nécessaire de tout justifier dans un film. Cela dit, pour la scène où Jean-Baptiste se retrouve dans une grotte et où il ne sent plus rien et se rend compte qu'il n'a pas d'odeur (parceque personne ne l'aime dans la symbologie de l'histoire), évidemment la voix off est plutot indispensable. La scène hyper-casse-gueule où Jean-Baptiste grace à son parfum parfait retourne à son avantage la foule venue voir son exécution (tout le monde a lu le livre alors je peux dire la fin...) et initie une partouze géante passe à peu près correctement.
Je signale l'adresse du film sur IMDB (Internet Movie DataBase), un site qui est une vraie mine d'or par ailleurs: http://french.imdb.com/title/tt0396171/

p53 : y'en a trop ou pas assez

2007-05-19T19:25:00.000Z

Un article de la BBC relayant un article paru dans PLOs Biology.

http://news.bbc.co.uk/2/hi/health/6668727.stm
http://www.plosone.org/article/fetchArticle.action?articleURI=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0000441

C'est finalement une histoire "amusante" quand on y réfléchit qui montre la complexité du processus tumoral et de son traitement. La p53 est en quelque sorte une protéine gardienne du temple qui est activée quand des mutations s'accumulent dans l'ADN, arrête le cycle cellulaire pour permettre des réparations et tue les cellules qui ont des dégats irréparables. p53 est mutée dans près de 50% des cancers, ce qui veut dire que, pour ces cancers, seules les cellules tumorales (qui ont donc accumulées des mutations) qui ont perdu p53 ont pu survivre, sinon ils auraient été éliminées par, justement, la voie de suicide activée par p53. Mais quand on traite le cancer (ici des carcinomes ovariens) par chimiothérapie, les chercheurs se sont rendus compte que la p53 est un obstacle à la mort des cellules cancéreuses !! Les stratégies de chimio aboutissent à bloquer les cellules qui se divisent le plus vite (donc parmis elles les cellules tumorales) pour laisser le temps au système immunitaire de s'en débarasser ou pour éviter les métastases, et aussi à intoxiquer les cellules les plus actives de l'organisme. La p53 semble ici bloquer ce processus, en arrêtant le cycle cellulaire pendant une période où la cellule peut réparer les dégats causés par la chimio, ce qui lui permet de repartir de plus belle ensuite !
D'où l'idée de devoir inhiber la p53 des cellules tumorales pour rendre des chiomiothérapies plus efficaces. Techniquement difficile, et conceptuellement amusant de devoir inhiber une molécule sensée protéger de certains cancers pour combattre d'autres cancers.

Vous reprendrez bien quelques vers ?

2007-05-14T19:25:00.000Z

Quelques commentaires sur deux DVD que j'ai achetés il y a quelques temps déja mais que je revoie avec plaisir : ce sont ceux des séries "Dune" et "Les enfants de Dune". La célèbre saga de Frank Herbert avec son apprenti-messie, ses vers des sables liés à une mystérieuse épice et ses intrigues de palais n'a jamais été aussi fidèlement et aussi magistralement adaptée que dans ces deux séries. Je n'ai pas vu le film de David Lynch du début des années 80 mais il a laissé un souvenir mitigé d'après les commentaires sur la toile. Ici, je pense que tout le monde trouvera son bonheur les spécialistes du genre comme les autres. Car l'histoire de Dune n'est pas tant de la science-fiction qu'un drame shakespearien doublé d'une réflexion sur le rôle de la religion en politique. Et l'épice tant convoitée par tout le monde est évidemment une allégorie du pétrole : "The spice must flow" est la phrase fétiche de tous les protagonistes. Le tout avec des considérations écolos : ça brasse large mais juste.
Et finalement cette série d'une chaine cablée américaine, par son manque de moyen (même si il y a quelques images de synthèse correctes et de magnifiques costumes..., les fameux vers des sables sont assez réussis), limite l'aspect "Star Wars" de l'histoire (Star Wars qui se passe d'ailleurs beaucoup dans un désert aussi...) et développe une vraie psychologie des personnages avec des dialogues excellents et profonds (donc ce n'est pas du "Star Wars"). Les acteurs jouent magnifiquement, notamment celui qui joue Paul Muad'dib (Alec Newman) avec ses faux airs de Sting époque Police (qui joua d'ailleurs dans le film de Lynch) et Ian MacNeice qui joue le méchant Baron Harkonnen (et qu'on retrouve avec plaisir comme crieur public dans "Rome") et qui dit magnifiquement l'une de mes répliques favorites : "Such a beautiful boy !" après avoir assisté au massacre d'un de ses esclaves. Signalons que le tout a été tourné à Prague avec beaucoup d'artistes tchèques qui sont les meilleurs du monde (évidemment...) pour les costumes, les décors, l'éclairage, etc...Coté éclairage, c'est étonnament coloré le réalisateur ayant voulu casser l'aspect ocre-orangé du désert par d'audacieuses touches vertes ou rouges. C'est plutot réussi.

PS (=Post Scriptum) sur les Présidentielles

2007-05-07T13:51:00.000Z

Une étude intéressante de l'IFOP (il y en a) sur les intentions de vote au second tour, le tout relayé par Agoravox dans cette article

http://www.agoravox.fr/article.php3?id_article=23859

Ventilation par classe d’âge du vote Ségolène Royal au 28 avril 2007

18-24 ans : 53%
25-34 ans : 54%
35-49 ans : 56%
50/64 ans : 51%
65 ans et + : 25%

L'allongement de la durée de la vie n'est peut être pas toujours une bonne nouvelle !! Celui qui veut remettre la France au travail a donc été élu grace à ceux qui ne travaillent plus.

Tout va bien...

2007-05-07T09:56:00.000Z

Bon alors, quelques commentaires sur la Présidentielle 2007.
Tout d'abord, rappel historique :
En 81, Mitterrand doit sa victoire à l'absence de soutien de Chirac pour VGE (c'est très clair dans la biographie de Chirac par Patrick Rotman). En 88, Mitterrand doit sa victoire à la nullité de Chirac.
En 95, Chirac doit son élection a son gros mensonge sur la réduction de la fracture sociale et au rejet du Mitterrand-fin de règne (dont Jospin malgré son droit d'inventaire apparait comme l'héritier). En 2002, Chirac doit sa réelection sur la croyance naïve que le tout-répressif va juguler la délinquance.
En 2007, Sarkozy doit son élection à une mystification, à une omerta médiatique, à la division dans les camps de l'adversaire. La mystification : faire croire qu'il est à l'écoute des aspirations des classes populaires et que ses mesures présentées sont sociales. L'omerta : les médias à ses pieds car les principaux propriétaires médiatiques et journalistes sont ses amis. Donc silence radio et télé sur ses contradictions, ses pertes de sang froid répétées dès qu'il n'a plus une caméra braquée sur lui, ses promesses intenables (remplacer qu'un fonctionnaire sur deux partant à la retraite...), ses petits arrangements entre amis (appartement de Neuilly), sa lacheté (je n'attaque jamais "Madame Royal" mais je donne carte blanche à Copé, Hortefeux et acolytes pour le faire). Et la dictature des sondages : même quand il y a un reportage sur Royal, marteler sans cesse qu'elle est distancée dans les sondages, c'est finalement jeter le discrédit sur son programme supposé pas convaincant (je fais exprès de raisonner comme la France qui regarde Pernault et PPDA). Celui qui fait la course en tête gagnerait en sérieux et en légitimité.
La division : la droite UMP-Villiers-FN est relativement soudée idéologiquement, à part sur l'Europe, mais ce dernier sujet est mineur (à tort) dans la tête des gens. L'UMP malgré de très fortes divergences au départ (sarkozystes contre chiraquiens) a fini, comme toujours, par s'aligner comme un seul homme et au pas sur un guide suprême. LeS PS (le PS de DSK, le PS de Fabius et Emmanuelli, le PS de Montebourg) par contre et les autres partis de gauche ont des cultures trop différentes pour pouvoir former un ensemble cohérent et surtout former le grand'écart pour s'allier à l'UDF. D'où la navigation à vue de Ségolène Royal sur les sujets sociaux et économiques, où elle n'avait pas d'autres choix que de rester dans un flou artistique pour ne facher personne, ce qui lui a été fatal notamment lors du duel pour le deuxième tour. Avec le recul (c'est toujours facile après), le meilleur candidat était Strauss-Kahn car il aurait rassembler beaucoup plus de voix bayrouistes en étant plus clair et incisif en matière économique. Et il aurait eu plus de hauteur de vue pour le duel avec Sarkozy et paradoxalement aurait sans doute taper plus fort sur lui sans avoir à entrer dans une "colère" même saine. DSK a l'art de sortir les plus grosses vacheries tout en restant calme et majestueux, c'est une qualité essentielle en politique (cf. Mitterrand). Et quand Royal essaie de la jouer démago (faire racompagner les femmes fonctionnaires le soir), elle trouve toujours plus fort qu'elle sur ce terrain, Sarko est imbattable de ce coté.
Donc au final, Royal continue de s'admirer dans le miroir de la foule qui l'a portée et Sarkozy entame son mandat en allant diner au Fouquet's. Tout va bien...

Bene Bono

2007-04-29T19:39:00.000Z

Malgré quelques fausses notes (l'émotion (et l'age) sans doute), une magnifissime chanson :

http://www.youtube.com/watch?v=QItUmkv7fR4

Plan très impressionant où Bono se balade dans un océan de portables qui le filme. Ca fait longtemps que je ne suis pas allé à un grand concert de rock mais si la grande mode maintenant c'est passer son temps à filmer, autant acheter le DVD.

Les gènes des chimpanzés et nous

2007-04-25T12:33:00.000Z

Un article paru dans la révue PNAS (Bakewell MA et al., 2007) montre que depuis notre séparation avec les chimpanzés il y a 6 millions d'années (ce qui fait seulement 250 000 générations), ce seraient les chimpanzés qui auraient subi plus de sélection naturelle "positive" au niveau des gènes que les humains. Une sélection naturelle "positive" correspond à un changement du code génétique qui aboutit à un changement d'acide aminé dans la protéine correspondante. Les chimpanzés totalisent 233 gènes modifiés (sur 14000 analysés), tandis que nous devons nous contenter de 154 gènes modifiés depuis l'ancêtre commun avec ces charmants cousins. D'où la conclusion que pour faire un humain (avec son gros cerveau, sa bipédie spécialisée...puis son temple d'Angkor et son TGV), il ne faut pas tant de modifications génétiques que cela, ce qui nous donne une petite piqure de rappel de modestie, ça ne fait jamais de mal.
L'étude cependant à des limitations : tout d'abord les changements d'acides aminés peuvent être neutres, sans effet notables sur l'activité de la protéine et fixé par le hasard dans les populations. Ainsi, il y a peut-être plus de modifications chez les chimpanzés mais la part des modifications qui n'ont qu'un effet nul ou mineur pourrait être plus grande que chez les humains. Il pourrait y avoir une objection à cet argument : les populations de chimpanzés jusqu'à une époque récente étaient toujours très grandes et peu fragmentés tandis que les populations humaines et pré-humaines ont sans doute été la plupart du temps faibles et fragmentés (à l'inverse de ces derniers siècles). Donc des sélections par "goulot d'étranglement" de mutations neutres sont plus probables chez les humains que chez nos cousins.
Ensuite, les auteurs se sont intéressés aux séquences codantes des gènes mais les promoteurs sont tout aussi intéressants à étudier, et souvent des modifications considérables peuvent être amenés au cours du développement par des modifications de l'expression spatiale, temporelle et quantitative d'un même gène (par exemple : toute la diversité de taille des becs des pinsons de Darwin dans les Galapagos sont liés à des modifications du promoteur d'un gène qui régule la taille des becs (BMP4 pour les intimes)).
En tout cas, encore un article qui montre que génétiquement nous n'avons rien de spécial dans l'arbre de l'Evolution. Mais qu'en pense Nicolas Sarkozy ?

Segolene 3476890 points

2007-04-19T20:21:00.000Z

A l'approche des élections, un joli article sur Agoravox sur un nouveau mode de scrutin :

http://www.agoravox.fr/article.php3?id_article=22668

Ce nouveau mode sera testé à Orsay, ville où je travaille mais je n'habite pas là (c'est le moins que l'on puisse dire...). C'est une idée émise par des mathématiciens de l'Ecole Polytechnique et du CNRS : il s'agit de donner une note (ou plutot une appréciation de "très bien" à "à rejeter" en passant par "bien" , "passable" etc... qui sera transformée en points) à chacun des candidats; celui qui a le plus de points a gagné en un tour. Je vois des avantages à ce système : cela permet de donner une vision plus juste de ce que pense un électeur. Parmis le spectre des 12 candidats, il y en a que je déteste (et qui sont dangereux pour ce pays), d'autres qui ne me "dérangent" pas (y sont gentils quoi), d'autres que j'aime un peu ou bien ou même beaucoup et qui ont d'ailleurs dans leurs programmes des propositions que j'aurais moi-même faites si j'étais candidat (les grands esprits se rencontrent). En glissant mon bulletin de vote classique dans l'urne près de chez moi dimanche, la subtilité de mes jugements sur les candidats sera réduit à un seul nom, une véritable caricature qui voudra que j'encense une personne et que je voue à la pourriture quinquennale les 11 autres. Le nouveau système évite cela et limite les surprises et les messages de travers : appliqué le 21 Avril 2002, il aurait permis à Jospin d'acquérir la deuxième place, ce qui est sans doute une vision plus juste de ce que les Français collectivement ont vraiment voulu dire ce jour-là.
Le problème c'est que ce système n'arrange pas les grands partis. On n'est pas donc pas près de le voir appliquer. Rendez-vous à la VIIème République !